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SARS相关冠状病毒PPA-ELISA和nest-PCR检测方法的建立及联合应用
作 者: 王淑敏
导 师: 贺建华;顾万军
学 校: 湖南农业大学
专 业: 预防兽医学
关键词: PPA-ELISA SARS抗体 SARS冠状病毒聚合酶基因 巢式PCR
分类号: S854.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2004年
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内容摘要
重症急性呼吸综合症(Severe Acute Respiratory Syndrome,SARS)的病原是SARS冠状病毒(SARS.CoV),为了调查野生动物和家畜家禽体内携带的冠状病毒的情况以及其与SARS.CoV的基因序列同源性,本研究根据SPA能与多种动物血清IgG结合的特性,建立了间接PPA-ELISA检测多种动物血清中SARS病毒相关抗体的方法;根据SARS冠状病毒聚合酶基因序列设计引物,建立套式PCR(nest-PCR)检测方法。对11种动物146个样品进行RT-PCR检测,并用PCR产物测序。与Genbank中的SARS相关冠状病毒的聚合酶基因进行序列比较,构建系统发育树,分析不同宿主来源动物冠状病毒与SARS冠状病毒的同源性。两种检测方法的实验结果表明: SPA与多种哺乳动物血清中的IgG有较好的结合能力,本实验确定了PPA-ELISA的抗原-抗体最佳反应时间,HRP-SPA与抗体反应最佳时间及底物溶液的显色时间,在此基础上,建立了间接PPA-ELISA检测多种动物血清中SARS病毒相关抗体的检测程序。 通过对冠状病毒聚合酶基因的扩增和序列分析,结果表明被检测的动物样品中的冠状病毒聚合酶的保守基因序列与SARS冠状病毒聚合酶的同一位置的基因序列同源性为100%~95.8%。 通过对同一动物的PPA-ELISA和nest-PCR检测表明,两种检测的约为符合率60%~70%,两种方法的同时使用对动物冠状病毒的检测有着重要的参考价值。
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全文目录
前言 8-10 第一部分PPA-ELISA检测动物血清SARS病毒抗体 10-23 1.材料和方法 10-15 1.1 材料 10-11 1.1.1 动物样品的采集的地域与分布: 10 1.1.2 抗原与标准血清 10 1.1.3 主要试剂 10-11 1.1.4 主要设备 11 1.1.5 主要溶液 11 1.2 方法 11-15 1.2.1 SPA与不同种动物血清中IgG结合力特性的研究 11-12 1.2.1.1 包被 11 1.2.1.2 洗涤 11-12 1.2.1.3 封闭 12 1.2.1.4 洗涤 12 1.2.1.5 加SPA-HRP 12 1.2.1.6 显色 12 1.2.1.7 测定OD值 12 1.2.2 间接PPA-ELISA方法的建立 12-13 1.2.2.1 待检血清的最佳稀释度的确定 12 1.2.2.2 封闭液的选择 12-13 1.2.2.3 SPA-HRP合适反应时间的确定 13 1.2.2.4 抗原和抗体结合最佳反应时间的选择 13 1.2.3 PPA-ELISA检测不同动物血清SARS病毒相关抗体的反应程序 13-14 1.2.3.1 抗原的包被 13 1.2.3.2 洗涤 13 1.2.3.3 封闭 13 1.2.3.4 洗涤 13 1.2.3.5 抗原抗体反应 13 1.2.3.6 加SPA-HRP 13-14 1.2.3.7 显色 14 1.2.3.8 测定OD值 14 1.2.3.9 临界值确定 14 1.2.4 间接PPA-ELISA方法与冠状病毒(变异株)IgG抗体检测试剂盒(酶联免疫法)比较试验 14-15 2.结果 15-20 2.1 各种动物血清中IgG与SPA的结合力的研 15-17 2.2 PPA-ELISA工作条件的确定 17-18 2.3 结果判定 18-19 2.4 间接PPA-ELISA方法与冠状病毒(变异株)IgG抗体检测试剂盒(酶联免疫法)比较结果 19-20 3.讨论 20-23 第二部分 动物冠状病毒聚合酶基因的部分序列分析 23-37 1.材料与方法 23-27 1.1 材料 23-24 1.1.1 样品来源 23 1.1.2 主要试剂与试剂盒 23 1.1.3 引物的设计与合成 23-24 1.1.4 主要仪器设备 24 1.2 方法 24-27 1.2.1 总RNA的抽提 24 1.2.2 反转录合成cDNA第一链 24-25 1.2.3 巢式PCR 25-27 1.2.4 1%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物 27 1.2.5 PCR产物的回收 27 1.2.6 PCR产物测序 27 1.2.7 PPA-ELISA与RT-PCR检测结果的比较 27 2.结果 27-36 2.1 11种动物146份样品冠状病毒聚合酶基因Nest-PCR检测结果 27-34 2.2 构建系统发育树 34 2.3 PPA-ELISA与RT-PCR检测比较结果 34-36 3.讨论 36-37 结论 37-38 参考文献 38-41 致谢 41-42 符号表 42-44 作者简历 44-45 在读期间著作、论文及重要技术报告登记 45
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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 动物医学(兽医学) > 兽医临床医学 > 兽医诊断学
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