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4株虎源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的遗传演化分析

作　者: 高婷婷
导　师: 成子强
学　校: 山东农业大学
专　业: 基础兽医学
关键词: H5N1亚型高致病性禽流感病毒虎源基因遗传演化
分类号: S852.65
类　型: 硕士论文
年　份: 2008年
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内容摘要

2004年,从华北某动物园老虎体内分离和鉴定了4株H5N1亚型禽流感病毒(Avian influenza virus, AIV)。致病指数测定结果表明,这4株病毒都是高致病性禽流感病毒(Highly pathogenic avian influenza virus, HP AIV)。用H5N1亚型AIV的特异性引物,成功地扩增出这4株流感病毒的8个基因片段的全序列。与1996～2007年间的其它的H5N1亚型AIV毒株进行比对,HA基因序列分析显示:这4株流感病毒的HA基因的裂解位点处连接肽序列符合H5N1亚型HP AIV的特征:T1毒株裂解位点处连接肽的第3位发生R到G的突变;在受体结合位点(RBS)区域内,4株病毒在98、133、136、137、153、183、186、190、194、226和228位点的氨基酸很保守。在155位上,T2、T3、T4毒株是G,T1毒株为R。NA基因序列分析显示:4株病毒的NA茎部都具有20个氨基酸的缺失。NS基因序列比对表明:4株病毒在NS蛋白氨基酸的80～84位有“AIASS”五个氨基酸缺失。基因遗传进化分析显示:4株病毒位于同一个基因群系,有很高的亲缘关系。与广东鸭源01GD毒株、湖北鸡源04HB毒株、韩国鸡源03Kor毒株具有核苷酸和氨基酸的最高同源性,亲缘关系最近。8段基因序列的遗传进化分析显示:4株毒株是重组病毒。综上,4株病毒均为H5N1高致病性禽流感病毒并且有传播给人的可能,需加以防治。并且4株病毒位于同一分支,均为重组病毒,对于疫苗的开发研究有指导意义。

4株虎源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的遗传演化分析

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