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中国鲽形目鱼类的DNA分子条形码及褐牙鲆的遗传多样性研究

作　者: 杨凡
导　师: 章群
学　校: 暨南大学
专　业: 水生生物学
关键词: DNA条形码 CO1基因线粒体控制区鲽形目褐牙鲆遗传多样性
分类号: S917.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要

本文利用DNA条形码技术对50种鲽形目(Pleuronectiformes)鱼类的分类进行了探讨,采用线粒体控制区(control region)基因序列分析研究了中国近海褐牙鲆(Paralichthys) (olivaceus) 6个地理群体的遗传多样性和遗传结构。主要结果如下：一、测定了鲽形目7科18属31种76尾标本652bp的线粒体COI序列,结合从Genbank下载的与本研究同属或同种的同源序列83条。基于K2P模型的平均种间遗传距离为0.195,除了大牙斑鲆(Pseudorhombus arsiu),眼斑豹鳎(Pardachirrus pavoninus),大口羊舌鲆(Arnoglossus laterna),斑头舌鳎(Cynoglossus puncticeps),东亚单孔舌鳎(Cynoglossus itinus),蛾眉条鳎(Zebrias quagga)外,其它鱼类的种内遗传距大部分为0,平均为0.004,表明CO1序列对鲽形目鱼类鉴定具有很好的区分能力。这6个种内遗传距离偏大的物种全部采自不同地点,由不同的研究者鉴定,说明人为因素会对鉴定结果产生很大的影响。在基于K2P距离的邻接树上,有3个属内的鱼不能被很好的区分,它们是斑鲆属(Pseudorhombus)、舌鳎属(Cynoglossus)和羊舌鲆属(Arnoglossus)内部的鱼类,这3个属内部物种的分类地位需要进一步讨论。角鳎(Aesopia cornuta)和卵鳎(Solea ovata)形态差异明显却聚在一起,其物种有效性值得商榷。结合已报道的核糖体ITS1、线粒体16SrRNA研究报道以及本文结果,支持短吻三线舌鳎(Cynoglossus abbreviatus)和紫斑舌鳎(Cynoglossus purpureomaculatus)可能是同种异名的观点。二、分析了中国近海6个地理群体的107尾褐牙鲆样本,得到了602bp的线粒体控制区5’端序列片段。共检测到104个多态位点,发现66个单倍型,平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)分别为0.986(0.879-0.990)和0.02483(0.01449-0.02603),表明中国近海褐牙鲆群体的具有较高的遗传多样性。AMOVA分析结果显示变异主要来自于种群内。单倍型核苷酸不配对分布(Mismatch)分析呈现单峰及Fu’s Fs (-24.17135, P=0.00)检验表明中国近海褐牙鲆可能经历过种群扩张,扩张时间为56K至144K年前。在邻接树上出现3个谱系分支,各地理群体的单倍型在3个谱系分支中比例相当,说明中国沿海褐牙鲆存在3个进化显著单位,但没有地理结构。建议将遗传多样性水平最高的山东烟台群体作为优先管理保护单位。

中国鲽形目鱼类的DNA分子条形码及褐牙鲆的遗传多样性研究

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