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动物性中药材地龙DNA条形码的初步研究

作　者: 吕国庆
导　师: 姬可平
学　校: 遵义医学院
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 中药材 地龙 DNA条形码 线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ) 16S rRNA基因(16S rDNA)
分类号: R282.5
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要


目的：通过不同方法提取不同来源中药材地龙的基因组总DNA并进行比较,以确定提取中药材地龙DNA提取的最佳方法。以通用引物对不同来源中药材地龙DNA中线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)、16S rRNA基因(16S rDNA)序列进行PCR扩增、测序、序列比对及数据分析,并构建系统进化树,为中药材地龙的种属鉴定提供可参考的分子标记,初步建立动物性中药材地龙的DNA条形码。方法：用三种不同方法对不同来源中药材地龙的基因组总DNA进行提取,筛选出在中药材地龙中最合适的DNA提取方法。用通用引物对中药材地龙的COⅠ、16S rDNA片断进行PCR扩增、测序；运用DNAstar、DNAman、Geneious、Clustal X、MEGA等软件对测序所得碱基序列进行分析,并根据获得的序列构建系统进化树；将获得的中药材地龙CO I、16S rDNA序列提交GenBank中的DNA Barcoding数据库。结果：确定了提取中药材地龙DNA的一种合适方法；优化了中药材地龙DNA中COⅠ和16S rDNA序列PCR扩增的条件;获得了不同来源中药材地龙DNA中COⅠ和16S rDNA碱基序列；并经构建系统进化树,对不同来源的中药材地龙进行了聚类分析；将获得的中药材地龙DNA中COⅠ和16S rDNA序列提交GenBank中的DNA条形码数据库,获得了序列号。结论：所获得的中药材地龙CO I、16S rDNA序列可为动物性中药材地龙的分子水平鉴定提供参考；中药材地龙DNA中COⅠ序列基因多态性比16S rDNA序列更显著,适合做为中药材地龙的DNA条形码；为动物性中药材DNA条形码数据库积累了相关信息数据。

全文目录


英文缩略词表  4-6中文摘要  6-7Abstract  7-9前言  9-13材料与方法  13-18结果  18-26讨论  26-30结论  30-31参考文献  31-34综述  34-42  参考文献  38-42致谢  42-44个人简历  44-45附图  45-54

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中图分类: > 医药、卫生 > 中国医学 > 中药学 > 中药材 > 药材鉴定
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