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维医四种正常体液质人群肠道菌群结构分布特征研究

作　者: 阿孜尔古丽·阿布都克日木
导　师: 德力夏提·依米提
学　校: 新疆医科大学
专　业: 病原生物学
关键词: 维吾尔医学体液质肠道菌群 ERIC-PCR 16SrDNA-PCR-DGGE
分类号: R291.5
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

目的：了解维吾尔医学四种正常体液质人群肠道菌群结构的多样性以及四种体液质之间菌群分布的差异性,比较体液分型之间和菌群的分布可能存在的差异,本研究通过维吾尔医学体液和气质学说将以健康人为研究对象分为四种体液质,从现代分子生物学的角度,应用ERIC-PCR指纹图谱技术及变性梯度凝胶电泳(DGGE)指纹图谱技术对维吾尔医学正常四种体液质人群肠道菌群分布状况进行分析比较。方法：①对206例健康人进行维吾尔医学体液分型,其中血液质(53人),粘液质(51人),胆液质(50人)和黑胆质(52人)采集受检者粪便样品,提取总DNA,以此作为模板获得反映肠道菌群组成的ERIC-PCR指纹图谱；计算各样本多样性指数和群落相似性系数,得到四种正常体液质人肠道菌群分布的相似性与多样性。②对四种体液质受检者粪便样品提取细菌总DNA,针对16S rDNA的V6～V8可变区设计一对通用引物并扩增该区,用PCR产物进行DGGE,得到反映肠道菌群结构特征的DNA指纹图谱进行比较分析,条带回收、克隆、序列测定。结果：①ERIC-PCE指纹图谱血液质组样品条带数显著多于其他三组(P<0.05),粘液质组样品条带数少于其他3组(P<0.05)血液质组肠道菌群结构较其他各组具有更丰富的多样性(P<0.05),粘液质组菌群结构多样性相对较低(P<0.05)②PCR-DGGE指纹图谱血液质组样品条带数显著多于其他三组(P<0.05),粘液质组样品条带数少于其他3组(P<0.05)③各组内出现频率多的能代表各组样品的条带测序鉴定在Genebank数据库上Blast程序进行比对,并做出进化树。结论：①维医4种正常体液质人群肠道菌群菌种和分布结构存在一定程度的差异。②初步构建维医四种正常体液质人群肠道菌群的进化树。

全文目录

摘要  7-8
Abstract  8-10
前言  10-12
研究内容与方法  12-22
  1 实验材料  12-15
  2 实验方法  15-22
    2.1 研究对象  15-16
    2.2 细菌基因组总DNA的提取  16-17
    2.3 ERIC-PCR指纹图谱分析  17
      2.3.1 ERIC-PCR扩增  17
      2.3.2 电泳成像  17
    2.4 16S rDNA V6-V8可变区PCR扩增  17-18
    2.5 DGGE指纹图谱分析  18-20
      2.5.1 制备DGGE变性胶的步骤  18
      2.5.2 DGGE上层胶的制备  18-19
      2.5.3 电泳  19
      2.5.4 DGGE胶的染色  19
      2.5.5 条带的回收、测序  19-20
    2.6 统计分析  20-22
结果  22-29
讨论  29-36
小结  36-37
致谢  37-38
参考文献  38-45
附录  45-61
综述  61-67
  参考文献  64-67
攻读硕士学位期间发表的学术论文  67-68
导师评阅表  68

维医四种正常体液质人群肠道菌群结构分布特征研究

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