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XRCC1基因多态性与贲门癌发病风险的关联研究

作　者: 段亚男
导　师: 李琰
学　校: 河北医科大学
专　业: 肿瘤学
关键词: 贲门癌 X-射线交错互补修复基因1 单核苷酸多态性 遗传易感性
分类号: R735.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要


目的:环境致癌物及/或机体代谢产物攻击细胞时,可以起DNA损伤,生物体能够保持遗传信息的完整和稳定,主要依赖体内一系列DNA修复系统。X-射线交错互补修复基因1(X-ray repair cross complementing gene 1, XRCC1)是一种DNA损伤修复基因,它编码的蛋白质在碱基切除修复和DNA单链断裂修复过程中都发挥重要作用。XRCC1基因多态性可导致DNA损伤修复能力的个体差异,从而影响个体的肿瘤易感性。本研究旨在探讨XRCC1基因Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms, SNPs)与贲门癌(gastric cardiac adenocarcinoma, GCA)遗传易感性的关系。方法:采用基于医院的病例-对照研究方法,收集455例贲门癌患者和650例健康对照个体的静脉抗凝血5ml,同时记录其病史、个人相关资料及上消化道肿瘤家族史。以蛋白酶K消化-饱和氯化钠盐析法提取外周血白细胞DNA,采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)-限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism analysis, RFLP)方法分别对XRCC1 Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln三个SNP位点进行基因分型。数据统计分析采用SPSS11.5版软件包(SPSS Company, Chicago, Illinois, USA)进行,P<0.05认为有统计学意义。病例组与对照组的年龄差异行t检验。用卡方检验比较基因频率的观察值与预期值,并进行Hardy-Weinberg平衡分析。病例组与对照组的基因型分布比较采用行×列表卡方检验。以非条件Logistic回归法计算经年龄、性别校正的相对风险度比值比(odds ratio, OR)及其95%可信区间(confidence interval, CI)。单体型频率及连锁不平衡分析采用EH软件(1.2 version, Rockefeller University, New York)。结果1.健康对照组中的XRCC1第6外显子Arg194Trp,第9外显子Arg280His,第10外显子处Arg399Gln三个多态位点的基因型分布频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。2. XRCC1基因Arg194Trp多态Arg、Trp等位基因频率在GCA组和对照组分别为67.6%、32.4%和68.8%、31.2%,两组相比无显著差异(P>0.05);Arg/Arg、Arg/Trp、Trp/Trp基因型频率分布在GCA(47.5%, 40.2%和12.3%)和对照组(48.8%, 40.2%和11.0%)间也无差异(P>0.05);与Arg/Arg基因型相比,Arg/Trp和Trp/Trp基因型不增加GCA的发病风险,OR值分别为1.02(95%CI=0.79~1.32)和1.13(95%CI=0.76~1.68)。根据个体吸烟状况以及上消化道肿瘤(upper gastrointestinal cancer, UGIC)家族史分层分析的统计学结果均未发现XRCC1基因Arg194Trp SNP与GCA发病风险有明显的相关性。3. XRCC1基因Arg280His多态Arg、His等位基因频率在GCA组和对照组分别为89.3%、10.7%和90.5%、9.5%,两组相比无显著差异(P>0.05);Arg/Arg、Arg/His、His/His基因型频率分布在GCA(79.6%, 19.6%和0.9%)和对照组(82.0%, 16.9%和1.1%)间也无差异(P>0.05);与Arg/Arg基因型相比,携带His等位基因个体不增加GCA的发病风险(OR=1.14, 95%CI=0.84~1.55)。根据个体吸烟状况分层分析发现,与Arg/Arg基因型相比,携带His等位基因(Arg/His+His/His)可能增加吸烟个体GCA的发病风险(OR=1.57, 95%CI=1.00~2.52)。根据UGIC家族史分层分析的统计学结果未发现XRCC1基因Arg280His SNP对GCA发病风险的影响。4. XRCC1基因Arg399Gln多态Arg、Gln等位基因频率在GCA组和对照组分别为74.0%、26.0%和73.8%、26.2%,两组相比无显著差异(P>0.05);Arg/Arg、Arg/Gln、Gln/Gln基因型频率分布在GCA(53.0%, 42.0%和5.0%)和对照组(53.1%, 41.5%和5.4%)间也无差异(P>0.05);与Arg/Arg基因型相比,Arg/Gln和Gln/Gln基因型与GCA的发病风险没有明显的相关性,OR分别为值为0.80(95%CI=0.60~1.06)和1.31(95%CI=0.74~2.33)。根据个体吸烟状况以及UGIC家族史分层分析的统计学结果均未发现XRCC1基因Arg399Gln SNP对GCA发病风险的影响。5.应用EH软件对XRCC1基因Arg194Trp、Arg280His、Arg399Gln三个SNP位点进行的联合分析显示,CGG、TGG、CGA、CAG是最常见的四种单倍体型。单体型分布在GCA患者组与健康对照组间无显著性差异(P>0.05)。与CGG单体型相比,其他单体型与GCA的发病风险无关。结论1.本研究结果提示XRCC1基因Arg194Trp、Arg399Gln多态位点可能与GCA的发病风险无关。2. XRCC1基因Arg280His多态位点虽然与贲门癌的发病风险无关,但分层分析显示280His等位基因型可能增加吸烟人群GCA的发病风险。3. XRCC1基因Arg194Trp、Arg399Gln、Arg280His三个多态性位点的单倍体型分布可能与GCA的发病风险无关。

全文目录


中文摘要  4-8
英文摘要  8-13
研究论文 XRCC1 基因多态性与贲门癌发病风险的关联研究  13-48
  前言  13-14
  材料与方法  14-20
  结果  20-24
  附图  24-28
  附表  28-34
  讨论  34-41
  参考文献  41-48
综述  48-67
致谢  67-68
个人简历  68-69

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中图分类: > 医药、卫生 > 肿瘤学 > 消化系肿瘤 > 胃肿瘤
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