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猴头菌属的系统分类及栽培猴头菌株的遗传多样性研究

作 者: 王俊
导 师: 图力古尔
学 校: 吉林农业大学
专 业: 菌类作物
关键词: 食用菌 形态 分子系统学 猴头菌 菌株 ITs IRAP
分类号: S646
类 型: 硕士论文
年 份: 2011年
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内容摘要


本论文主要研究我国猴头菌属真菌的分类,对猴头菌属每个种进行详细的形态特征描述并绘制线条图,通过分子生物学研究方法构建出猴头菌属系统树,为确立该属物种的分类地位及亲缘关系提供依据。综合形态学和分子系统学分析猴头菌属的分类学和系统学问题。另外,针对国内猴头菌市场存在的引种混乱等问题,对国内各地栽培的猴头菌株作了遗传特性分析。形态学研究采用传统形态学分类方法对猴头菌属进行研究,结果将我国的猴头菌属真菌分为3种:猴头菌[H. erinaceus (Bull.:Fr.) Pers.]、珊瑚状猴头菌[H. coralloides (Scop. Fr.) Pers. ex Gray]和冷杉猴头菌[H. abietis (Wei:Hubert) K. Harrison]。将小刺猴头菌[Hcaput-medusae (Bull. Fr.) Pers.]并入猴头菌[H. erinaceus (Bull.:Fr.) Pers.],粗枝猴头菌[Hcaput-ursi (Fr.) pers.]、分枝猴头菌[H. ramosum (Bull.:Merat) Lettllier]、假猴头菌[Hlaciniatum (Leers) Banker]更正为珊瑚状猴头菌[H. coralloides (Scop. Fr.) Pers. ex Gray]。其中猴头菌担子果不分枝,多晚秋发生;珊瑚状猴头菌担子果为珊瑚状分枝,刺长而柔软,油囊体稍尖呈节状,多夏秋季发生;冷杉猴头菌担子果多次紧密复杂的分枝,刺小而短,囊状体圆柱形,多夏秋季发生。分子系统学研究利用现代分类学研究方法,基于DNA-ITS序列:18份材料聚类分析后得到种间遗传相似系数范围为0.018-0.453,利用ITS方法得到的结果与传统分类学方法得到的结论相一致。从所构建的系统发育树结果得出:冷杉猴头菌与猴头菌的亲缘关系较珊瑚状猴头菌的亲缘关系要近,小刺猴头菌在系统发育树中位于猴头菌的一个小支上,支持了形态学将小刺猴头菌归为猴头菌的分类结果。利用内部转录间隔区序列(ITS)分析技术和反转录转座子间扩增多态性(IRAP)技术分析了我国猴头菌34份栽培菌株间的遗传差异,为猴头菌的种质资源鉴定、品种选育提供分子生物学依据,同时也为猴头菌不同产地的栽培菌株的亲缘关系提供了科学依据。结果发现,得到的34份栽培种ITS序列通过与Genbank中的猴头菌已有序列比对,相似度均达到98%以上,可以确定所有菌株均为猴头菌,不存在混种现象。根据ITS所构建的系统发育树可看出,国内栽培菌株种间差异不明显,遗传多样性较单一。通过IRAP分析得出:IRAP引物在不同的样本间表现出丰富的多样性,在700bp和1500bp处各有一条共有序列,可作为鉴定猴头菌的特征性序列。综合两种分析方法后得出:34份猴头菌菌株间具有一定的遗传学差异,但相似性极高,表明我国猴头菌栽培菌株间的遗传背景较单-

全文目录


摘要  4-5
Abstract  5-9
第一章 前言  9-16
  1 猴头菌属的研究概况  9-13
    1.1 猴头菌属概况  9
    1.2 分类学研究进展简史  9-11
      1.2.1 国外研究  9-10
      1.2.2 国内研究  10-11
    1.3 猴头菌属分子系统学研究进展概述  11-13
      1.3.1 真菌分子系统学研究方法  11-12
      1.3.2 猴头菌属的分子系统学研究  12-13
  2 猴头菌的研究进展  13-15
    2.1 猴头菌的主要特征与地理分布  13
    2.2 猴头菌的经济价值  13-14
    2.3 猴头菌的生物学特性  14-15
  3 本研究的目的及意义  15-16
第二章 猴头菌属分类学研究  16-21
  1 研究材料  16
  2 研究方法  16
    2.1 野外调查和标本采集  16
    2.2 标本观察  16
  3 形态分类结果  16-21
    3.1 猴头菌属的形态学描述  16-20
    3.2 小结  20-21
第三章 分子系统学研究  21-29
  1 实验材料  21-22
  2 试验方法  22-23
    2.1 引物及序列  22
    2.2 DNA提取  22
    2.3 基因组DNA的检测  22-23
      2.3.1 制胶  22-23
      2.3.2 点样  23
      2.3.3 电泳  23
      2.3.4 照相  23
      2.3.5 PCR扩增及产物纯化  23
      2.3.6 系统进化树的构建与分析  23
  3 结果与分析  23-28
    3.1 猴头菌属的ITS-PCR扩增电泳检测结果与分析  23-24
    3.2 猴头菌属的序列比对结果  24-25
    3.3 猴头菌属的系统发育研究  25-28
  4 小结  28-29
第四章 我国栽培猴头菌的遗传多样性分析  29-38
  1 实验材料  29
    1.1 供试菌株  29
    1.2 培养基  29
  2 实验方法  29-32
    2.1 菌丝体制备  29
    2.2 基因组DNA提取  29
    2.3 PCR扩增与检测  29-31
      2.3.1 ITS-PCR扩增体系及反应条件  29-31
      2.3.2 IRAP-PCR扩增体系及反应条件  31
    2.4 数据处理  31-32
      2.4.1 基于ITS序列构建系统树与分析  31
      2.4.2 IRAP多态性统计分析  31-32
  3 结果与分析  32-37
    3.1 猴头菌各栽培菌株的ITS序列分析研究结果  32-33
    3.2 IRAP研究结果  33-35
      3.2.1 IRAP-PCR检测  33-34
      3.2.2 多态性标记的聚类结果  34-35
    3.3 基于ITS和IPAP分析方法的综合分析结果  35-37
  4 小结  37-38
第五章 结论与展望  38-40
  5.1 结论与讨论  38-39
    5.1.1 猴头菌属的系统分类  38
    5.1.2 猴头菌栽培菌株间遗传多样性  38-39
  5.2 本研究中存在的不足与展望  39-40
参考文献  40-43
附录1:子实体显微结构线条图  43-46
附录2:子实体生境照片  46-47
附录3:分子生物学实验常用试剂的配制  47-48
附录4:实验获得的DNA序列  48-62
致谢  62-63
作者简历  63

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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 蔬菜园艺 > 菌类(食用菌)
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