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缓步动物条形码及7种缓步动物系统发育研究

作　者: 王广明
导　师: 李晓晨
学　校: 陕西师范大学
专　业: 水生生物学
关键词: 缓步动物 COⅠ基因 DNA条形编码系统发育
分类号: Q951.3
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

缓步动物(Tardigrade)属于微小水生无脊椎动物,以隐生现象著称,在系统分类上为一个独立的门,即缓步动物门(Tardigrada),分成3纲、5目、13科、100属、近1300种。大多数生物学家认为缓步动物应该单列为一个独立的门。分子生物学技术对其18SrRNA的研究表明,缓步动物与节肢动物的亲缘关系最近,二者互为姊妹群体,由于蜕皮机制建立,使得它们在系统进化树上组成一类蜕皮动物。缓步动物两侧对称,有4对足,足的末端有爪,体长250-500/μm。具备比较完善的神经系统、消化系统以及繁殖系统,其呼吸与循环依靠发达体腔来完成。缓步动物多数是陆生种类,一般生活在潮湿苔藓、地衣、土壤、落叶及垫状的开花植物上。缓步动物能在极端恶劣的环境条件下存活,以其独特的隐生现象著称。高压、失水、低温和缺氧等都能使缓步动物步入隐生状态,包括高压隐生、低湿隐生、低温隐生与低氧隐生等四种形式,以帮助其度过不良环境。缓步动物的形态学分类鉴定的主要依据包括表皮、腿部、爪、口器复合物、吸咽、头部附属物、生殖结构及卵等的特点。DNA条形码技术是以一段标准DNA片段为工具进行物种鉴定的技术。目前进行的DNA条形码工作中常用基因片段有18S rRNA和16S rRNA、12S rRNA基因及细胞色素C氧化酶亚基I (Cytochrome C oxidase subunit I, CO I)。和rRNA基因相比,COⅠ基因有以下优点：保守性好且有一定的变异,基因序列长度适于通用引物扩增。综基因序列长度适于通用引物扩增。综合基因序列进化速率与长度方面的考虑,本实验选定COⅠ基因作为条形码标准片段。本实验对4种缓步动物11个个体的COⅠ基因序列进行提取测定和分析,并与GenBank中下载的6种缓步动物19条COⅠ基因序列进行比对分析,用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最大似然法(ML)与贝叶斯法(BI)构建系统发育树,研究了共计7种缓步动物30个个体之间的系统发育关系。结果表明,这几种缓步动物在DNA分子水平的分类与形态学分类结果基本一致。

全文目录

摘要  3-4
abstract  4-7
第一部分文献综述  7-28
  1 DNA条形码技术  7-17
    1.1 DNA条形码技术研究的发展历史  7-9
    1.2 DNA条形码研究的原理及其所基于的COⅠ基因的选择  9-10
    1.3 DNA条形码的工作流程及分析方法  10-11
    1.4 DNA条形码技术的优势  11-12
    1.5 DAN条形码研究进展  12-15
    1.6 关于DNA条形码的争论  15-16
    1.7 前景展望  16-17
  2 分子系统学  17-20
    2.1 基本原理  17
    2.2 系统树  17-18
    2.3 分子系统树的构建  18-20
  3 缓步动物  20-26
    3.1 缓步动物的发现  21-22
    3.2 缓步动物的结构  22-23
    3.3 缓步动物的生殖  23
    3.4 缓步动物隐生现象  23-24
    3.5 缓步动物分类  24-25
    3.6 缓步动物的分子生物学研究  25-26
  4 条形码技术在缓步动物方面的研究  26-28
第二部分研究报告  28-49
  1 材料和方法  28-32
    1.1 实验材料  28
    1.2 实验方法  28-31
    1.3 数据处理分析  31-32
    1.4 系统发育分析  32
  2 结果  32-47
    2.1 测序结果  32-39
    2.2 序列组成  39
    2.3 替换饱和性分析  39-40
    2.4 系统发育信号分析  40-41
    2.5 系统发育分析结果  41-47
  3 讨论  47-48
  4 结论  48-49
参考文献  49-57
致谢  57-58
攻读硕士学位期间的研究成果  58

缓步动物条形码及7种缓步动物系统发育研究

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