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江西省淡水蟹类多样性及其基于16S rDNA初步探讨三种华溪蟹的遗传变异
作 者: 石林波
导 师: 周宪民
学 校: 南昌大学
专 业: 病原生物学
关键词: 淡水蟹类 多样性 遗传分化 16S rDNA基因 江西省
分类号: S917.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
下 载: 52次
引 用: 2次
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内容摘要
目的:本文对近10年来在江西省采集的600余份淡水蟹类标本进行鉴定,结合已有的文献资料,对江西省淡水蟹物种多样性和动物地理区划作一完整的整理与探讨,并由此建立江西省淡水蟹类总科及科与属的分类检索表。同时采用16S rDNA基因部分序列分析Sinopotamon属S.jianglenses、S.xiusuiense、S.fukienense三种华溪蟹之间的遗传分化,以初步探讨江西省淡水蟹遗传结构与其地理分布格局的形成机制。方法:在与模式标本(Holotype)比对的基础上,对淡水蟹标本进行分类与鉴定;测定S.jianglenses、S.xiusuiense、S.fukienense三种华溪蟹共35个样本的16S rDNA基因部分序列,利用DnaSp4.0软件计算遗传多样性和分化参数,用MEGA4.0构建分子系统发育树。结果:就目前调查而言,江西省淡水蟹共2科4属35种淡水蟹,其中21种为本省特有种,占总物种的60%。结合戴爱云对中国淡水蟹的动物地理区划,将江西省淡水蟹进行了动物地理分区,划分为四个动物地理省:赣西北-西南山地丘陵省(Ⅰ),共有3属19种淡水蟹,占总物种数的54%;赣东南山地丘陵省(Ⅱ),共有3属22种淡水蟹,占总物种数的63%;赣东北山地丘陵省(Ⅲ),共有4属14种淡水蟹,占总物种数的40%;将位于华南区、闽粤赣亚区内的江西省部分命名为赣南山地省(Ⅳ),共有2属(Sinopotamon、Somanniathelphusa)8种淡水蟹,占总物种数的23%。各动物地理省淡水蟹的组成和种类存在差异,并有各自的特有种。同时,分子生物学结果显示三种华溪蟹之间高度分化,没有基因交流。重建的系统发生显示它们各自形成独立的分支,这与形态学鉴定结果基本一致。结论:分析江西省境内淡水蟹多样性高及其高度分化的原因,可能是地理隔离、遗传漂变、生殖隔离和生境异质性等多种因素共同作用的结果。
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全文目录
摘要 3-4 ABSTRACT 4-6 第1章 引言 6-10 第2章 江西省淡水蟹的多样性 10-23 2.1 研究对象 10 2.2 实验方法 10 2.3 实验结果 10-21 2.3.1 江西省淡水蟹的种群归纳 10-12 2.3.2 江西省Sinopotamon属的地理分布 12-14 2.3.3 江西省Somanniathelphusa属的地理分布 14-15 2.3.4 江西省淡水蟹的特有种 15-16 2.3.5 江西省淡水蟹的动物地理学意义 16-20 2.3.6 江西省淡水蟹类总科及科与属的检索表 20-21 2.4 讨论 21-23 第3章 基于 16S rDNA 初步探讨三种华溪蟹的遗传分化 23-30 3.1 材料与方法 23-25 3.2 数据处理 25 3.3 结果与分析 25-28 3.3.1 三种华溪蟹16S rDNA基因片段碱基组成 25-26 3.3.2 三种华溪蟹的遗传多样性及遗传分化 26-27 3.3.3 基于16S rDNA 三种华溪蟹的分子进化树 27-28 3.4 讨论 28-30 第4章 结论 30-31 致谢 31-32 参考文献 32-36 攻读学位期间的研究成果 36-37 附带综述 37-47
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中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产基础科学 > 水产生物学 > 水产动物学
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