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樟科和忍冬科的DNA条形码筛选研究

作　者: 刘震
导　师: 陈科力
学　校: 湖北中医药大学
专　业: 中药学
关键词: DNA条形码 樟科 忍冬科 psbA-trnH matK rbcL ITS2
分类号: R284
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要


目的：通过对四条不同的DNA片段(psbA-trnH,matK,rbcL,和ITS2)进行筛选,寻找适合樟科和忍冬科植物鉴定的DNA条形码序列。方法：使用psbA-trnH、rbcL、matK和核ITS2的通用引物对樟科和忍冬科植物进行PCR扩增和测序,比较各序列扩增和测序效率、种内和种间变异,进行barcoding gap分析,采用BLAST1和Nearest Distance方法评价不同序列的鉴定能力。结果：所采集试验样本及拓展分析数据相结合,使用BLAST1的方法对樟科植物35个属,117物种,175样本的研究发现,psbA-trnH序列在樟科植物中的鉴定成功率在种水平上为84.0%,属水平上为92.3%。而在忍冬科13个属32个物种54个样本中,ITS2的鉴定成功率最高,物种水平上为96.3%,属水平为100%。结论：叶绿体间隔区psbA-trnH序列可以作为樟科植物的DNA条形码候选序列,而ITS2序列可以作为忍冬科DNA条形码的候选序列,同时我们推荐psbA-trnH序列作为忍冬科植物DNA条形码鉴定的补充序列。

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中图分类: > 医药、卫生 > 中国医学 > 中药学 > 中药化学
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