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山羊GnIH基因SNP的研究及其与产羔数的关联分析

作　者: 严妍
导　师: 曹斌云
学　校: 西北农林科技大学
专　业: 养殖
关键词: 山羊 GnlH基因 产羔数 SNP
分类号: S827
类　型: 硕士论文
年　份: 2013年
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内容摘要


以分子标记为支撑的育种技术能直接在DNA水平上对产羔性状的基因型进行选择,这种方法不仅克服了常规育种准确性低的缺点,还有效提高了育种效率。在DNA水平上寻找与产羔性状紧密连锁的分子标记,研究优良基因的功能,将现代分子育种技术与常规育种技术有机结合,是山羊育种的发展趋势。本研究以陕西萨能奶山羊繁育中心、陕西布尔山羊繁育中心和陕西绿色世纪生物开发有限公司羊场中具有4胎产羔记录的287只西农萨能奶山羊和110只布尔山羊为研究材料,选用促性腺激素抑制激素基因(Gonadotropin-Inhibitory Hormone, GnIH)为研究对象,采用PCR-RFLP和DNA测序技术研究该基因在布尔山羊、西农萨能奶山羊中的SNPs及其与产羔数的相关性,并进行生物信息学分析,研究GnIH基因多态性对产羔数的影响。主要研究结果如下：1、针对GnIH基因的设计了7对引物,发现引物P1、P5和P7的扩增片段中存在多态位点。2、P1的多态位点(g.265C>G)位于第一个内含子上,且分别在西农萨能奶山羊和布尔山羊中都检测到CC、CG和GG三种基因型。在西农萨能奶山羊中,CC基因型个体平均产羔数显著高于CG基因型和GG基因型(P<0.05),而CG基因型个体的第1胎产羔数与GG基因型个体差异不显著(P>0.05),却在第2胎、第3胎和第4胎中产羔数均显著高于GG基因型个体(P<0.05)：在布尔山羊中,GG基因型个体的第1胎产羔数显著高于CC基因型个体和CG基因型个体(P<0.05),而CG基因型个体在第2胎、第3胎的产羔数显著高于CC基因型个体和GG基因型个体(P<0.05)。3、P5的多态位点(g.1987G>A)位于第二个外显子上,在西农萨能奶山羊和布尔山羊中检测到AA、AG和GG三种基因型,但AA基因型个体、AG基因型个体和GG基因型个体在前4胎的产羔数均差异不显著(P>0.05)。4、P7的多态位点(g.3665C>T)位于第二个内含子上,在西农萨能奶山羊中,TC基因型个体和TT基因型个体在前4胎的产羔数差异不显著(P>0.05)：在布尔山羊中,TT基因型个体在第3胎和第4胎的产羔数显著高于TC基因型(P<0.05)。

全文目录


摘要  6-7
ABSTRACT  7-11
第一章 西农萨能奶山羊和布尔山羊的研究概况  11-14
  1.1 西农萨能奶山羊  11-12
  1.2 布尔山羊  12-14
第二章 山羊繁殖性状基因多态性研究进展  14-21
  2.1 山羊繁殖性状基因多态性研究意义  14-15
  2.2 分子遗传标记在动物遗传育种中的应用研究  15-16
  2.3 几类常用分子标记的原理和特点  16-17
    2.3.1 限制性片段长度多态性  16
    2.3.2 DNA可变串联重复数标记  16
    2.3.3 随机扩增多态性DNA  16
    2.3.4 酶切扩增多态性  16-17
    2.3.5 扩增片段长度多态性  17
    2.3.6 简单重复序列  17
  2.4 分子标记技术在动物遗传育种中的应用  17-18
    2.4.1 动物品种、品系和类群的鉴定  17-18
    2.4.2 QTL主基因的定位与遗传图谱的构建  18
    2.4.3 动物遗传标记辅助选择  18
    2.4.4 动物杂种优势预测  18
  2.5 山羊繁殖性状的分子标记研究  18-21
    2.5.1 FecB基因  19
    2.5.2 FecX基因  19-20
    2.5.3 FSHR基因  20-21
第三章 GnIH基因的研究进展  21-23
  3.1 GnIH的发现  21-22
  3.2 GnIH的生理功能  22-23
第四章 山羊GnIH基因SNP分析及其与产羔性状的关系  23-37
  4.1 材料方法  23-28
    4.1.1 试验动物  23
    4.1.2 主要试剂  23-24
    4.1.3 溶液的配置  24
    4.1.4 仪器设备  24-25
    4.1.5 基因组DNA的提取及检测  25
    4.1.6 DNA的凝胶回收  25
    4.1.7 引物设计、PCR和酶切反应  25-26
    4.1.8 酶切产物检测  26
    4.1.9 核酸和蛋白序列分析  26-27
    4.1.10 数据统计与分析  27-28
  4.2 结果与分析  28-35
    4.2.1 奶山羊基因组DNA的检测  28
    4.2.2 GnIH基因的PCR扩增结果  28-30
    4.2.3 奶山羊GnIH基因的SNPs检测  30-31
    4.2.4 GnIH基因不同基因型的测序图及序列分析  31-33
    4.2.5 GnIH基因SNP位点的遗传结构  33-34
    4.2.6 GnIH基因与山羊产羔数的相关分析  34-35
  4.3 讨论  35-37
结论  37
进一步研究的问题  37-38
参考文献  38-42
附录  42-45
致谢  45-46
作者简介  46

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 > 山羊
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