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11个微卫星和BMP15外显子在两个山羊品种中遗传多样性研究

作　者: 张娜娜
导　师: 王清义；王玉琴
学　校: 河南科技大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 微卫星标记 BMP15 遗传多样性 山羊 产羔数 生长发育
分类号: S827
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
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内容摘要


通过微卫星标记和BMP15外显子2在两个地方山羊品种(伏牛白山羊和太行黑山羊)中进行遗传多样性研究及其与生长发育和产羔性能的相关研究,为地方山羊品种的生产、选种选育和保种工作奠定基础。本研究选取位于绵羊第6号染色体上与高繁殖力主效基因FecX和FecB紧密连锁的7个微卫星基因座(TGLA68、OarAE101、BM1329、LSCV043、BM143、OarHH55、GC101)和第3号染色体上的微卫星基因座BMS1248、第4号染色体上的两个微卫星基因座MAF70、OarHH35及第8号染色体上的微卫星基因座BM1227,对地方山羊进行遗传多样性研究,结果表明:11个微卫星基因座在2个山羊品种中共观察到等位基因数为175个,平均等位基因数为7.95个。表明微卫星基因座均具有高度多态性,可用于遗传多样性的分析研究。11个微卫星基因座的平均有效等位基因数、平均遗传多态信息含量、平均遗传杂合度在伏牛白山羊中分别为5.6083、0.7940和0.8171;在太行黑山羊中分别为5.7022、0.7886和0.8173。利用最小二乘分析法,通过微卫星基因座对2个山羊品种的产羔数和生长发育进行相关分析,发现基因座中OarAE101的基因型BB (110/110bp)、OarHH55的基因型CG(125/150bp)、BM1329的基因型BE(147/160 bp)为伏牛白山羊中与产羔数相关的优势基因型,OarAE101中的等位基因B(110bp)、OarHH55中的等位基因G(150bp)、BM1329中的等位基因B(147bp)可作为与产羔数相关的优势等位基因;发现BMS1248、MAF70的相关基因型与2个品种主要生长性能如体重、体高、体长呈正相关。通过PCR-SSCP方法利用BMP15基因外显子2在两山羊品种中的遗传多态性进行检测。结果表明:BMP15基因外显子2在伏牛白山羊中发现有AA、AB、BB三种基因型,基因型频率分别为0.130、0.783和0.087;在太行黑山羊中检测到AB、AA两种基因型,基因型频率分别为0.070和0.930。利用最小二乘法,研究BMP15基因对产羔性状的影响,结果表明在伏牛白山羊中基因型AB的产羔数最高(2.42/胎),与其他基因型相比差异显著(P<0.05)。AB型在太行黑山羊中的产羔数最高(1.70/胎),与AA基因型相比差异不显著(P>0.05)。测序分析发现在伏牛白山羊中的AB基因型在第465、466、510、511的碱基位置处分别发生T→G、C→G、C→T、T→C的碱基改变,导致第155位氨基酸由缬氨酸(Val)改变为甘氨酸(Gly),第171位氨基酸由丝氨酸(Ser)改变为脯氨酸(Pro)。在太行黑山羊中没有检测到突变位点。试验初步研究了两个地方山羊品种的微卫星标记和BMP15基因外显子遗传多态性及其与生长发育和繁殖性能的关系,为标记辅助选择在山羊生产上的进一步应用提供必要信息。

全文目录


摘要  2-4
ABSTRACT  4-8
第1章 综述部分  8-18
  1.1 山羊品种资源概况  8-9
    1.1.1 伏牛白山羊的资源概况  8
    1.1.2 太行黑山羊的资源概况  8-9
  1.2 微卫星标记研究  9-15
    1.2.1 生物多样性研究方法  9-10
    1.2.2 微卫星产生的原理、机制及其特征  10-11
    1.2.3 微卫星标记在家畜遗传育种研究中的应用  11-12
    1.2.4 微卫星标记的研究进展  12-14
    1.2.5 微卫星标记的应用前景  14-15
  1.3 候选基因BMP15  15-17
    1.3.1 主效基因的概念  15
    1.3.2 BMP15 基因的研究进展  15-16
    1.3.3 PCR-SSCP 标记  16-17
  1.4 本研究的目的意义  17-18
第2章 微卫星标记对两个山羊品种的遗传多样性研究  18-72
  2.1 材料和方法  18-27
    2.1.1 试验材料  18-20
    2.1.2 实验方法  20-23
    2.1.3 微卫星凝胶电泳  23-25
    2.1.4 统计分析  25-27
  2.2 结果与分析  27-65
    2.2.1 微卫星基因座的电泳结果图  27-34
    2.2.2 微卫星的遗传多样性分析  34-65
  2.3 讨论  65-71
    2.3.1 关于样本数量分析  65-66
    2.3.2 影子带的分析  66
    2.3.3 等位基因数量分析  66-67
    2.3.4 PCR 反应条件和凝胶电泳及染色  67
    2.3.5 遗传多样性分析  67-69
    2.3.6 微卫星标记与山羊产羔数的关系  69-70
    2.3.7 微卫星标记与山羊生长发育的关系  70-71
  2.4 结论  71-72
第3章 BMP15 外显子2 部分编码区遗传多样性检测  72-82
  3.1 材料与方法  72-74
    3.1.1 试验材料  72-73
    3.1.2 试验方法  73-74
    3.1.3 统计分析  74
  3.2 结果与分析  74-78
    3.2.1 BMP15 基因遗传多样性分析  74-75
    3.2.2 BMP15 外显子2 对山羊产羔数的影响  75
    3.2.3 BMP15 外显子2 的 SSCP 结果电泳图  75-77
    3.2.4 BMP15 外显子2 测序结果  77-78
  3.3 讨论  78-80
    3.3.1 BMP15 基因遗传多态性  78-79
    3.3.2 BMP15 基因与繁殖性能的关系  79
    3.3.3 PCR-SSCP 的优化条件  79-80
    3.3.4 BMP15 基因突变的检测  80
  3.4 结论  80-82
第4章 小结  82-83
  4.1 微卫星对2 山羊品种进行遗传多样性研究  82
  4.2 BMP15 外显子2 部分编码区遗传多样性检测  82-83
参考文献  83-89
缩略语词汇表  89-90
致谢  90-91
攻读硕士学位期间的研究成果  91

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 > 山羊
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