学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

绿豆遗传连锁图谱构建及抗豆象基因定位

作　者: 钟敏
导　师: 程须珍
学　校: 中国农业科学院
专　业: 作物种质资源学
关键词: 绿豆 SSR 通用性遗传图谱抗豆象
分类号: S522
类　型: 硕士论文
年　份: 2012年
下　载: 70次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

绿豆是我国传统的食用豆类作物，也是我国传统出口创汇产品，具有良好的食用和药用价值。随着人们生活水平提高和膳食结构的改变，绿豆的市场需求也日益增加。然而目前绿豆遗传育种研究相对落后，现代分子标记技术在育种中还鲜有应用。加强绿豆重要性状的遗传和现代分子生物学研究，对高产高抗优质新品种的培育具有重要指导意义。本研究以绿豆基因组SSR标记开发与评价为基础，利用野生绿豆和栽培绿豆杂交衍生的RIL群体，开展了绿豆遗传连锁图谱的构建，并进一步对抗豆象基因进行了精细定位，同时开展了绿豆重要农艺性状的QTL发掘，为进一步开展基因克隆等后续研究奠定了基础。主要研究结果如下：1.新开发的2240对绿豆基因组SSR引物中有1205对在绿豆材料中能有效扩增，选取绿豆、小豆、豇豆及饭豆材料各3份，分析1205对新开发的绿豆基因组SSR引物在这些材料中的扩增效果，结果显示绿豆基因组SSR引物在豇豆、小豆和饭豆中的通用性比率分别为50.0%、73.3%和81.6%；多态性比率分别为4.1%、1.7%和1.5%；有469对引物在4个种间均可通用。2.以高抗豆象澳大利亚野生绿豆ACC41和高感豆象美国栽培绿豆Berken为亲本构建的重组自交系F10为实验群体，利用264对在亲本间表现多态的SSR和STS标记对群体进行分析，结合前人的199个分子数据，构建了一张含有419个标记（333个SSR标记、74个RFLP标记、9个STS标记和3个RAPD标记）和一个抗豆象基因位点Br1的绿豆遗传图谱，图谱总长735.0cM，含11个连锁群，标记平均间距1.75cM。各连锁群长度在17.5cM～120.3cM之间，标记位点数9～76个之间，各连锁群标记分布较均匀，是迄今为止国内外标记最多、密度最高的绿豆遗传图谱。3.利用上述图谱将抗豆象基因Br1基因定位于第9连锁群上2.6cM的区间内，距离其两侧的SSR标记P2-627和C220均只有1.3cM。4.基于上述图谱，在4个环境下，对绿豆的株高、主茎节数、荚长、荚宽、单荚粒数和百粒重进行QTL定位，6个产量相关性状共检测到了62个QTL，分布在除第3连锁群以外的10个连锁群上， QTL贡献率在2.89%-30.19%之间，6个性状均检测到5-18个QTL。有7个QTL在2个或2个以上不同环境中都检测到，具有环境稳定性。

全文目录

摘要  6-7
Abstract  7-13
第一章绪论  13-26
  1.1 绿豆概述  13
  1.2 SSR 分子标记的开发  13-15
    1.2.1 序列已知的 SSR 标记开发方法  14
    1.2.2 序列未知的 SSR 标记开发方法  14-15
  1.3 SSR 标记的通用性研究进展  15-19
    1.3.1 SSR 标记在属内近缘种间的通用性  16-17
    1.3.2 SSR 标记在属间近缘种间的通用性  17
    1.3.3 SSR 标记在科间近缘种间的通用性  17-18
    1.3.4 影响 SSR 标记在物种间通用性的因素  18-19
  1.4 绿豆遗传图谱的构建及抗豆象基因定位研究进展  19-22
    1.4.1 绿豆遗传连锁图谱的构建进展  19-20
    1.4.2 绿豆抗豆象研究进展  20-22
  1.5 数量性状基因（QTL）分析  22-24
    1.5.1 QTL 定位的原理、前提和步骤  22
    1.5.2 QTL 定位的统计分析方法  22-23
    1.5.3 绿豆 QTL 研究进展  23-24
  1.6 本研究的目的和意义  24-26
    1.6.1 绿豆基因组 SSR 标记的通用性分析  24
    1.6.2 绿豆遗传连锁图谱的构建和抗豆象基因的精细定位  24-25
    1.6.3 绿豆重要农艺性状的 QTL 分析  25-26
第二章绿豆基因组 SSR 引物在豇豆属作物中的通用性  26-35
  2.1 材料与方法  26-27
    2.1.1 试验材料  26
    2.1.2 SSR 引物来源  26
    2.1.3 DNA 提取和 PCR 扩增  26-27
    2.1.4 扩增产物的检测  27
  2.2 结果与分析  27-32
    2.2.1 绿豆基因组 SSR 引物的筛选  27-28
    2.2.2 绿豆基因组 SSR 引物的通用性分析  28-29
    2.2.3 SSR 引物的多态性分析  29-32
  2.3 讨论  32-34
    2.3.1 绿豆基因组 SSR 引物的通用性  32-33
    2.3.2 绿豆基因组 SSR 引物的多态性  33
    2.3.3 下一步研究方向  33-34
  2.4 小结  34-35
第三章高饱和绿豆遗传图谱的构建和抗豆象基因的精细定位  35-46
  3.1 材料与方法  35-37
    3.1.1 实验材料  35-36
    3.1.2 抗虫鉴定方法  36
    3.1.3 DNA 提取和 PCR 扩增  36
    3.1.4 引物筛选和群体分析  36
    3.1.5 遗传标记多态数据  36-37
    3.1.6 连锁图谱的构建  37
  3.2 结果与分析  37-42
    3.2.1 SSR 标记的多态性分析  37-38
    3.2.2 绿豆遗传连锁图谱的构建和抗豆象基因 Br1 的精细定位  38-41
    3.2.3 分子标记的偏分离分析  41-42
    3.2.4 新图谱与前人绘制图谱的比较  42
  3.3 讨论  42-45
    3.3.1 分子标记的偏分离  42-43
    3.3.2 高饱和绿豆遗传连锁图谱构建的意义  43-44
    3.3.3 绿豆遗传连锁图谱的比较  44
    3.3.4 抗豆象基因的精细定位  44-45
  3.4 结论  45-46
第四章绿豆重要农艺性状的 QTL 分析  46-55
  4.1 材料与方法  46-47
    4.1.1 供试材料  46
    4.1.2 田间实验  46-47
    4.1.3 遗传标记多态性数据  47
    4.1.4 数据分析  47
  4.2 结果与分析  47-53
    4.2.1 株高的 QTL 分析  47-48
    4.2.2 主茎节数的 QTL 分析  48
    4.2.3 荚长的 QTL 分析  48
    4.2.4 荚宽的 QTL 分析  48
    4.2.5 单荚粒数的 QTL 分析  48
    4.2.6 百粒重的 QTL 分析  48-53
  4.3 讨论  53-54
    4.3.1 不同环境下 QTL 位点分析  53
    4.3.2 QTL 位点的分布特征分析  53-54
  4.4 小结  54-55
第五章全文结论  55-56
参考文献  56-64
致谢  64-65
作者简历  65

绿豆遗传连锁图谱构建及抗豆象基因定位

内容摘要

全文目录

相似论文