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盐生植物盐角草、番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因克隆及特性研究
作 者: 吕慧颖
导 师: 杨庆凯;李银心
学 校: 东北农业大学
专 业: 作物遗传育种
关键词: SeNHX1 TtNHX1 Na~+/H~+逆向转运蛋白 耐盐性 盐角草(Saliconia europaea L.) 番杏(Tetragonia tetragonioides O.) 盐生植物
分类号: Q945
类 型: 博士论文
年 份: 2003年
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内容摘要
盐胁迫主要由Na~+引起,过高的Na~+浓度引起的离子毒害、渗透胁迫和K~+/Na~+比率的不平衡使植物新陈代谢异常,从而对大多数器官造成伤害。Na~+/H~+逆向运输蛋白催化Na~+和H~+的跨膜逆向运输,是植物抵御盐分胁迫的一种主要方式,对植物的耐盐性起重要作用。对于植物Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的克隆、表达、结构与功能的分析,有利于在分于水平上详细了解该基因,从而促进植物耐盐基因工程的进展。本研究基于此目的,开展了盐生植物盐角草(Salicornia europaea L.)、番杏(Tetragonia tetragonioides O.)Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的分子克隆工作。 根据GenBank中Na~+/H~+逆向运输蛋白基因的同源序列区域设计简并引物,利用RT-PCR及RACE方法从盐生植物盐角草中克隆Na~+/H~+逆向运输蛋白基因的全长cDNA,将其命名为SeNHX1。该cDNA全长2668bp,包括1683bp的开放读码框(open reading frame,ORF),491个碱基的5′非翻译区(non translated region,NTR),443个碱基的3′非翻译区和51个碱基的多聚腺苷酸尾。此cDNA编码一个561个氨基酸的多肽,推测分子量为62.1KD。克隆的盐角草Na~+/H~+逆向运输蛋白的氨基酸序列与植物中已经报道的北滨藜、水稻、拟南芥、柑橘、小麦的Na~+/H~+逆向运输蛋白同源性很高,分别为88%,74%,77%,78%,63%。Southern blotting分析表明盐角草基因组有一个拷贝的SeNHX1。RT-PCR分析表明SeNHX1在盐角草对照植株的茎中有表达,经NaCl和ABA诱导后表达量增加,但是在根中诱导前后均没有表达。该基因已在GenBank注册,登录号为AY131235;并已申请专利,申请号为03105029.8。 利用RT-PCR及RACE方法成功地从番杏中克隆Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的全长cDNA,将其命名为TtNHX1。该cDNA全长2199bp,包括1665bp的开放读码框(open reading frame,ORF),91个碱基的5′非翻译区(non translaed region,NTR),413个碱基的3,非翻译区和31个碱基的多聚腺苷酸尾。此cDNA编码一个552个氨基酸的多肽,推测分子量为59.5KD。TtNHX1的氨基酸序列与已克隆的北滨藜、水稻、拟南芥、柑橘、小麦Na~+/H~+逆向转运蛋白具有很高的同源性,分别为76%,61%,70%,65%,61%。Southern blotting分析表明TtNHX1在番杏基因组中有2到3个拷贝。Northern blotting分析表明TtNHX1在番杏的根、茎和叶中均有表达,而花中没有表达。TtNHX1已在GenBank注册,登录号为AF527625;并已申请专利,申请号为03109436.8。 盐角草(SeNHX1)和番杏(TtNHX1)的Na~+/H~+逆向转运蛋白基因,无论是在核苷酸水平还是在氨基酸水平都具有很高的同源性,分别为71%和85%。SeNHX1、TtNHX1具有12个跨膜区,且跨膜区是高度保守的。SeNHX1与TtNHY1的氨氯吡嗪嘧的结合位点一致为LFFIYLLPPI。从同源性与系统发育树可以得出结论,SeNHX1、TtNHX1是液泡型的Na~+/H~+逆向转运蛋白基因。SeNHX1、TtNHX1基因在盐处理下表达量增高,表明这两个基因均受盐胁迫诱导。
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全文目录
摘要 10-11 Abstract 11-13 1 引言 13-43 1.1 盐分过多对植物造成的伤害 14 1.2 植物的耐盐机理 14-17 1.2.1 形态适应在植物耐盐性中的重要作用 14-15 1.2.2 渗透调节在植物耐盐性中的重要作用 15-16 1.2.3 离子区隔化在植物耐盐性中的重要作用 16-17 1.3 Na~+/H~+逆向转运蛋白研究进展 17-29 1.3.1 Na~+/H~+逆向转运蛋白的发现、特征及其功能 17-20 1.3.2 Na~+/H~+逆向转运蛋白与植物耐盐性的关系 20-23 1.3.3 Na~+/H~+逆向转运蛋白的分子特征 23-28 1.3.4 Na~+/H~+逆向转运蛋白与其它转运蛋白的关系 28-29 1.4 基因克隆的研究 29-38 1.4.1 序列克隆法 29-31 1.4.2 功能克隆法(Functiortal cloning) 31-32 1.4.3 定位克隆法(Positional cloning) 32-33 1.4.4 表型克隆法(phenotype cloning) 33-34 1.4.5 差异表达分析法 34-36 1.4.6 转座子标记法(transposon tagging) 36 1.4.7 应用DNA芯片技术筛选新基因 36-38 1.5 本研究目的意义及技术路线 38-42 1.5.1 本研究目的竟义 38-40 1.5.2 研究内容 40 1.5.3 预期目标 40-41 1.5.4 技术路线 41-42 1.6 存在的问题及展望 42-43 2 材料与方法 43-62 2.1 实验材料 43-44 2.1.1 本实验所涉及的菌株及质粒 43 2.1.2 植物材料 43 2.1.3 酶及试剂 43-44 2.2 实验方法 44-62 2.2.1 细菌的培养和菌种的保存 44 2.2.2 大肠杆菌质粒的提取(碱裂解法) 44-45 2.2.3 植物总DNA的提取方法(CTAB法) 45 2.2.4 植物总RNA提取 45-47 2.2.5 逆转录反应 47 2.2.6 PCR反应 47-48 2.2.7 DNA片段的快速纯化/回收(参照鼎国产品说明书) 48 2.2.8 PCR产物的克隆 48-50 2.2.9 cDNA末端的分离 50-51 2.2.10 5′RACE步骤 51-54 2.2.11 3′RACE步骤 54-56 2.2.12 同位素标记探针的Southern杂交 56-59 2.2.13 同位素标记探针的Northern杂交 59-61 2.2.14 RT-PCR分析Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的表达 61-62 3 结果与分析 62-90 3.1 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白基因克隆及特性 62-78 3.1.1 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白同源片断的获得 62-69 3.1.2 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白全长cDNA的克隆 69-72 3.1.3 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白和其它Na~+/H~+逆向转运蛋白氨基酸序列的比较 72-77 3.1.4 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的Southern blotting分析 77 3.1.5 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白基因表达的RT-PCR分析 77-78 3.2 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因克隆及特性分析 78-89 3.2.1 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白同源片断的获得 78-82 3.2.2 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白全长cDNA的克隆 82-84 3.2.3 TtNHX1与其它Na~+/H~+逆向转运蛋白氨基酸序列比较 84-87 3.2.4 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的Southern blotting分析 87-88 3.2.5 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因表达的Northern blotting分析 88 3.2.6 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因表达的RT-PCR分析 88-89 3.3 小结 89-90 3.3.1 SeNHX1和TtNHX1基因的比较 89 3.3.2 基因的类型 89 3.3.3 基因的表达特性 89-90 4 讨论 90-95 4.1 Na~+/H~+逆向转运蛋白基因与植物耐盐基因工程 90-91 4.2 实验选材与方法设计 91-92 4.3 Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的特性 92-93 4.3.1 基因的克隆 92 4.3.2 基因的特性 92-93 4.4 存在的问题及展望 93-95 5 结论 95-97 5.1 盐角草、番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的克隆 95 5.2 SeNHX1、TtNHX1基因的特性 95-97 5.2.1 SeNHX1、TtNHX1具有高度保守性 95 5.2.2 SeNHX1、TtNHX1是液泡型的Na~+/H~+逆向转运蛋白基因 95-96 5.2.3 SeNHX1、TtNHX1基因拷贝数 96 5.2.4 SeNHX1、TtNHX1基因表达特性 96-97 参考文献 97-109 致谢 109-110 在学期间已发表和待发表的论文及注册的基因 110
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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物生理学
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