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盐生植物盐角草、番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因克隆及特性研究

作 者: 吕慧颖
导 师: 杨庆凯;李银心
学 校: 东北农业大学
专 业: 作物遗传育种
关键词: SeNHX1 TtNHX1 Na~+/H~+逆向转运蛋白 耐盐性 盐角草(Saliconia europaea L.) 番杏(Tetragonia tetragonioides O.) 盐生植物
分类号: Q945
类 型: 博士论文
年 份: 2003年
下 载: 270次
引 用: 9次
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内容摘要


盐胁迫主要由Na~+引起,过高的Na~+浓度引起的离子毒害、渗透胁迫和K~+/Na~+比率的不平衡使植物新陈代谢异常,从而对大多数器官造成伤害。Na~+/H~+逆向运输蛋白催化Na~+和H~+的跨膜逆向运输,是植物抵御盐分胁迫的一种主要方式,对植物的耐盐性起重要作用。对于植物Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的克隆、表达、结构与功能的分析,有利于在分于水平上详细了解该基因,从而促进植物耐盐基因工程的进展。本研究基于此目的,开展了盐生植物盐角草(Salicornia europaea L.)、番杏(Tetragonia tetragonioides O.)Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的分子克隆工作。 根据GenBank中Na~+/H~+逆向运输蛋白基因的同源序列区域设计简并引物,利用RT-PCR及RACE方法从盐生植物盐角草中克隆Na~+/H~+逆向运输蛋白基因的全长cDNA,将其命名为SeNHX1。该cDNA全长2668bp,包括1683bp的开放读码框(open reading frame,ORF),491个碱基的5′非翻译区(non translated region,NTR),443个碱基的3′非翻译区和51个碱基的多聚腺苷酸尾。此cDNA编码一个561个氨基酸的多肽,推测分子量为62.1KD。克隆的盐角草Na~+/H~+逆向运输蛋白的氨基酸序列与植物中已经报道的北滨藜、水稻、拟南芥、柑橘、小麦的Na~+/H~+逆向运输蛋白同源性很高,分别为88%,74%,77%,78%,63%。Southern blotting分析表明盐角草基因组有一个拷贝的SeNHX1。RT-PCR分析表明SeNHX1在盐角草对照植株的茎中有表达,经NaCl和ABA诱导后表达量增加,但是在根中诱导前后均没有表达。该基因已在GenBank注册,登录号为AY131235;并已申请专利,申请号为03105029.8。 利用RT-PCR及RACE方法成功地从番杏中克隆Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的全长cDNA,将其命名为TtNHX1。该cDNA全长2199bp,包括1665bp的开放读码框(open reading frame,ORF),91个碱基的5′非翻译区(non translaed region,NTR),413个碱基的3,非翻译区和31个碱基的多聚腺苷酸尾。此cDNA编码一个552个氨基酸的多肽,推测分子量为59.5KD。TtNHX1的氨基酸序列与已克隆的北滨藜、水稻、拟南芥、柑橘、小麦Na~+/H~+逆向转运蛋白具有很高的同源性,分别为76%,61%,70%,65%,61%。Southern blotting分析表明TtNHX1在番杏基因组中有2到3个拷贝。Northern blotting分析表明TtNHX1在番杏的根、茎和叶中均有表达,而花中没有表达。TtNHX1已在GenBank注册,登录号为AF527625;并已申请专利,申请号为03109436.8。 盐角草(SeNHX1)和番杏(TtNHX1)的Na~+/H~+逆向转运蛋白基因,无论是在核苷酸水平还是在氨基酸水平都具有很高的同源性,分别为71%和85%。SeNHX1、TtNHX1具有12个跨膜区,且跨膜区是高度保守的。SeNHX1与TtNHY1的氨氯吡嗪嘧的结合位点一致为LFFIYLLPPI。从同源性与系统发育树可以得出结论,SeNHX1、TtNHX1是液泡型的Na~+/H~+逆向转运蛋白基因。SeNHX1、TtNHX1基因在盐处理下表达量增高,表明这两个基因均受盐胁迫诱导。

全文目录


摘要  10-11
Abstract  11-13
1 引言  13-43
  1.1 盐分过多对植物造成的伤害  14
  1.2 植物的耐盐机理  14-17
    1.2.1 形态适应在植物耐盐性中的重要作用  14-15
    1.2.2 渗透调节在植物耐盐性中的重要作用  15-16
    1.2.3 离子区隔化在植物耐盐性中的重要作用  16-17
  1.3 Na~+/H~+逆向转运蛋白研究进展  17-29
    1.3.1 Na~+/H~+逆向转运蛋白的发现、特征及其功能  17-20
    1.3.2 Na~+/H~+逆向转运蛋白与植物耐盐性的关系  20-23
    1.3.3 Na~+/H~+逆向转运蛋白的分子特征  23-28
    1.3.4 Na~+/H~+逆向转运蛋白与其它转运蛋白的关系  28-29
  1.4 基因克隆的研究  29-38
    1.4.1 序列克隆法  29-31
    1.4.2 功能克隆法(Functiortal cloning)  31-32
    1.4.3 定位克隆法(Positional cloning)  32-33
    1.4.4 表型克隆法(phenotype cloning)  33-34
    1.4.5 差异表达分析法  34-36
    1.4.6 转座子标记法(transposon tagging)  36
    1.4.7 应用DNA芯片技术筛选新基因  36-38
  1.5 本研究目的意义及技术路线  38-42
    1.5.1 本研究目的竟义  38-40
    1.5.2 研究内容  40
    1.5.3 预期目标  40-41
    1.5.4 技术路线  41-42
  1.6 存在的问题及展望  42-43
2 材料与方法  43-62
  2.1 实验材料  43-44
    2.1.1 本实验所涉及的菌株及质粒  43
    2.1.2 植物材料  43
    2.1.3 酶及试剂  43-44
  2.2 实验方法  44-62
    2.2.1 细菌的培养和菌种的保存  44
    2.2.2 大肠杆菌质粒的提取(碱裂解法)  44-45
    2.2.3 植物总DNA的提取方法(CTAB法)  45
    2.2.4 植物总RNA提取  45-47
    2.2.5 逆转录反应  47
    2.2.6 PCR反应  47-48
    2.2.7 DNA片段的快速纯化/回收(参照鼎国产品说明书)  48
    2.2.8 PCR产物的克隆  48-50
    2.2.9 cDNA末端的分离  50-51
    2.2.10 5′RACE步骤  51-54
    2.2.11 3′RACE步骤  54-56
    2.2.12 同位素标记探针的Southern杂交  56-59
    2.2.13 同位素标记探针的Northern杂交  59-61
    2.2.14 RT-PCR分析Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的表达  61-62
3 结果与分析  62-90
  3.1 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白基因克隆及特性  62-78
    3.1.1 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白同源片断的获得  62-69
    3.1.2 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白全长cDNA的克隆  69-72
    3.1.3 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白和其它Na~+/H~+逆向转运蛋白氨基酸序列的比较  72-77
    3.1.4 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的Southern blotting分析  77
    3.1.5 盐角草Na~+/H~+逆向转运蛋白基因表达的RT-PCR分析  77-78
  3.2 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因克隆及特性分析  78-89
    3.2.1 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白同源片断的获得  78-82
    3.2.2 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白全长cDNA的克隆  82-84
    3.2.3 TtNHX1与其它Na~+/H~+逆向转运蛋白氨基酸序列比较  84-87
    3.2.4 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的Southern blotting分析  87-88
    3.2.5 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因表达的Northern blotting分析  88
    3.2.6 番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因表达的RT-PCR分析  88-89
  3.3 小结  89-90
    3.3.1 SeNHX1和TtNHX1基因的比较  89
    3.3.2 基因的类型  89
    3.3.3 基因的表达特性  89-90
4 讨论  90-95
  4.1 Na~+/H~+逆向转运蛋白基因与植物耐盐基因工程  90-91
  4.2 实验选材与方法设计  91-92
  4.3 Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的特性  92-93
    4.3.1 基因的克隆  92
    4.3.2 基因的特性  92-93
  4.4 存在的问题及展望  93-95
5 结论  95-97
  5.1 盐角草、番杏Na~+/H~+逆向转运蛋白基因的克隆  95
  5.2 SeNHX1、TtNHX1基因的特性  95-97
    5.2.1 SeNHX1、TtNHX1具有高度保守性  95
    5.2.2 SeNHX1、TtNHX1是液泡型的Na~+/H~+逆向转运蛋白基因  95-96
    5.2.3 SeNHX1、TtNHX1基因拷贝数  96
    5.2.4 SeNHX1、TtNHX1基因表达特性  96-97
参考文献  97-109
致谢  109-110
在学期间已发表和待发表的论文及注册的基因  110

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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物生理学
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