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伴晶状体脱位的Marfan综合症的候选基因突变筛查和特异性筛查基因芯片的初步设计及验证

作　者: 金冲飞
导　师: 姚克
学　校: 浙江大学
专　业: 临床医学
关键词: 基因芯片外显子基因突变眼轴长度博士学位论文浙江大学主要标准表现型中国人群临床表现
分类号: R776
类　型: 博士论文
年　份: 2009年
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内容摘要

本研究拟通过分析中国人群MFS患者的临床表现和检测其基因突变情况,丰富国内外MFS的基因组和表现型的相关研究,为今后MFS的分子诊断提供依据,也为国际人类基因变异组计划提供中国人群的资料。另一方面,设计一款切实可行的用于MFS产前筛查的基因芯片,为优生优育护航。第一部分伴晶状体脱位的Marfan综合症眼部表型分析本研究收集了10个伴先天性晶状体脱位的Marfan综合症家系。所有患者和家庭成员均接受全面病史回顾、眼科检查(裂隙灯、A超、B超和角膜曲率检查)和全身检查(心脏彩超、血同型半胱氨酸检查等),检查结果以登记表的形式统一详细记录并进行汇总分析。眼部的裂隙灯照片分析发现MFS患者的晶状体脱位的方向以上方多见。对患者按年龄分层后,采用统计学的方法分析其角膜曲率和眼轴长度与正常对照组有无显著性差异。结果提示在成年组,MFS患者的角膜曲率明显较正常对照组小(P＜0.0001),而眼轴长度明显较正常对照组长(P=0.040)。这两项指标在未成年组无显著性差异(P＞0.05)。这一结果提示可以考虑将异常扁平角膜列为成年MFS患者诊断的主要标准之一。另外,本研究还发现在MFS人群中,房间隔缺损(ASD)的比例相对较高。但是,ASD是否可以考虑为MFS的一个心血管表现尚有待进一步证实。第二部分Marfan综合症相关候选基因的突变筛查本研究在成功获得MFS患者的基因组DNA之后,设计了66对PCR反应引物,对Marfan综合症相关候选基因FBN1进行了筛查。为提高筛查效率,本研究设计了一套筛查策略,按优先顺序分6组对FBN1的65个外显子及内、外显子连接处进行了筛查。结果发现7个位于FBN1编码区的基因突变:3个为国内外首次发现(2号外显子的c.203G＞T突变;5号外显子的c.502T＞C突变和16号外显子的c.2096G＞C突变);4个为国内首次发现(4号外显子的c.364C＞T突变,13号外显子的c.1633C＞T,15号外显子的c.1879C＞T突变,37号外显子的c.4588C＞T突变)。这7个突变在正常对照的100条染色体中均不存在,排除了单核苷酸多态性(SNP)的可能。通过基因型和表现型的相关分析,本研究发现发现MFS的EL表现型和原纤蛋白-1内半胱氨酸残基的取代或者被取代密切相关。这一患病人群基因突变多集中在FBN1的前15个外显子。MFS患者中,精氨酸到半胱氨酸残基突变的复发频率明显高于其它类型的突变。另外,本研究还首次报道了一例位于原纤蛋白-1的N端结构域的FBN1基因突变。第三部分Marfan综合症特异性筛查基因芯片的初步设计和验证在Marfan综合症相关候选基因的突变筛查的基础上,本研究结合荧光标记单碱基延伸技术和基因芯片技术,设计了一款用于检测MFS的特异性筛查基因芯片。并选取了6种不同突变的病人(8个突变样本)进行了基因芯片的验证。结果提示此款芯片具有很高的检出率(6/6),和很好的重复性(2/2)。该芯片可同时为6种突变提供诊断,为今后设计一款多种遗传病,多个家系,多个位点的超高通量集合基因芯片的开展提供了依据,也为Marfan综合症特异性产前筛查提供了可能。结论1、本研究报道了10个家系的中国人群MFS患者的临床表现,并首次采用按年龄分层的方法,系统性的研究了患者的眼部表现。本研究提示成年MFS患者角膜曲率明显小于正常人群,可考虑将异常扁平角膜作为成年MFS患者诊断的主要标准之一。2、本研究报道了的3个国内外均未见报道的FBN1的基因突变:c.203G＞T(p.Cys68Phe),c.502T＞C(p.Cys168Arg)和c.2096G＞C(p.Cys699Ser);4个国内未见报道的突变:c.364C＞T(p.Arg122Cys),c.1633C＞T(p.Arg545Cys),c.1879C＞T(p.Arg627Cys)和c.4588C＞T(p.Arg1530Cys)。3、本研究通过对伴EL的MFS患者的基因型和表现型的相关分析,发现MFS的EL表现型和原纤蛋白-1内Cys残基的取代或者被取代密切相关。这一患病人群基因突变多集中在FBN1的前15个外显子。MFS患者中,精氨酸到半胱氨酸残基突变的复发频率明显高于其它类型的突变。另外,本研究还首次报道了一例位于原纤蛋白-1的N端结构域的FBN1基因突变。4、本研究设计了一款有独立知识产权的MFS特异性筛查基因芯片,并验证了此种基因芯片用于产前诊断的可行性。为今后设计一款多种遗传病,多个家系,多个位点的超高通量集合基因芯片提供了依据,也为今后遗传病的大规模的产前筛查提供了一种新的模式。

全文目录

致谢  5-6
中文摘要  6-9
ABSTRACT  9-13
英文缩写表(ABBREVIATION)  13-16
第一部分伴晶状体脱位的MARFAN综合症眼部表型分析  16-32
  前言  16-17
  方法与材料  17-20
  结果  20-27
  讨论  27-29
  小结  29-30
  参考文献  30-32
第二部分 MARFAN综合症相关候选基因的突变筛查  32-55
  前言  32-34
  材料与方法  34-43
  结果  43-46
  讨论  46-50
  小结  50-51
  参考文献  51-55
第三部分 MARFAN综合症特异性筛查基因芯片的初步设计和验证  55-67
  前言  55-57
  材料与方法  57-63
  结果  63-64
  讨论  64-65
  小结  65-66
  参考文献  66-67
综述  67-79
  MARFAN综合症FBN1基因研究进展  67-79
科研成果  79-80

伴晶状体脱位的Marfan综合症的候选基因突变筛查和特异性筛查基因芯片的初步设计及验证

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