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MicroRNA基因单核苷酸多态性与新疆哈萨克族食管鳞癌相关性研究

作　者: 尤伟艳
导　师: 李锋
学　校: 石河子大学
专　业: 病理学与病理生理学
关键词: MALDI-TOF MS 单核苷酸多态性 miRNA 食管鳞癌
分类号: R735.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

目的：检测新疆哈萨克族食管鳞癌 miRNA基因单核苷酸多态性,探讨miRNA基因单核苷酸多态性与新疆哈萨克族食管鳞癌及其临床病理参数之间的关系及意义。方法：运用基质辅助激光解析电离时间飞行质谱技术(MALDI-TOF-MS)检测266例新疆哈萨克族食管鳞癌石蜡组织和222例同一地区无肿瘤病史的哈族正常人群血.样14个miRNA基因的15个SNP位点基因型分布,实验结果应用SPSS17.0软件包及SHEsis软件进行统计学分析。结果：(1)哈族食管癌miR34b基因rs11606481位点C/T多态,基因型分布频率分别是7.8%,46.1%和46.1%,对照组上述基因型分布频率(分别是14.8%,62.1%,23.1%)之间差异具有统计学意义(P<0.05)；(2)哈族食管癌miR219基因rs107822位点G/A多态,基因型分布频率分别是32.5%,49.8%和17.7%,对照组上述基因型分布频率(分别是17.5%,48.7%,33.8%)之间差异具有统计学意义(P<0.05),基因型分布与食管癌分化程度相关(P<0.05)；哈族食管癌miR219基因rs213210位点C/T多态,等位基因频率之间差异无统计学意义(P<0.05)：(3)哈族食管癌miR124-1基因rs531564位点C/G多态,基因型分布频率分别是68.0%,28.3%和3.7%,对照组上述基因型分布频率(分别是58.0%,39.87%,2.2%)之间差异具有统计学意义(P<0.05)；(4)哈萨克族miR219基因rs107822、rs213210多态位点之间存在强的连锁不平衡,而且哈族对照组为完全连锁不平衡；(5)miR219基因rs107822、rs213210多态位点主要构成GT、AT、AC和GC四种单体型,哈族食管癌与对照组之间单体型频率差异有统计学意义(P<0.05),GT单体型增加食管癌风险(OR=1.669,95%CI：1.238-2.251),AT单体型降低食管癌风险(OR=0.608,95%CI：0.352-0.671)；(6)miR34a基因型一致为GG,在哈萨克人群中可能不存在多态性,miR146a、miR423、miR34b/c、MiR100、miR373、miR375等基因位点多态的基因型和等位基因频率在新疆哈族食管癌及对照组中差异无统计学意义(P>0.05)。结论：(1)miR34b基因rs11606481位点、miR219-1基因rs107822位点及miR124-1基因rs531564位点多态性与新疆哈族ESCC易感性相关；(2)哈萨克人群中miR219-1基因rs107822、rs213210多态位点存在连锁不平衡；这两个SNP主要组成4种单体型,其GT单体型可能是食管癌的危害因素,AT单体型可能是食管癌的保护因素。

全文目录

中文摘要  6-7
英文摘要  7-8
英文缩略语表  8-9
前言  9-11
材料与方法  11-26
  1. 材料  11-16
  2. 方法  16-26
    2.1 临床病理学研究  16-17
    2.2 miRNA基因及其SNP位点信息  17-18
    2.3 食管癌及对照组DNA制备  18-19
    2.4 DNA产率、纯度鉴定  19-20
    2.5 MALDI-TOF MS技术检测食管癌及对照组miRNA SNP  20-24
    2.6 实验室质量控制  24-25
    2.7 统计学分析  25-26
结果  26-39
  1. 临床病理特征分析  26-28
  2. 食管癌及对照组miRNA SNP基因分型  28-29
  3. 遗传平衡检验  29-31
  4. 食管癌及对照组miRNA SNP的基因型和等位基因频率分布比较  31-33
  5. miR34b、miR219-1、miR124-1 SNP与食管癌发生及其临床病理参数的关系  33-37
  6. 连锁不平衡与单倍型分析  37-39
讨论  39-47
结论  47-48
参考文献  48-52
文献综述  52-59
  参考文献  55-59
附录  59-63
致谢  63-64
作者简介  64-65
导师评阅表  65

MicroRNA基因单核苷酸多态性与新疆哈萨克族食管鳞癌相关性研究

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