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肥胖大鼠脂肪组织基因表达谱特征的研究及差异表达基因功能的初步分析
作 者: 丁胜利
导 师: 郭锡熔
学 校: 南京医科大学
专 业: 儿科学
关键词: 肥胖 脂肪组织 基因表达谱 受体,NPY Y5 手工分类 聚类分析
分类号: R589.2
类 型: 硕士论文
年 份: 2003年
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内容摘要
目的:应用cDNA微阵列(cDNA microarray)技术,研究饮食性肥胖大鼠和NPY Y5受体反义基因治疗后大鼠白色脂肪组织基因表达谱的变化,并对差异表达基因的功能进行初步分析,以探讨肥胖发生的机制。 方法:提取脂肪组织mRNA,标记cDNA探针,与含有18000个人类基因片段点的cDNA微阵列(cDNA microarray)杂交,杂交膜信号扫描分析后,对差异表达基因进行生物信息学分析。 结果:(1)正常组和肥胖组、肥胖组和反义核酸治疗组大鼠腹膜后脂肪组织中表达差异达2倍以上的基因分别有532个、404个,其中3倍以上分别有154个、81个,5倍以上分别有22个、34个;(2)手工分类结果显示,多种功能不同的基因群参与了肥胖的发生发展过程;饮食性肥胖大鼠脂肪组织基因表达谱具有脂肪组织重构、脂代谢异常、脂肪细胞凋亡不足和Ca2+信号转导通路活跃等特征;而NPYY5受体反义基因治疗后大鼠脂肪组织基因表达谱具有胰岛素抵抗受抑制、细胞凋亡增加等特征。(3)K-means聚类法将NPY Y5受体反义基因治疗有效的相关基因分为两大类。分层聚类法将功能相近的已知、未知基因聚为一类。 结论:肥胖大鼠治疗前后的脂肪组织基因表达谱均有其特殊的生物学特征;运用聚类分析,不仅能推测未知基因的功能,而且能推知已知基因的新功能。为发现新基因及已知基因的新功能提供了线索。
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全文目录
中文摘要 3-5 英文摘要 5-8 前言 8-10 参考文献 10-12 第一部分 肥胖大鼠脂肪组织基因表达谱特征的研究 12-57 一、 材料与方法 12-17 二、 结果 17-36 三、 讨论 36-51 四、 小结 51-52 五、 参考文献 52-57 第二部分 差异表达基因-TSG-6与肥胖关系的初步分析 57-88 一、 材料与方法 57-66 二、 结果 66-76 三、 讨论 76-83 四、 小结 83-84 五、 参考文献 84-88 缩略语 88-92 致谢 92-93 附录 93-94 综述 94-98 论文 98-99
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中图分类: > 医药、卫生 > 内科学 > 内分泌腺疾病及代谢病 > 代谢病 > 脂肪代谢障碍
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