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TNFα和Calpain10基因多态性与新疆维吾尔族T2DM的相关性研究

作　者: 褚志华
导　师: 谢建新
学　校: 石河子大学
专　业: 生物化学与分子生物学
关键词: 2型糖尿病 TNFα基因 Calpain10基因 单核苷酸多态性 新疆维吾尔族
分类号: R587.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要


目的:本研究主要通过检测TNFα第308位G→A变异和Calpain10基因(SNP43G/A、SNP63C/T)位点多态性的分布,探讨TNFα第308位G→A变异和Calpain10基因多态性与新疆维吾尔族2型糖尿病遗传易感性的关系。方法:以维吾尔族2型糖尿病患者及正常体检者为研究对象,患者与正常对照者按1:1的比例,从新疆维吾尔自治区人民医院消化内分泌科收集120例2型糖尿病病人及120例该院门诊健康体检者的血样标本,用酶联免疫法(ELISA)检测血清TNFα水平,应用PCR-RFLP分子生物学技术检测TNFα第308位G→A变异和Calpain10基因(SNP43、SNP63)位点多态性基因型分布,并对基因多态性进行分析。采用SPSS13.0统计学软件,用比值比(Odd ratios,OR)及其95%可信区间(Confidence interval,CI)表示相对危险度,比较2型糖尿病患者和对照组TNFα第308位点和Calpain10基因(SNP43、SNP63)位点多态性分布,统计处理数据采用χ2检验,并检验基因型的分布是否符合Hardy-Weinber平衡定律。结果:(1)病例组血清中TNFα水平平均为(28.66±15.28) pg/mL;对照组TNFα水平平均为(22.73±14.24)pg/mL,病例组血清TNFα水平明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。(2)TNFα第308位点三种基因型在病例/对照组中的分布为:GG型89/104(74%/87%);GA+AA型31/16(26%/13%);G、A等位基因在两组中的分布情况为:G等位基因209/224(87%/93%);A等位基因31/16(13%/6%)。TNFα-308多态性位点基因型和等位基因频率在两组中的分布存在差异,差异具有统计学意义(P<0.05)。(3)TNFα不同基因型间血清TNFα水平分别为:GG型为(22.11±2.23 )pg/mL,GA+AA型为(29.78±3.26)pg/mL,GA+AA型水平高于GG型,差异有统计学意义(P<0.05)。(4)SNP43多态性位点三种基因型在病例/对照组中的分布为:GG型101/ 86 (84%/72%);GA型16/26 (16%/22%),AA型0/8(0%/6%);G、A等位基因在两组中的分布情况为:G等位基因221/198 (92%/83%);A等位基因19/42 (8%/18%)。SNP43多态性位点基因型和等位基因频率在两组中的分布存在差异,差异有统计学意义(P<0.05)。(5)SNP63多态性位点的三种基因型在病例/对照组中的分布为:CC型61/62(51%/52%);CT型42/33(35%/28%),TT型17/25(14%/21%);C、T等位基因在两组中的分布情况为:C等位基因164/157(68%/65%);T等位基因76/88(32%/37%)。SNP63多态性位点基因型和等位基因频率在两组中的分布无差异,无统计学意义(p>0.05)。结论:(1)血清中TNFα水平与新疆地区维吾尔族人群2型糖尿病呈正相关;(2)TNFα第308位G→A变异与新疆地区维吾尔族人群2型糖尿病有明显相关性;(3)Calpain 10基因SNP43多态性位点与新疆地区维吾尔族人群2型糖尿病有明显相关性;(4)Calpain 10基因SNP63多态性位点与新疆地区维吾尔族人群2型糖尿病无明显相关性。

全文目录


中文摘要  7-9
英文摘要  9-11
英文缩略语表  11-12
前言  12-14
材料与方法  14-23
  1.材料  14-16
    1.1 研究对象  14
    1.2 主要试剂  14
    1.3 主要设备  14-15
    1.4 主要试剂配置  15-16
  2.方法  16-23
    2.1 病例-对照研究对象的选择  16
    2.2 有关指标的测量  16-17
    2.3 血清空腹胰岛素(FINS)水平测定  17
    2.4 有关指标的计算  17
    2.5 提取 DNA  17-18
    2.6 血清TNF-α水平测定  18
    2.7 TNFα-308（G→A）基因多态性位点PCR-RFLP 分析  18-20
    2.8 Calpain10(SNP43G/A、SNP63C/T)位点基因多态性位点 PCR-RFLP  20-21
    2.9 统计方法  21-23
结果  23-37
  1 研究对象一般特征及有关的统计数据  23
  2. 研究对象有关资料的统计数据  23
  3. 血清TNFα水平与各变量间的相关性  23-24
  4. TNFα-308（G→A）位点基因多态性PCR 扩增产物，酶切结果  24-26
  5. TNFα-308统计学分析结果  26-28
  6. Calpain10基因第三内含子子第43位及第十三内含子63多态性位点PCR  28-30
  7. Calpain10基因多态性位点统计学分析结果  30-37
讨论  37-44
参考文献  44-47
结论  47-48
文献综述  48-53
  参考文献  51-53
附录  53-59
作者简历  59
发表论文情况  59-60
致谢  60-61
导师评语  61

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中图分类: > 医药、卫生 > 内科学 > 内分泌腺疾病及代谢病 > 胰岛疾病 > 糖尿病
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