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杨树SSR标记在柳树中的通用性检测及初步应用

作　者: 许远
导　师: 徐立安
学　校: 南京林业大学
专　业: 林木遗传育种
关键词: SSR 柳属杨属通用性多态性遗传图谱
分类号: S792.12
类　型: 硕士论文
年　份: 2006年
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内容摘要

本研究对来自近缘属杨属的毛果杨开发出的754对SSR引物在柳属植物中的通用性和多态性进行了检测，并将筛选出的标记引物应用于簸箕柳(S．suchowensis)×绵毛柳(S．erioclada Lel．)F1群体的遗传连锁图谱的初步构建、与杨属的两张图谱简单比对以及标记-性状的关联分析。主要结果如下：采用一个DNA样品对754对杨属SSR引物进行筛选，其中371对能扩出产物，引物通用率为49.20％，表明杨属SSR引物在柳属树种具有良好的通用性，并为柳属植物的后续遗传学研究提供了一批SSR候选标记。采用两个亲本和6个子代无性系对有产物的371对引物进行多态性检测，其中157(42.32％)对表现为多态，每个SSR位点最多可得到4个等位基因，主要是由于研究目的不同，若是进行遗传多样性研究，其多态性必然更高。以F1群体的94个个体为作图群体，通过群体检测，挑选出100个(26.95％)扩增谱带清晰稳定的多态性标记，用于遗传连锁图谱的初步构建：获得9个连锁群，共36个标记分布其中；连锁群标记数2～13个，平均每个连锁群4个标记；标记间平均图距11.7cM，最大标记间图距61.7cM。本研究图谱中的9个连锁群与美洲黑杨×欧美杨的20个连锁群间存在4个同源标记位点，与毛果杨×美洲黑杨图谱的19个连锁群共有3个同源标记位点，但它们所在连锁群并未一一对应，在本图谱中连锁位点可能位于杨树图谱的不同连锁群，而在杨树图谱中连锁位点也可能在本研究中表现不连锁，主要原因在于定位于图谱中的标记数太少。标记-性状关联分析检测出9个标记分别与该群体枝条颜色、光滑／粗糙、腺点有／无三个形态性状呈显著或极显著相关，其中PMGC2501位于本研究所得图谱的第3连锁群；23个标记分别与叶长、叶宽、叶长宽比、叶柄长以及株高5个生长性状呈显著或极显著相关，其中7个标记位于图谱中。上述结果表明，杨属SSR引物在柳属中具有良好的通用性，所得的一批标记引物为柳属植物进一步的遗传学研究提供了工具。而随后所做的几个初步应用也表明经本研究筛选出的多态性引物具有较高的应用价值。

全文目录

摘要  3-4
Abstract  4-8
第一部分文献综述  8-22
  1 遗传标记概述  8-10
  2 SSR标记  10-17
    2.1 概述  10-11
    2.2 获取 SSR引物的方法  11-12
    2.3 SSR引物的通用性研究  12-13
    2.4 SSR标记在遗传图谱构建中的应用  13-15
    2.5 SSR标记在比较基因组学研究中的应用  15
    2.6 SSR标记在群体遗传多样性分析中的应用  15-17
  3 柳树的遗传学研究  17-21
    3.1 概述  17
    3.2 柳树的遗传学研究现状  17-20
      3.2.1 柳树性状变异研究  18
        3.2.1.1 生长性状遗传变异  18
        3.2.1.2 抗性遗传变异  18
      3.2.2 分子标记在柳树遗传学研究中的应用  18-20
        3.2.2.1 柳树群体结构与遗传多样性研究  18-19
        3.2.2.2 柳树遗传图谱构建与 QTL定位  19-20
    3.3 柳树的遗传学研究前景  20-21
  4 本研究的目的和意义  21-22
第二部分实验研究  22-49
  第一章 SSR标记通用性分析  22-32
    1 材料和方法  22-24
      1.1 植物材料和 DNA样品提取  22-23
      1.2 SSR标记分析  23-24
        1.2.1 本研究中所用的SSR引物来源  23
        1.2.2 筛选方法  23-24
    2 实验结果  24-28
      2.1 DNA样品提取结果  24-25
      2.2 初筛  25
      2.3 复筛  25-26
      2.4 群体检测  26-28
    3 分析与讨论  28-32
      3.1 SSR引物通用性检测  28-29
      3.2 SSR引物多态性检测  29-30
      3.3 谱带表现  30-32
  第二章杨属和柳属间通用 SSR标记的初步应用  32-49
    1 簸箕柳295-2(S.suchowensis)×绵毛柳 716 (Salix erioclada Levl.)的遗传图谱初步构建及与杨树图谱的初步比较  32-42
      1.1 材料与方法  32-34
        1.1.1 作图群体构建  32
          1.1.1.1 亲本组合选择  32
          1.1.1.2 杂交所得 F1群体  32
          1.1.1.3 作图群体  32
        1.1.2 遗传标记选择  32-33
        1.1.3 遗传图谱构建  33-34
          1.1.3.1 SSR标记分析  33
          1.1.3.2 性别分化标记分析  33
          1.1.3.3 图谱构建  33-34
      1.2 实验结果  34-40
        1.2.1 SSR标记分离类型  34-35
        1.2.2 图谱构建  35-37
        1.2.3 标记分离分析  37-38
        1.2.4 簸箕柳×绵毛柳图谱与美洲黑杨×欧美杨、毛果杨×美洲黑杨二图谱的比较  38-40
      1.3 分析与讨论  40-42
    2 标记-性状关联分析  42-49
      2.1 材料与方法  42-44
        2.1.1 群体性状调查  42-43
        2.1.2 SSR分析  43
        2.1.3 统计分析方法  43
          2.1.3.1 形态性状分析方法  43
          2.1.3.2 生长性状分析方法  43
        2.1.4 数据处理  43-44
      2.2 实验结果  44-47
        2.2.1 形态性状与各标记间相关性分析  44
        2.2.2 生长性状与各标记间相关性分析  44-47
          2.2.2.1 群体生长性状调查结果  44-45
          2.2.2.2 SSR标记与叶片性状及株高性状的相关分析  45-47
      2.3 分析与讨论  47-49
参考文献  49-58
附录  58-64
详细摘要  64-67

杨树SSR标记在柳树中的通用性检测及初步应用

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