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非小细胞肺癌中TGFBR1等位基因特异性表达（ASE）及其与单倍型关系的研究

作　者: 孙金霞
导　师: 张洪涛
学　校: 苏州大学
专　业: 遗传学
关键词: NSCLC TGFBR1 ASE 单倍型 SNP
分类号: R734.2
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要


非小细胞肺癌(NSCLC)约占全部肺癌的85%,转化生长因子β(TGF-β)的表达下降在肺癌细胞中十分普遍。转化生长因子β受体1(TGFBR1)持续的表达下调,可能导致肿瘤对TGF-β的耐受,这已经成为一种新型的肿瘤表现型。然而,NSCLC中精确的遗传学/表观遗传学机制还不清楚。本研究中,我们选取位于TGFBR1基因的3’非翻译区(3’UTR)的两个SNPs,采用SNaPshot定量的方法来测定等位基因特异性表达(allelic-specific expression,ASE)情况。之后,再选取7个标签SNPs(tagging SNPs, tSNPs)来确定TGFBR1 ASE样本与tSNPs构建的单倍型之间是否存在相互关系。最后,我们发现在NSCLC样本中21.1%的个体存在TGFBR1 ASE。位于5’非编码区的rs7040869发现与TGFBR1 ASE相关(P=0.03)。rs7040869和rs4743325是TGFBR1上连锁不平衡的两SNPs,其构建的两位点单倍型AT与TGFBR1 ASE的样本显著相关(P=0.01)。我们的研究揭示了在NSCLC患者人群中存在较高的TGFBR1 ASE,且与TGFBR1基因的一个两位点单倍型相关。我们的研究表明TGFBR1基因与NSCLC的病因学有着重要联系,但该作用还亟需更多种系水平和更大样本量的实验进行验证。

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中图分类: > 医药、卫生 > 肿瘤学 > 呼吸系肿瘤 > 肺肿瘤
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