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黄牛LPIN1基因的单核苷酸多态性及其与经济性状的关联研究

作　者: 卫利选
导　师: 雷初朝
学　校: 西北农林科技大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: 黄牛 LPIN1基因多态性经济性状关联分析
分类号: S823
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

鉴定牛数量性状基因及相关基因多态性,了解这些基因多态性如何影响牛的经济性状,对于商品牛群的标记辅助选择和更有效的管理非常重要。Lipin蛋白家族的Lipin1蛋白对机体脂肪沉积有重要的作用,它是LPIN1基因的编码产物。LPIN1基因以两种方式影响脂肪的发育,一方面是LPIN1基因编码Ⅰ型磷脂酸磷脂酶,参与磷脂和甘油三酯的合成,另一方面作为激活因子,调控脂肪细胞分化和成脂基因的诱导。本研究选择LPIN1基因作为影响牛胴体脂肪沉积的候选基因,以草原红牛、鲁西牛、郏县红牛、南阳牛、秦川牛和夏南牛共6个黄牛品种740头牛为实验材料,利用PCR-RFLP、PCR-SSCP技术,结合DNA测序技术,研究了LPIN1基因的遗传变异,分析了变异的遗传多态性指标并利用SPSS软件对LPIN1基因的遗传多态性与黄牛的经济性状进行了关联分析。以期寻找与牛经济性状相关的基因型及其标记位点,为标记辅助选种、育种和培育优良肉牛品种提供依据。本研究获得以下重要结果:1、发现黄牛LPIN1基因4个SNPs位点。在草原红牛、鲁西牛、郏县红牛、南阳牛、秦川牛和夏南牛共6个黄牛品种中检测了LPIN1基因的19个位点,包括非编码区和外显子及部分内含子区域,共发现4个SNPs（NC₀07309.4:g.438C>T、g.31735A>G、g.46137A>C和g.65969G>A）,其中SNP g.438C>T发生在5’非编码区,有三种基因型分别是CC、CT和TT基因型;g.31735A>G发生在第1内含子区域,有AA、AG和GG基因型;g.46137A>C发生在第6外显子区域,有AA、AC和CC基因型;g.65969G>A发生在第15内含子区域有GG、GA和AA基因型。发生在第6外显子的SNP g.46137A>C是一个错义突变,导致该蛋白的第82位的组氨酸变为脯氨酸。4个多态性位点在6个黄牛品种中均处于中度多态（0.25<P<0.50）。黄牛LPIN1基因其它15个位点没有发现多态性。2、发现黄牛LPIN1基因4个SNPs位点与秦川牛生长与胴体性状显著相关。（1）秦川牛g.438C>T多态位点TT基因型的眼肌面积显著高于CC基因型（P<0.05）,CC基因型的大理石花纹评分显著高于CT基因型和TT基因型（P<0.05）。（2）秦川牛g.31735A>G多态位点GG基因型个体的胸深、胸围、背膘厚显著高于AA和AG基因型个体（P<0.05）。（3）秦川牛g.46137C>A多态位点AC和CC基因型个体的背膘厚显著高于AA基因型个体（P<0.05）,CC基因型个体的眼肌面积和大理石花纹评分等级显著高于AA基因型个体（P<0.05）。（4）秦川牛g.65969G>A多态位点AA基因型个体的胸深、胸围、眼肌面积和背膘厚显著高于GG基因型个体（P<0.05）,GG基因型个体的大理石花纹评分等级显著高于AA和GA基因型个体（P<0.05）。推测该基因可能是影响秦川牛眼肌面积、大理石评分和背膘厚性状的主效基因或与其紧密连锁,可以作为秦川牛品质改良的辅助选择标记。

黄牛LPIN1基因的单核苷酸多态性及其与经济性状的关联研究

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