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中国象鼻溞属的形态与分子系统发育学研究

作　者: 范凤娟
导　师: 章群；韩博平
学　校: 暨南大学
专　业: 水生生物学
关键词: 象鼻溞属形态分子系统发育学中国
分类号: Q954
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
下　载: 63次
引　用: 1次
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内容摘要

象鼻溞是一种在水体中常见、广泛分布的枝角类,多数淡水水体的优势浮游动物。在生态系统中起重要的作用。本论文以中国部分水库、湖泊的象鼻溞为对象,应用形态学、线粒体DNA COI基因序列和核糖体ITS区序列分析,进行了系统发育学研究,探讨象鼻溞属的分类地位和亲缘关系,为揭示不同类群间的系统发育提供了基础资料。结果如下：1.运用形态学方法比较象鼻溞属的形态差异,对8个常规性状(体长、体高、甲壳高、第一触角、第二触角、壳刺、眼直径、侧孔到边缘的距离)进行测量,发现8个形状都无法作为物种的分类依据。根据侧孔到边缘的距离、壳瓣的形状和尾爪的栉刺数量对17个地点的样品进行分类,发现新疆天山天池、四川七星湖、四川金秋湖、甘肃刘家峡、云南拉市海的样品尾爪有2列栉刺及壳瓣的形状定为长额象鼻溞(Bosmina longirostris)。浙江千岛湖、湖北赤壁、江苏扬州、高邮湖、广东西丽水库、广东高州水库、浙江西湖、海南松涛水库、黑龙江的样品尾爪有1列栉刺,侧孔远离边缘定为脆弱象鼻溞(Bosmina fatalis),其中贵州的啊哈水库样品存在2个物种,乌拉圭是Bosmina freyi。2.测定了线粒体DNA COI基因5’端部分序列,获得全序列长为617bp,其中变异位点256个,A+T(63.2%)含量明显高于G+C(36.8%)。转换数为30,颠换数为27,转换、颠换比(R)为1.1。分子系统树分为A、B、C3个谱系,A谱系分为A1和A2两个群体,B谱系又分为B1和B2两个群体,C为单独一枝,以后检概率为1.00单独成枝。TS(新疆)、JQ(四川)和LJX(甘肃)样品聚在B支,A2支的样品为四川省的YA和QX,后检概率是1.00,可能是一隐藏种。在地理分布上可以看出,除了BL(甘肃)样品为基本上是东西分化明显。3.测定核糖体ITS区基因(ITS1、5.8S、ITS2)序列为1172个bp,碱基含量没有偏倚性。分子系统树分为明显的3个谱系结果,不同地理群体间相对聚为一枝。但是AH(贵州)的样品聚在不同的谱系中,AH2在1谱系中,而AH1、AH3位于2谱系,在系统树上可以认为贵州样品分为2个物种。这与形态观察结果一致。

全文目录

摘要  4-5
Abstract  5-9
1. 前言  9-24
  1.1 象鼻溞的研究概述  9-11
    1.1.1 象鼻溞的生物学研究  9-10
    1.1.2 象鼻溞的形态特征  10
    1.1.3 象鼻溞的生活习性  10-11
    1.1.4 象鼻溞的系统发育研究  11
    1.1.5 存在的问题  11
  1.2 形态分析  11-12
  1.3 分子系统发育学  12-20
    1.3.1 研究方法  13-17
    1.3.2 分子系统树的构建  17-20
  1.4 分子标记的选择  20-23
    1.4.1 线粒体DNA基因的特征  20-22
    1.4.2 核基因  22-23
  1.5 形态学方法和分子标记方法的比较  23
  1.6 本课题研究的目的和意义  23-24
2. 形态度量学  24-34
  2.1 实验材料  24-25
  2.2 实验仪器及试剂  25
  2.3 形态度量方法  25-26
  2.4 数据处理  26
  2.5 结果与分析  26-33
  2.6 讨论  33-34
3. 分子标记  34-61
  3.1 线粒体细胞色素氧化酶I(COI)基因  34-47
    3.1.1 实验材料  34-35
    3.1.2 实验仪器和主要试剂  35-36
    3.1.3 实验方法  36-39
    3.1.4 实验结果与分析  39-47
  3.2 核糖体DNA ITS区  47-57
    3.2.1 实验材料  47-48
    3.2.2 实验器材和主要试剂  48
    3.2.3 实验方法  48-49
    3.2.4 实验结果与分析  49-57
  3.3 讨论  57-61
    3.3.1 几个影响PCR的重要因素  57-58
    3.3.2 不同形态种之间的关系  58
    3.3.3 相同形态种不同象鼻溞的关系  58-59
    3.3.4 基于COI基因和ITS基因的讨论  59-61
4. 小结  61-62
参考文献  62-69
攻读硕士学位期间发表的论文  69-70
致谢  70

中国象鼻溞属的形态与分子系统发育学研究

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