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CarO蛋白与鲍曼不动杆菌耐药性的相关性研究

作 者: 邓俊
导 师: 夏忠弟
学 校: 中南大学
专 业: 医学微生物学
关键词: 鲍曼不动杆菌 CarO蛋白 环丙沙星 亚胺培南 喹诺酮耐药 碳氢霉烯耐药
分类号: R446.5
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
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内容摘要


目的:研究CarO蛋白的表达与临床鲍曼不动杆菌环丙沙星亚胺培南的相关性,了解CarO蛋白的结构与鲍曼不动杆菌耐药的相关性。方法:①收集长沙地区四家医院的56株鲍曼不动杆菌进行环丙沙星及亚胺培南药敏实验;②对临床敏感株进行环丙沙星体外诱导耐药实验;③PCR扩增CarO基因并测序;④实时荧光定量PCR测定各组CarO蛋白mRNA表达情况;⑤提取外膜蛋白并用SDS-PAGE分析CarO蛋白的表达水平;⑥利用生物信息学分析技术比对敏感菌株和耐药菌株CarO蛋白的结构与功能。结果:①所收集的临床鲍曼不动杆菌对环丙沙星的耐率为85.7%,对亚胺培南的耐药率为12.5%;②无论是临床耐药菌株与临床敏感菌株比较,还是临床敏感菌株被诱导成耐环丙沙星菌株以后,CarO mRNA的表达和蛋白的表达都有下降;③信息学分析发现耐药菌株与敏感菌株相比,氨基酸突变多发生在胞外区域;④信息学分析比对发现,耐药菌株CarO蛋白氨基酸序列在177位比敏感菌株多一个蛋白激酶C磷酸化位点,该处位点与细菌耐药的关系有待证明;⑤耐药菌株CarO蛋白的内在氢键网络可能与敏感株有差别。结论:①收集的临床鲍曼不动杆菌对环丙沙星的耐药情况较亚胺培南严重;②CarO蛋白的表达下调可能与临床鲍曼不动杆菌的耐药性相关;③CarO蛋白与鲍曼不动杆菌耐环丙沙星有一定相关性,佐证了CarO蛋白可能与细菌多重耐药有关;④CarO蛋白可能与细胞信号传导有关;⑤敏感菌株与耐药菌株的CarO蛋白功能位点和内部结构有差异,可能与细菌耐药有关。

全文目录


中文摘要  4-6
英文摘要  6-11
英文缩略表  11-12
前言  12-14
第一章 材料与方法  14-25
  1.1 材料  14-18
    1.1.1 主要试剂以及来源  14-15
    1.1.2 菌株来源  15
    1.1.3 主要仪器  15-16
    1.1.4 培养基和试剂的配制  16-17
    1.1.5 生物信息学软件  17-18
  1.2 方法  18-25
    1.2.1 实验技术路线  18
    1.2.2 纸片扩散法药敏实验  18-19
    1.2.3 微量肉汤稀释法  19
    1.2.4 热裂解法提取细菌总DNA  19-20
    1.2.5 引物设计  20
    1.2.6 目的基因PCR扩增  20-21
    1.2.7 PCR产物分析  21
    1.2.8 测序结果分析  21
    1.2.9 细菌总RNA提取  21
    1.2.10 逆转录步骤  21-22
    1.2.11 荧光定量PCR  22
    1.2.12 数据分析  22-23
    1.2.13 体外诱导实验  23
    1.2.14 提取外膜蛋白  23-24
    1.2.15 SDS-PAGE电泳  24
    1.2.16 蛋白质生物信息学分析  24-25
第二章 结果  25-42
  2.1 CarO蛋白表达与鲍曼不动杆菌耐药的相关性  25-33
    2.1.1 药敏结果  25-27
    2.1.2 体外诱导实验结果  27
    2.1.3 各组PCR产物电泳结果  27-29
    2.1.4 各组mRNA的表达情况  29-32
    2.1.5 各组CarO的蛋白水平分析  32-33
  2.2 CarO蛋白的生物信息学研究  33-42
    2.2.1 各组CarO蛋白核酸序列比对  33-35
    2.2.2 各组CarO蛋白氨基酸序列比对  35-36
    2.2.3 各菌株CarO蛋白同源性分析  36-37
    2.2.4 各菌株CarO蛋白的理化性质  37-38
    2.2.5 各菌株CarO蛋白二级结构预测  38-39
    2.2.6 各菌株CarO蛋白功能位点预测  39-40
    2.2.7 各菌株CarO蛋白三级结构模型与功能的推测  40-42
第三章 讨论  42-46
  3.1 CarO蛋白的表达与临床鲍曼不动杆菌耐药的相关性研究  42-43
  3.2 CarO蛋白与环丙沙星的相关性研究  43
  3.3 CarO蛋白生物信息组学的研究  43-46
第四章 结论  46-47
第五章 进一步实验  47-48
参考文献  48-52
综述  52-61
  参考文献  57-61
致谢  61-62
在读期间完成的论文  62

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中图分类: > 医药、卫生 > 临床医学 > 诊断学 > 实验室诊断 > 微生物学检验
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