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CarO蛋白与鲍曼不动杆菌耐药性的相关性研究
作 者: 邓俊
导 师: 夏忠弟
学 校: 中南大学
专 业: 医学微生物学
关键词: 鲍曼不动杆菌 CarO蛋白 环丙沙星 亚胺培南 喹诺酮耐药 碳氢霉烯耐药
分类号: R446.5
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
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内容摘要
目的:研究CarO蛋白的表达与临床鲍曼不动杆菌耐环丙沙星及亚胺培南的相关性,了解CarO蛋白的结构与鲍曼不动杆菌耐药的相关性。方法:①收集长沙地区四家医院的56株鲍曼不动杆菌进行环丙沙星及亚胺培南药敏实验;②对临床敏感株进行环丙沙星体外诱导耐药实验;③PCR扩增CarO基因并测序;④实时荧光定量PCR测定各组CarO蛋白mRNA表达情况;⑤提取外膜蛋白并用SDS-PAGE分析CarO蛋白的表达水平;⑥利用生物信息学分析技术比对敏感菌株和耐药菌株CarO蛋白的结构与功能。结果:①所收集的临床鲍曼不动杆菌对环丙沙星的耐率为85.7%,对亚胺培南的耐药率为12.5%;②无论是临床耐药菌株与临床敏感菌株比较,还是临床敏感菌株被诱导成耐环丙沙星菌株以后,CarO mRNA的表达和蛋白的表达都有下降;③信息学分析发现耐药菌株与敏感菌株相比,氨基酸突变多发生在胞外区域;④信息学分析比对发现,耐药菌株CarO蛋白氨基酸序列在177位比敏感菌株多一个蛋白激酶C磷酸化位点,该处位点与细菌耐药的关系有待证明;⑤耐药菌株CarO蛋白的内在氢键网络可能与敏感株有差别。结论:①收集的临床鲍曼不动杆菌对环丙沙星的耐药情况较亚胺培南严重;②CarO蛋白的表达下调可能与临床鲍曼不动杆菌的耐药性相关;③CarO蛋白与鲍曼不动杆菌耐环丙沙星有一定相关性,佐证了CarO蛋白可能与细菌多重耐药有关;④CarO蛋白可能与细胞信号传导有关;⑤敏感菌株与耐药菌株的CarO蛋白功能位点和内部结构有差异,可能与细菌耐药有关。
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全文目录
中文摘要 4-6 英文摘要 6-11 英文缩略表 11-12 前言 12-14 第一章 材料与方法 14-25 1.1 材料 14-18 1.1.1 主要试剂以及来源 14-15 1.1.2 菌株来源 15 1.1.3 主要仪器 15-16 1.1.4 培养基和试剂的配制 16-17 1.1.5 生物信息学软件 17-18 1.2 方法 18-25 1.2.1 实验技术路线 18 1.2.2 纸片扩散法药敏实验 18-19 1.2.3 微量肉汤稀释法 19 1.2.4 热裂解法提取细菌总DNA 19-20 1.2.5 引物设计 20 1.2.6 目的基因PCR扩增 20-21 1.2.7 PCR产物分析 21 1.2.8 测序结果分析 21 1.2.9 细菌总RNA提取 21 1.2.10 逆转录步骤 21-22 1.2.11 荧光定量PCR 22 1.2.12 数据分析 22-23 1.2.13 体外诱导实验 23 1.2.14 提取外膜蛋白 23-24 1.2.15 SDS-PAGE电泳 24 1.2.16 蛋白质生物信息学分析 24-25 第二章 结果 25-42 2.1 CarO蛋白表达与鲍曼不动杆菌耐药的相关性 25-33 2.1.1 药敏结果 25-27 2.1.2 体外诱导实验结果 27 2.1.3 各组PCR产物电泳结果 27-29 2.1.4 各组mRNA的表达情况 29-32 2.1.5 各组CarO的蛋白水平分析 32-33 2.2 CarO蛋白的生物信息学研究 33-42 2.2.1 各组CarO蛋白核酸序列比对 33-35 2.2.2 各组CarO蛋白氨基酸序列比对 35-36 2.2.3 各菌株CarO蛋白同源性分析 36-37 2.2.4 各菌株CarO蛋白的理化性质 37-38 2.2.5 各菌株CarO蛋白二级结构预测 38-39 2.2.6 各菌株CarO蛋白功能位点预测 39-40 2.2.7 各菌株CarO蛋白三级结构模型与功能的推测 40-42 第三章 讨论 42-46 3.1 CarO蛋白的表达与临床鲍曼不动杆菌耐药的相关性研究 42-43 3.2 CarO蛋白与环丙沙星的相关性研究 43 3.3 CarO蛋白生物信息组学的研究 43-46 第四章 结论 46-47 第五章 进一步实验 47-48 参考文献 48-52 综述 52-61 参考文献 57-61 致谢 61-62 在读期间完成的论文 62
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中图分类: > 医药、卫生 > 临床医学 > 诊断学 > 实验室诊断 > 微生物学检验
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