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混合DNA分型结果的解释及法医学应用

作　者: 胡娜
导　师: 刘雅诚
学　校: 山西医科大学
专　业: 法医学
关键词: 混合DNA-STR分型限制性组合分析法杂合型均衡比混合比混合DNA似然率
分类号: D919
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要

目的:通过制备不同混合比例的模拟混合DNA,利用混合DNA分型中的峰高或峰面积信息,采用一定的参数标准对建立在峰高或峰面积基础上各基因座的表型组合进行分析,筛选出合理的表型组合,建立限制性组合分析法对混合DNA分型的结果进行解释,从而对男/女两人混合DNA分型的组分来源进行认定。并通过实际案例的验证,对建立的分析法在法医学应用中的适用范围进行探索,为解决法医学应用中男/女两人混合DNA分型结果的解释提供科学合理的途径。方法:选择AB-YfilerTM试剂盒中007阳性对照品作为已知男性DNA,选择AB-IdentifilerTM试剂盒中9947A阳性对照品作为已知女性DNA(两者浓度均为0.1ng/μl)。制备8个梯度比例的25例常量和不同混合比例不同混合DNA总模板量的19例低拷贝男/女两人模拟混合DNA(每个梯度比例同时做三次平行试验),应用杂合型均衡比和混合比两个参数,通过性别基因座估计男/女两人混合DNA中男性DNA所占的比例,对在峰高(峰面积)信息基础上各基因座的表型组合进行限制性的分析,筛选出合理的表型组合,建立限制性组合分析法。对男性组分混合比为95%、50%、5%的9个模拟混合样本的峰高和峰面积信息分别进行分析,比较其在限制性组合分析法中的应用有无差别。通过12例常量和5例低拷贝男/女两人混合DNA案件对建立的分析法进行验证,观察分析结果。对混合DNA分型中出现的一个等位基因缺失、两个等位基因缺失及低拷贝DNA分型中等位基因缺失三种类型,参考Peter Gill推荐的相应的量化公式[2]进行似然率(LR)计算。结果:25例模拟常量混合DNA分析的结果显示:3例混合样本检出的基因座数为15个(检出率100%),5例检出数为14个(检出率93%),4例检出数为13个(检出率87%), 6例检出数为12个(检出率80%),3例检出数为11个(检出率73%),最低检出数为8个(检出率53%)仅1例;在男性组分混合比为95%的三次重复混合样本中,分离得到的男性DNA分型依次出现2个、1个和4个等位基因缺失,其余混合样本均无缺失;6例混合样本出现等位基因的错判,其中5例样本错判数1个基因座、1例错判2个基因座,6例中的3例均为男性组分混合比为30%的样本;25例混合样本的似然率(LR)值均达到14个数量级以上。19例模拟低拷贝混合DNA分析的结果显示:1例低拷贝混合样本的检出基因座数为12个(检出率80%),1例检出数为11个(检出率73%),最低检出基因座数为3个(检出率20%)共4例;6例样本出现等位基因缺失,缺失集中在男性混合比低于20%或混合DNA模板量为100pg的样本中;18例样本出现等位基因错判;同一混合比的三次重复样本间LR值差别多数在6个数量级以内。选择峰高与峰面积信息进行混合DNA的分析在检出基因座数、等位基因缺失数和错判基因座数三方面无明显差别。17例混合DNA案件验证的结果显示:12例常量混合DNA案件中,4例案件检出基因座数为15个,2例检出数为14个,1例检出数为13个,2例检出数为12个,2例检出数为11个,最低检出数为10个仅l例;5例案件出现等位基因缺失,其中4例均缺失1个基因座、1例缺失3个基因座;12例案件均无等位基因错判。5例低拷贝混合DNA案件中,最高检出基因座数为9个,最低检出数仅为3个;仅1例出现缺失现象;错判基因座数共10个。结论:结合44例模拟混合DNA和17例混合DNA案件的分析,建立的限制性组合分析法的适用范围是:混合DNA分型的15个基因座中最高等位基因条带的相对荧光强度应大于1000rfu,且混合比大于30%的男/女两人混合DNA。峰高或峰面积信息均可进行分析。在低拷贝混合DNA分析中,由于等位基因错判现象的发生无法进行量化计算,该分析法在此应用受到限制。

全文目录

中文摘要  5-7
英文摘要  7-9
前言  9-11
第一部分混合 DNA 分析方法的建立  11-19
  1.1 混合 DNA 模型的制备  11-12
  1.2 混合 DNA 分析的方法  12-15
  1.3 峰高和峰面积在混合 DNA 分析中的比较  15
  1.4 模拟实验科学性的证明  15-19
第二部分混合 DNA 分析的影响因素  19-22
  2.1 缺失概率  19
  2.2 等位基因缺失的量化计算  19-21
  2.3 等位基因缺失的举例  21-22
第三部分模拟混合 DNA 的分析和结果解释  22-47
  3.1 模拟常量混合 DNA 的分析  22-32
  3.2 模拟低拷贝混合 DNA 的分析  32-38
  3.3 利用峰面积信息对模拟混合 DNA 的分析  38-41
  3.4 模拟混合 DNA 分析的结果  41-47
第四部分混合 DNA 分析的案例验证  47-58
  4.1 实际案例混合 DNA 的分析  47-56
  4.2 实际案例混合 DNA 分析的结果  56-58
第五部分讨论  58-61
  5.1 限制性组合分析法的适用范围  58-59
  5.2 同一混合比的三次重复模拟混合 DNA 的分析有何差异  59
  5.3 经验主义分析法  59-60
  5.4 法医学应用  60-61
参考文献  61-64
附录A  64-143
附录B  143-174
综述  174-180
  参考文献  178-180
个人简历  180-181
致谢  181

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