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鼻咽癌甲基化谱的建立

作 者: 周晓莹
导 师: 黄光武
学 校: 广西医科大学
专 业: 耳鼻咽喉头颈外科
关键词: 鼻咽癌 cDNA表达芯片 甲基化 肿瘤抑制基因 FSTL1
分类号: R739.63
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
下 载: 94次
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内容摘要


鼻咽癌倾向于表观遗传学疾病,鼻咽癌特异性肿瘤抑制基因的启动子区CpG岛高甲基化导致其转录表达下调甚至沉默,丧失肿瘤抑制功能,成为鼻咽癌发病的重要机制。为大规模筛选出鼻咽癌中因高甲基化而失活的肿瘤抑制基因,我们利用高通量的cDNA表达芯片技术,以甲基转移酶抑制剂联合脱乙酰基酶抑制剂处理鼻咽癌细胞株CNE2和HONE1,分别与未经处理的细胞株进行差异表达的基因的筛选。整合两张芯片处理后表达上调的基因,再以具有CpG岛为条件,初步筛选出鼻咽癌甲基化谱389个基因。挑选甲基化谱中4个基因FSTL1, MAEL, TFPI2和SPARC进行验证。利用半定量RT-PCR检测处理前后细胞中上述基因的表达改变情况。结果显示这4个基因经过5-aza-dC处理后不同程度的表达上调,为鼻咽癌候选肿瘤抑制基因。另外我们对感兴趣的基因FSTL1进行DNA甲基化的验证。发现鼻咽癌组织中FSTL1的表达水平显著低于正常鼻咽组织水平;FSTL1基因启动子区CpG岛高甲基化可在100%(6/6)的鼻咽癌细胞系和68.6%(24/35)的原发肿瘤中检测到,在正常鼻咽组织中则为非甲基化。鼻咽癌中FSTL1基因启动子区CpG岛高甲基化,这是其表达失活的直接原因。本课题研究的结果初步建立起鼻咽癌的甲基化谱,证实谱中FSTL1基因启动子CpG岛异常高甲基化导致其转录表达下调。

全文目录


论文摘要  4-6
ABSTRACT  6-8
论文正文  8-57
  前言  8-11
  第一部分 鼻咽癌甲基化谱的建立  11-25
    1 材料和方法  11-16
    2 结果  16-20
    3 讨论  20-25
  第二部分 验证基因芯片部分结果  25-54
    1 材料和方法  27-44
    2 结果  44-50
    3 讨论  50-54
  全文总结  54-55
  参考文献  55-57
附录 (硕士研究生期间发表综述)  57-68
缩略词表  68-69
致谢  69

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中图分类: > 医药、卫生 > 肿瘤学 > 耳鼻咽喉肿瘤 > 咽肿瘤
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