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中国荷斯坦牛SERPINA1和POU1F1基因多态性对产奶性状影响研究

作　者: 杨海
导　师: 王力生；仲跻峰
学　校: 安徽农业大学
专　业: 动物营养与饲料科学
关键词: 中国荷斯坦牛 SERPINA1基因 POU1F1基因多态性关联
分类号: S823
类　型: 硕士论文
年　份: 2008年
下　载: 47次
引　用: 3次
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内容摘要

随着养殖业对奶牛生产水平的要求不断提高,需要明确对生产性能有主效作用的数量性状基因效应,以加快通过后裔测定的育种改良速度。本试验选择了中国荷斯坦牛的SERPINA1基因和POUIF1基因作为功能候选基因进行研究,通过单核苷酸多态性和统计模型分析,以期为中国荷斯坦牛育种提供分子标记辅助选择的依据。试验采集220头系谱资料齐全、生产记录完整的中国荷斯坦牛血样。对牛SERPINA1基因运用PCR-RFLP、CRS-PCR、MAMA-PCR和PCR-SSCP技术,以及牛POU1F1基因的第六外显子运用PCR-RLP技术进行多态性分析,并进行各位点多态性与产奶性状(产奶量,乳蛋白率,乳脂率,体细胞评分)关联分析。研究表明,中国荷斯坦牛SERPINA1基因第五外显子没有多态性;第二外显子的5504,5609,5624和5747位点,以及第4外显子的8178位点这五个多态位点均存在多态性。除了8178位点外,5504,5609,5624和5747位点均符合哈迪-温伯格平衡。多态信息含量分析显示,此五个多态位点均呈中度多态。对5个多态位点的基因型与奶牛性状(产奶量,乳蛋白率,乳脂率以及体细胞评分)的关联分析显示,五个多态位点不同基因型对产奶量、乳蛋白率和乳脂率的影响均不显著(P＞0.05)。仅5747位点的不同基因型对SCS有明显的影响(P＜0.05)。因此,5747位点初步可以作为中国荷斯坦牛抗乳腺炎的分子标记。分析中国荷斯坦牛POUIF1基因第六外显子的遗传多态性表明,样本群体在该位点符合哈迪-温伯格平衡。其多态信息含量呈中度多态。其多态信息含量呈中度多态。将其遗传多态性与产奶性状进行关联分析表明,该位点对乳脂率、产奶量以及SCS影响不显著(P＞0.05);GG基因型奶牛平均乳蛋白率较高(P＜0.05)。POU1F1基因的该SNP初步可以作为影响中国荷斯坦牛乳蛋白率的分子标记,可以通过扩大试验进一步验证。

全文目录

中文摘要  4-5
Abstract  5-6
英文缩写一览表  6-9
文献综述  9-18
引言  18-19
1 材料与方法  19-29
  1.1 试验材料  19-21
    1.1.1 试验动物  19
    1.1.2 主要仪器设备  19-20
    1.1.3 溶液试剂配制  20-21
    1.1.4 主要分子生物学软件  21
  1.2 试验方法和步骤  21-22
    1.2.1 奶牛DNA的提取  21-22
    1.2.2 基因组DNA浓度和纯度的检测  22
  1.3 SERPINA1基因和POU1F1基因多态性的检测方法  22-27
    1.3.1 SERPINA1基因和POU1F1引物的设计与合成  22-23
    1.3.2 最佳PCR条件的建立  23-24
    1.3.3 PCR产物的测序方法  24-25
    1.3.4 a1-AT和POU1F1基因SNP酶切反应条件  25
    1.3.5 SERPINA1基因外显子Ⅱ和外显子Ⅴ的PCR-SSCP分析方法  25-27
  1.4 统计分析  27-29
    1.4.1 多态性统计方法  27-28
    1.4.2 相关性统计方法  28-29
2 结果与分析  29-38
  2.1 基因组DNA的提取  29
  2.2 SERPINA1基因和POU1F1基因的突变位点  29-31
  2.3 SERPINA1和POU1F1基因的基因分型  31-33
  2.4 SERPINA1基因的PCR-SSCP检测  33
  2.5 中国荷斯坦牛SERPINA1和POU1F1基因多态性分析  33-34
  2.6 产奶性状均值分析  34
  2.7 SERPINA1和POU1F1基因多态性与产奶性状关联分析  34-38
3 讨论  38-42
  3.1 影响PCR的有效扩增问题  38
  3.2 关于建立碱基错配检测SERPINA1基因SNP的方法  38-39
  3.3 关于SERPINA1和POU1F1对产奶性状的影响  39-40
  3.4 关于统计分析模型的选择  40-41
  3.5 存在的问题及展望  41-42
4 结论  42-43
参考文献  43-50
致谢  50-51
作者简介  51-52
在读期间发表的学术论文  52

中国荷斯坦牛SERPINA1和POU1F1基因多态性对产奶性状影响研究

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