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中国沿海蛾螺科5属10种的系统学分析

作　者: 董长永
导　师: 侯林
学　校: 辽宁师范大学
专　业: 海洋生物学
关键词: 蛾螺科系统学 18S rRNA 28S rRNA COI
分类号: S917.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2008年
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内容摘要

蛾螺科属于软体动物门(Mollusca),腹足纲(Gastropoda),在全世界有数百种。目前已报道在我国分布的蛾螺科种类有13个属,约31个种,但其系统学和一些种类的分类地位仍存在较大的争议。本研究利用核糖体小亚基18S rRNA基因、核糖体大亚基28S rRNA基因及线粒体COI基因的部分序列对我国辽宁、山东、福建沿海蛾螺科内5个属10个种的系统发生进行了分析。通过PCR分别获得了大约1800bp、1400bp和700bp的片段,测序之后,通过遗传分析软件对序列进行了比对分析,利用Neighbor-joining (NJ)法、Minimum evolution (ME)法和Maximum parsimony(MP)法建立了系统树。结果显示,所研究的蛾螺科5属10种可以被分为5个亚群:第一大分支为香螺亚群,包括Neptunea属的香螺、新英格兰蛾螺、Neptunea eulimata Dall、和一个未知种以及Siphonalia属的略胀管蛾螺;第二个分支为侧平肩螺亚群;第三个分支为水泡蛾螺和黄海蛾螺亚群;第四个分支为褐管蛾螺亚群;第五个分支为方斑东风螺亚群。由系统学分析可知,香螺是蛾螺科中较为进化的种;未知种为香螺属内的种;略胀管蛾螺与Neptunea属的种类亲缘关系较近,建议将略胀管蛾螺归为Neptunea属。

全文目录

摘要  3-4
Abstract  4-7
1 前言  7-18
  1.1 腹足纲动物的分类情况  7
  1.2 腹足纲系统学研究概况  7-11
    1.2.1 形态学研究  7-9
    1.2.2 细胞学研究  9-10
    1.2.3 分子标记研究  10-11
    1.2.4 分子系统学研究在分类学和进化研究中的局限性与分歧  11
  1.3 展望  11-12
  1.4 蛾螺科的概况  12-13
  1.5 本研究进行系统学分析所用的基因特点及应用  13-15
    1.5.1 核糖体基因  13-14
    1.5.2 线粒体基因  14-15
  1.6 本研究的目的和意义  15-18
2 材料与方法  18-29
  2.1 实验材料及仪器试剂  18-22
    2.1.1 材料采集  18
    2.1.2 主要试剂  18-22
    2.1.3 主要仪器  22
  2.2 方法  22-29
    2.2.1 总 DNA 的提取  22-23
    2.2.2 PCR  23-25
    2.2.3 目的片段的纯化  25-26
    2.2.4 目的片段克隆  26-28
    2.2.5 测序  28
    2.2.6 序列分析  28-29
3 结果  29-49
  3.1 总DNA 的提取结果  29
  3.2 PCR  29-31
    3.2.1 18S rRNA 基因PCR 结果  29-30
    3.2.2 28S rRNA 基因PCR 结果  30-31
    3.2.3 COI 基因 PCR 结果  31
  3.3 序列分析  31-38
    3.3.1 18S rRNA 测序比对结果  31-34
    3.3.2 28S rRNA 测序比对结果  34-37
    3.3.3 COI 基因测序比对结果  37-38
  3.4 序列分析  38-49
    3.4.1 18S rRNA 基因序列分析结果  38-42
    3.4.2 28S rRNA 基因序列分析结果  42-45
    3.4.3 COI 基因序列分析结果  45-49
4 讨论  49-55
  4.1 蛾螺科5 属10 种的形态学描述  49-50
  4.2 18S rRNA 基因序列分析  50-51
    4.2.1 18S rRNA 基因的序列分析  50-51
    4.2.2 基于18S rRNA 基因的系统学分析  51
  4.3 28S rRNA 基因序列分析  51-53
    4.3.1 28S rRNA 基因的序列分析  51-52
    4.3.2 基于28S rRNA 基因的系统学分析  52-53
  4.4 COI 基因分析  53-54
    4.4.1 COI 基因的序列分析  53
    4.4.2 基于COI 基因的系统学分析  53-54
  4.5 对三个基因总的系统学分析  54-55
5 结论  55-56
参考文献  56-64
致谢  64-65
个人简历  65
论文发表情况  65

中国沿海蛾螺科5属10种的系统学分析

内容摘要

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