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拟南芥PGABH和AspRS的表达分析及功能鉴定
作 者: 赵东晓
导 师: 吴长艾;郑成超
学 校: 山东农业大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: ABA 天冬氨酰-tRNA合成酶 未知功能基因 生长发育
分类号: Q943
类 型: 硕士论文
年 份: 2010年
下 载: 42次
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内容摘要
拟南芥PGABH基因(Post Germination ABA Hypersensitive Gene)是一个功能未知的基因。另外,氨酰-tRNA合成酶是一类催化特定氨基酸或其前体与对应tRNA发生酯化反应而形成氨酰-tRNA的酶。近年来的研究表明,氨酰-tRNA合成酶还具有基因表达调控、调节氨基酸合成、信号传导等方面的功能。天冬氨酰-tRNA合成酶(AspRS)属于Ⅱ类氨酰-tRNA合成酶,目前关于AspRS在植物体中的新功能的研究尚未有报道。因此本实验从拟南芥PGABH基因的缺失突变体pgabh-1和AtAspRS超表达植株入手,首次对拟南芥中PGABH的功能和AtAspRS的新功能进行了初步探讨,为揭示研究两基因的功能和作用机理奠定了良好的基础。对于PGABH的研究结果如下:1. PlantCARE分析发现PGABH启动子中含有一个与ABA信号响应相关的ABRE-like元件,还含有与光调控有关的AAAC元件,G-Box元件和Sp1元件等。通过GUS染色和qRT-PCR的方法研究其组织表达模式,发现PGABH主要在拟南芥地上绿色组织,花器官中的柱头和花药中表达。qRT-PCR结果还表明PGABH在子叶生长初期表达量急剧升高,但ABA处理抑制其表达。这些结果表明PGABH可能参与了ABA介导的子叶初期生长和光调控的开花过程。2.为了研究该基因的功能,我们获得了PGABH缺失突变体pgabh-1。对突变体进行萌发实验,结果表明ABA抑制突变体pgabh-1子叶生长初期的绿化过程。3. pgabh-1在长日照条件下表现出叶片小,开花提前等表型,对开花相关基因进行了RT-PCR分析,结果表明PGABH缺失突变明显改变了开花基因CO和FT的表达,说明PGABH对开花时间的影响可能是通过调节CO和FT的表达来实现的。对于AtAspRS的研究结果如下:1.通过GUS染色和qRT-PCR的方法对AtAspRS启动子进行组织表达分析,发现AtAspRS主要维管组织,茎尖生长点,侧根中表达。2.正常生长条件下,AtAspRS超表达植株在在幼苗期幼叶黄化并最终导致植株死亡;抽薹期黄化导致花序轴变短、结实率降低。不同转基因株系出现黄化表型的几率不同,表型的出现率与AtAspRS超表达量正相关。叶绿素含量分析表明超表达AtAspRS使转基因株系的叶绿素a含量降低,表明AtAspRS超表达影响了叶绿素a的合成或加速了其降解。3.为了了解AtAspRS超表达植株黄化表型出现的原因,我们对AtAspRS转基因植株和野生型植株进行了表达谱分析,结果表明黄化的AtAspRS超表达植株体内有6193个基因的表达发生了显著的变化。这些基因参与了胁迫响应,生长发育,生物及非生物刺激响应,蛋白质代谢和基因转录等过程。其中检测到23个叶绿体基因表达相关基因均呈现下降趋势。这些结果进一步说明AtAspRS超表达影响了叶绿素的合成。
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全文目录
符号说明 4-6 目录 6-9 中文摘要 9-11 Abstract 11-13 1 前言 13-32 1.1 脱落酸研究进展概述 13-24 1.1.1 脱落酸的发现 13 1.1.2 植物体中脱落酸的作用 13-22 1.1.2.1 促进果实成熟 13-14 1.1.2.2 促进气孔关闭 14-16 1.1.2.3 促进种子休眠 16-18 1.1.2.4 提高植物抗干旱能力 18-19 1.1.2.5 提高植物的抗低温能力 19-20 1.1.2.6 提高植物对盐胁迫的抗性 20-21 1.1.2.7 提高植物的抗缺素能力 21-22 1.1.3 脱落酸受体研究进展 22-24 1.2 氨酰-tRNA 合成酶 24-30 1.2.1 氨酰-tRNA 合成酶的结构及分类 24-28 1.2.2 氨酰-tRNA 合成酶的功能 28-30 1.2.2.1 参与基因表达调控 28-29 1.2.2.2 调节rRNA 合成 29-30 1.2.2.3 RNA 剪切细胞因子 30 1.2.2.4 抑制细胞凋亡 30 1.2.3 天冬氨酰-tRNA 合成酶的研究进展 30 1.3 本研究的目的与意义 30-32 2 材料与方法 32-46 2.1 实验材料 32-34 2.1.1 植物材料 32 2.1.2 菌株与质粒 32 2.1.3 酶与各种生化试剂 32 2.1.4 实验用的引物 32-34 2.2 实验方法 34-46 2.2.1 RNA 的提取 34-35 2.2.1.1 利用TRIzol 法提取RNA 34 2.2.1.2 利用通用植物总RNA 提取试剂盒(离心柱型)提取RNA 34-35 2.2.2 RNA 中基因组DNA 的去除 35 2.2.3 RNA 反转录 35 2.2.4 拟南芥基因组DNA 的提取(小量法) 35-36 2.2.5 拟南芥PGABH 和AspRS 序列的扩增 36 2.2.6 凝胶电泳中DNA 片段的回收 36-37 2.2.7 DNA 片段与克隆载体的连接 37 2.2.8 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化 37-38 2.2.8.1 大肠杆菌感受态细胞的制备 37-38 2.2.8.2 大肠杆菌细胞的转化 38 2.2.9 克隆载体的酶切鉴定 38 2.2.10 质粒DNA 的提取 38-39 2.2.10.1 碱法小量质粒DNA 的提取 38-39 2.2.10.2 碱法大量质粒DNA 的提取 39 2.2.11 表达载体的构建 39-40 2.2.12 植物表达载体的转化 40-41 2.2.12.1 根癌农杆菌LBA4404、GV3101 感受态细胞的制备 40 2.2.12.2 冻融法转化农杆菌 40-41 2.2.13 农杆菌的培养 41 2.2.14 农杆菌介导的拟南芥转化 41 2.2.15 农杆菌介导的洋葱表皮细胞转化 41-42 2.2.16 转基因拟南芥PCR 检测 42-43 2.2.17 PCR 鉴定突变体纯合植株 43 2.2.18 qRT-PCR 43-44 2.2.18.1 qRT-PCR 引物设计 43-44 2.2.18.2 qRT-PCR 反应条件 44 2.2.19 转基因拟南芥植株GUS 组织化学染色分析 44-45 2.2.20 叶绿素含量的测定 45-46 3 结果与分析 46-60 3.1 PGABH 的启动子分析 46 3.2 PGABH 的表达分析 46-48 3.3 PGABH 在拟南芥中的功能鉴定 48-53 3.3.1 PGABH 缺失突变体pgabh-1 及互补突变体植株的获得 48-49 3.3.2 ABA 抑制pgabh-1 子叶初期生长 49-51 3.3.3 子叶生长初期ABA 处理使PGABH 表达下调 51 3.3.4 PGABH 影响拟南芥植株发育及开花时间 51-52 3.3.5 PGABH 对拟南芥中开花相关基因的调控 52-53 3.4 AtAspRS 的组织表达分析 53-54 3.5 AtAspRS 在拟南芥中的功能鉴定 54-57 3.5.1 AtAspRS 超表达植株的表型 54-56 3.5.2 AtAspRS 超表达植株中叶绿素含量测定 56-57 3.6 AtAspRS 超表达植株的表达谱分析 57-60 4 讨论 60-62 4.1 PGABH 介导了ABA 调控子叶初期生长过程 60 4.2 PGABH 调控拟南芥开花时间 60-61 4.3 AspRS 在拟南芥中的功能探究 61-62 5 结论 62-63 6 参考文献 63-74 7 附录 74-76 8 致谢 76-77 9 攻读学位期间发表论文情况 77
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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物细胞遗传学
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