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MiR396在烟草中的功能分析
作 者: 杨凤玺
导 师: 余迪求
学 校: 中国科学院研究生院(西双版纳热带植物园)
专 业: 植物学
关键词: miR396 NtGRF-like 窄叶 干旱 气孔数目 韧皮部运输
分类号: S572
类 型: 硕士论文
年 份: 2009年
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内容摘要
植物MicroRNAs (miRNAs)是由具有发夹结构的单链RNA前体(约70-90个碱基大小)经过Dicer-like酶加工后生成的具有调控功能且大小约21个碱基的小分子RNA。MiR396是Jones-Rhoades等于2004年首先在拟南芥中发现的,同时通过5’RACE证实了部分AtGRF基因家族成员(AtGRF1、AtGRF2、AtGRF3、AtGRF7、AtGRF8、AtGRF9)是miR396的靶基因。EST序列分析发现miR396在15个不同的物种中存在,是高度保守的小分子,并且其初始转录体和成熟的miRNA都具有高度保守性,特别是成熟miRNA序列及其互补序列,这表明miR396可能在植物发育方面具有重要且保守的功能。利用其高度保守性,本研究通过在烟草中高表达拟南芥miR396来分析miR396在烟草中的功能。用拟南芥miR396a互补序列做探针,通过Northern杂交检测后,发现烟草中有很高的miR396的表达水平,也证实了烟草中miR396的存在。我们采用基因克隆的方法将拟南芥miR396前体a重组为高表达质粒35S::AthMIR396a)后,通过农杆菌侵染叶片法获得转基因烟草。miR396的高表达转基因植株中,miR396的表达量比对照明显增强,经观察发现miR396高表达转基因烟草植株矮化且叶片变窄,花发育异常,这些与本实验室之前的研究结果,即miR396通过负调控AtGRF1-AtGRF3来调控叶的形态发育导致高表达miR396的拟南芥转基因植株矮化且叶片变窄相一致。通过搜索烟草EST数据库,我们得到四个与AtGRF高度同源并具有WRC保守域的EST序列)GenBank Ace:FG137771, FG165999, FG167390和FG194560),同时他们都含有与miR396互补序列,由此我们推测它们为miR396在烟草中潜在的靶基因。RT-PCR分析结果表明高表达转基因烟草中除了FG167390外其余三个EST序列的mRNA水平明显降低,从而证实了我们的假设,即miR396在烟草中负调控NtGRF-like基因。MiR396受干旱诱导表达,同时miR396也可以提高烟草的耐旱性。MiR396高表达转基因植株矮小,叶变窄,是耐旱植物的典型特征。野生型和转基因植株在相同的环境生长8周后,进行干旱处理3周。结果发现35S::MIR396a转基因植株仍能正常生长且比三周前有明显长高,而野牛型已完全萎蔫。用10%PEG6000处理3周大幼苗4小时也得到同样的结果。为了阐明miR396提高拟南芥抗旱性的机制,我们分别测定了高表达和对照植株的失水率和相对含水量,发现高表达植株有更强的保水能力。通过激光共聚焦扫描叶下表皮,发现miR396高表达转基因植株叶的气孔密度降低。由于大部分水分是通过气孔扩散的,且通过气孔的蒸腾量一般可达与叶面积相同的自由水面蒸发量的50%,甚至可达100%,所以气孔密度降低会提高拟南芥的保水能力,有利于拟南芥在干旱环境下生长。另外我们检测了小分子在植物体内的传递,发现将高表达miR396的转基因烟草植株去顶接上野生型嫩芽,生长4周后野生型嫩芽新生的叶片中的miR396表达量提高;而将野生型植株作为砧木上接高表达miR396的转基因嫩芽生长4周后,野生型砧木新生的侧枝嫩叶中miR396表达量无明显变化,说明miR396能延茎轴方向向上传递而不能往下运输。综上所述,miR396可以通过负调控NtGRF-like来调控叶的形态发育;miR396提高拟南芥的抗旱性是由于miR396高表达导致植株矮化、叶变窄、气孔密度降低;同时我们检测到miR396能延茎轴方向向上传递,暗示miR396可能参与依赖韧皮部运输的信号传导。
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全文目录
摘要 6-8 Abstract 8-11 第一章 前言 11-23 1.1 植物microRNAs鉴定 11-12 1.2 植物microRNAs的发生及其作用机制 12-16 1.2.1 植物microRNAs的发生 12-15 1.2.2 microRNAs的作用机制 15-16 1.3. 植物microRNAs的调节作用 16-21 1.3.2 植物microRNA对生长发育的调节作用 16-18 1.3.3 植物microRNA对逆境胁迫应答的调节作用 18-21 1.4 拟南芥中的miR396及其靶基因 21-23 第二章 材料与方法 23-31 2.1 实验材料 23-24 2.1.1 植物材料 23 2.1.2 菌株与质粒 23-24 2.2 所用试剂 24 2.3 实验方法 24-31 2.3.1 质粒构建 24 2.3.2 玻璃珠法胶回收DNA 24-25 2.3.4 质粒DNA转化大肠杆菌 25 2.3.5 Mini质粒DNA提取 25-26 2.3.6 2×CTAB法提取总DNA 26 2.3.7 农杆菌感受态制备及转化 26 2.3.8 LiCl法大量提取RNA 26-27 2.3.9 Trizol小量提取RNA 27 2.3.10 Northern杂交 27-29 2.3.11 MicroRNA杂交(Northern杂交) 29-31 第三章 结果 31-49 3.1 miR396的保守性 31-32 3.2 高表达转基因植株获得 32-34 3.3 窄叶表型 34-35 3.4 窄叶机制 35-38 3.5 其他表型 38-41 3.5.1 顶端优势减弱侧枝数目增加 38 3.5.2 叶片数增多 38-39 3.5.3 花器官发育异常 39-41 3.6 抗旱性 41-43 3.6.1 干旱处理诱导烟草miR396表达 41-42 3.6.2 高表达miR396提高烟草抗旱性 42-43 3.7 抗旱机制 43-46 3.7.1 高表达miR396转基因烟草保水能力增强 43-44 3.7.2 高表达miR396转基因烟草叶面气孔减少 44-46 3.8 小分子传递 46-49 第四章 讨论 49-52 4.1 高表达拟南芥miR396的方法对于研究miR396在烟草中的功能切实可行 49 4.2 miR396在烟草中负调控NtGRF-like 49-50 4.3 miR396在烟草中调节花器官发育 50-51 4.4 小分子传递 51-52 参考文献 52-63 论文目录 63-64 致谢 64-65
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中图分类: > 农业科学 > 农作物 > 经济作物 > 烟草(菸草)
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