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天府肉羊GH基因多态性及其与生长性状的关联性研究

作　者: 李韵
导　师: 徐刚毅
学　校: 四川农业大学
专　业: 动物遗传育种与繁殖
关键词: GH基因 PCR-SSCP 生产性状 头色 天府肉羊
分类号: S826
类　型: 硕士论文
年　份: 2008年
下　载: 42次
引　用: 2次
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内容摘要


本实验以四川农业大学新近选育成功的250只天府肉羊为试验材料,其中黑头羊41只(B)、红头羊137只(R),白头羊72只(W),采用PCR-SSCP方法检测生长激素基因(GH)外显子2、3、5区域的多态性及其与生长性状的相关性,结果表明:3对引物的扩增片段均存在多态性,外显子2、3、5区域内各检测到1个变异位点,共计3个变异位点,分别为669bp、1057bp和1830bp处。669bp处为G→A的单碱基突变(Gly35Ser),1057bp处为G→A的单碱基突变(Gly89Ser),1830bp处T→C的单碱基突变。669位点在天府肉羊群体中存在等位基因A和B,基因频率分别为0.534和0.466。有三种基因型:AA、AB和BB,基因频率分别为0.152、0.764和0.084。AB基因型的2月龄体重、6月龄体重和体长及周岁体高显著高于AA和BB型(P＜0.05);AB基因型的成年体重、体高、体长和胸围极显著高于AA和BB型(P＜0.01);AB基因型的周岁体重极显著高于BB型(P＜0.01),显著高于AA型(P＜0.05),AB型的周岁体长和胸围极显著高于AA型(P＜0.01),显著高于BB型(P＜0.05)。1057位点在天府肉羊群体中存在等位基因C和D,基因频率分别为0.734和0.266。有三种基因型:CC、CD和DD,基因频率分别是0.652、0.184和0.164。CC基因型的成年体重极显著高于CD型和DD型(P＜0.01),CC型和DD型的6月龄胸围极显著高于CD型(P＜0.01)。1830位点在天府肉羊群体中存在等位基因E和F,基因频率为0.722和0.278。有三种基因型:髓、EF和FF,基因型频率分别是0.64、0.164和0.196。EE基因型与FF基因型2月龄体长的差异不显著,均显著高于EF型(P＜0.05);FF型的2月龄胸围显著高于EF型(P＜0.05),EE型与EF型和FF型的差异不显著(P＞0.05);EF型和FF型的周岁胸围差异不显著,均显著高于EE型(P＜0.05);EF型的成年胸围极显著高于EE型(P＜0.01)。R和W头系各阶段的体重差异不显著(P＞0.05),均显著高于B头系(P＜0.05);其余生长性状差异不显著。外显子2、3、5的多态信息含量分别为0.374,0.314和0.375,均为中度多态,表明以上三个位点在群体中有较高的遗传变异。3个位点的χ~2值检验均极显著的偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.01)。

全文目录


中文摘要  5-7
英文摘要  7-11
1 文献综述  11-19
  1.1 概述  11-14
    1.1.1 生长激素的发现和作用  11
    1.1.2 GH的表达和调控  11-14
  1.2 GH基因的研究进展  14-17
    1.2.1 GH基因的结构、定位  14
    1.2.2 GH基因在家畜上的研究  14-17
  1.3 山羊生产性能的研究  17-18
  1.4 本试验的理论依据  18
  1.5 研究背景  18-19
  1.6 本研究的目的和意义  19
2 材料与方法  19-29
  2.1 试验材料  19-21
    2.1.1 采集血样  19-20
    2.1.2 主要仪器设备  20
    2.1.3 引物合成  20
    2.1.4 主要试剂及配制  20-21
  2.2 试验方法  21-27
    2.2.1 总DNA的提取  22
    2.2.2 DNA浓度和纯度的检测  22-23
    2.2.3 引物的设计与合成  23-24
    2.2.4 PCR产物的检测  24-25
    2.2.5 PCR扩增的PCR-SSCP分析及基因型判定  25-27
  2.3 数据处理与统计分析  27-29
3 试验结果  29-39
  3.1 基因组DNA抽提结果  29-30
  3.2 PCR扩增结果  30-31
  3.3 PCR-SSCP多态性检测结果  31-32
  3.4 GH基因3‘端部份序列测序结果  32-33
  3.5 天府肉羊GH基因基因频率和基因型频率分析  33-35
    3.5.1 669位点的基因频率和基因型频率分析  33-34
    3.5.2 1057位点的基因频率和基因型频率分析  34
    3.5.3 1830位点的基因频率和基因型频率分析  34-35
    3.5.4 群体的χ~2检验、多态信息含量、杂合度及有效等位基因数  35
  3.6 GH基因不同多态位点与天府肉羊生长性状的关联分析  35-38
    3.6.1 位点669不同基因型与生长性状的关联分析  35-36
    3.6.2 位点1057不同基因型与生长性状的关联分析  36-37
    3.6.3 位点1830不同基因型与生长性状的关联分析  37-38
  3.7 不同头色与生长性状的关联分析  38-39
4 讨论  39-44
  4.1 关于实验方法的优化  39-40
    4.1.1 DNA抽提方法的优化  39-40
    4.1.2 PCR-SSCP技术的优化  40
  4.2 GH基因在天府肉羊中遗传特性的分析  40-41
  4.3 天府肉羊GH基因核苷酸多态位点分析  41
  4.4 GH基因对天府肉羊经济性状的影响  41-42
    4.4.1 GH基因外显子2多态位点各基因型与生长性状的关系  41-42
    4.4.2 GH基因外显子3多态位点各基因型与生长性状的关系  42
    4.4.3 GH基因外显子5多态位点各基因型与生长性状的关系  42
  4.5 不同头色对天府肉羊经济性状的影响  42
  4.6 天府肉羊群体遗传多样性与保护  42-43
  4.7 GH基因的应用前景  43-44
5 结论  44-45
参考文献  45-50
致谢  50

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 > 羊
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