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平邑甜茶新根细胞死亡及其抗凋亡基因的表达研究
作 者: 樊树雷
导 师: 杨洪强
学 校: 山东农业大学
专 业: 果树学
关键词: 平邑甜茶 MhBI-1 抗凋亡基因 2,4-D 干湿交替
分类号: S661.1
类 型: 硕士论文
年 份: 2013年
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内容摘要
平邑甜茶(Malus hupehensis(Pamp)Rehd.var pinyiensis Jiang)是我国特有的苹果砧木。本研究以平邑甜茶为试材,结合苹果基因组数据库http://genomics.research.iasma.it/,克隆了平邑甜茶MhBI-1基因的完整编码区序列,分析了其基因序列与编码蛋白的性质和功能,并成功构建了MhBI-1基因正反义表达载体;同时获取了苹果MdBI-1s家族基因序列,研究了它们在苹果不同品种、不同组织以及在平邑甜茶根不同生长时期及高温胁迫下的表达情况。此外,还研究了平邑甜茶新根(延长根和吸收根)抗凋亡基因MhBI-1、MhBAG、MhHSP70在正常管理、2,4-D及干湿交替作用下的表达情况。主要结果如下:1)获得了平邑甜茶MhBI-1基因,该基因编码区序列长747bp,编码248个氨基酸,GenBank登录号为KC456613。2)获得了苹果MdBI-1s家族基因,该基因家族共有10个基因,构建了该基因家族系统进化树,并对其表达特征进行了半定量测定。半定量RT-PCR结果表明,MdBI-1s表达有一定的相似性,在茎中的表达高于叶和根;在新疆野苹果中的表达高于山定子、平邑甜茶和八棱海棠。在幼苗阶段,随生长时间,MdBI-1s表达呈现先上升后下降趋势,六叶龄期时达到高峰;42℃高温胁迫下,MdBI-1s表达随胁迫程度的加剧呈现先上升后下降趋势,2h时到达高峰。3)构建了pET-30a-MhBI-1原核表达载体,进行了原核表达试验,测定MhBI-1蛋白大小约为25kD。4)构建了pBI121-MhBI-1正反义表达载体,通过花序侵染法转化拟南芥得到T0代种子。5)正常生长时,吸收根细胞死亡率及相关代谢活性:根系活力、ATP含量和类caspase3/7活性变化呈现波动性,相对于延长根,其水平高且变化频率快,抗凋亡基因MhHSP70、MhBI-1和MhBAG在吸收根中表达也呈现相似的特点,反映了吸收根生命周期短,更新速度快与代谢活跃的特点。延长根变化相对稳定,呈现“台阶式变化”,活跃期后呈现出生长抑制阶段,在这个过程中,延长根MhHSP70、MhBI-1基本处于被抑制状态,MhBAG出现了明显的表达高峰,这可能与延长根的生长状态有关。6)在2,4-D及干湿交替作用下,新根出现了细胞死亡率及类caspase3/7活性升高,ATP含量及根活力下降,抗凋亡基因表达升高的趋势。抗凋亡基因的高表达有利于减少细胞凋亡的发生;在抗凋亡基因表达高峰时,延长根抗凋亡基因升高倍数明显高于吸收根,暗示延长根有更好的抗凋亡能力。在2,4-D处理早期,吸收根细胞死亡率的上升倍数与根系活力的下降幅度均高于延长根;干湿交替作用过程中,复水后延长根细胞死亡率变化相比吸收根呈现滞后性,这些说明吸收根对2,4-D和干湿交替的反应比延长根灵敏。
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全文目录
英文缩写符号及中英文对照表 4-9 中文摘要 9-11 英文摘要 11-13 1 前言 13-19 1.1 细胞程序性死亡的分类及其特征 13-14 1.2 细胞程序性死亡发生的调控 14-16 1.2.1 Caspase 细胞死亡执行者 14-15 1.2.2 Bcl-2 家族 细胞死亡的调节阀 15-16 1.3 细胞程序性死亡相关基因及其功能 16-18 1.3.1 BI-1 的结构与功能 16 1.3.2 HSP70 的结构与功能 16-17 1.3.3 BAG 的结构与功能 17-18 1.4 本研究目的和意义 18-19 2 材料与方法 19-32 2.1 试验材料 19-21 2.1.1 试材 19 2.1.2 菌株与质粒 19 2.1.3 酶及生化试剂 19 2.1.4 PCR 引物 19-21 2.2 试验处理 21 2.2.1 不同品种、组织苹果砧木处理 21 2.2.2 不同生长时期处理 21 2.2.3 高温胁迫处理 21 2.2.4 正常生长管理处理 21 2.2.5 2,4-D 处理 21 2.2.6 干湿交替处理 21 2.3 试验方法 21-32 2.3.1 平邑甜茶总 RNA 的提取 21-22 2.3.2 RT-PCR 反转录合成 cDNA 22 2.3.3 MhBI-1 序列的扩增 22-24 2.3.3.1 PCR 扩增 MhBI-1 保守序列 22-23 2.3.3.2 3'-RACE 扩增 3' 端序列 23 2.3.3.3 琼脂糖凝胶电泳 23 2.3.3.4 测序分析 23-24 2.3.4 DNA 片段与克隆载体的连接 24 2.3.5 制备和转化大肠杆菌感受态细胞 24 2.3.5.1 制备大肠杆菌感受态细胞 24 2.3.5.2 大肠杆菌感受态细胞的转化 24 2.3.6 质粒 DNA 的提取 24-25 2.3.7 凝胶电泳中 DNA 片段的回收 25 2.3.8 质粒 DNA 的酶切鉴定 25-26 2.3.9 目的片段与表达载体的连接 26 2.3.10 基因测序 26 2.3.11 pET-30a-MhBI-1 原核表达载体的构建 26-27 2.3.12 原核表达重组菌株的诱导表达及电泳分析 27 2.3.13 pBI121-正义/反义表达载体的构建 27-28 2.3.14 制备与转化根癌农杆菌 GV3101 感受态细胞 28 2.3.14.1 制备根癌农杆菌 GV3101 感受态细胞 28 2.3.14.2 冻融法转化农杆菌 28 2.3.15 拟南芥转化及转化植株的 PCR 鉴定 28-29 2.3.15.1 拟南芥转化 28-29 2.3.15.2 转基因植株筛选及鉴定 29 2.3.16 半定量 RT-PCR 分析 29 2.3.17 实时荧光定量 PCR 鉴定 29-30 2.3.18 生物信息学分析 30 2.3.19 细胞死亡率测定 30-31 2.3.20 类 caspases3/7 蛋白酶活性检测 31 2.3.21 根活力测定 31 2.3.22 ATP 含量测定 31-32 3 结果与分析 32-48 3.1 平邑甜茶抗凋亡基因 MhBI-1 克隆及其表达分析 32-39 3.1.1 MhBI-1 基因的克隆与序列分析 32-33 3.1.1.1 MhBI-1 保守序列的分离 32 3.1.1.2 MhBI-13’片段的分离 32 3.1.1.3 MhBI-1 基因的获得 32-33 3.1.2 平邑甜茶 MhBI-1 编码蛋白的结构分析 33-35 3.1.2.1 MhBI-1 蛋白的保守域分析 33-34 3.1.2.2 部分植物 BI-1 蛋白序列多重比对 34 3.1.2.3 MhBI-1 蛋白的系统进化树分析 34 3.1.2.4 MhBI-1 蛋白的理化性质分析 34-35 3.1.2.5 MhBI-1 蛋白的信号肽分析 35 3.1.2.6 MhBI-1 蛋白跨膜结构域预测 35 3.1.2.7 MhBI-1 蛋白亚细胞定位分析 35 3.1.2.8 MhBI-1 蛋白的二级结构预测 35 3.1.3 MhBI-1 原核表达分析 35-36 3.1.3.1 MhBI-1 原核表达载体的构建及原核表达 35-36 3.1.4 MhBI-1 植物表达载体构建及转化拟南芥 36-37 3.1.5 MdBI-1s 基因家族表达分析 37-39 3.1.5.1 MdBI-1s 在四种苹果砧木根、茎和叶中的表达 38 3.1.5.2 MdBI-1s 在平邑甜茶根生长发育过程中的表达 38-39 3.1.5.3 高温胁迫下平邑甜茶根 MdBI-1s 的表达 39 3.2 平邑甜茶吸收根和延长根细胞死亡及其抗凋亡基因表达 39-42 3.2.1 平邑甜茶延长根和吸收根细胞死亡率变化 39-40 3.2.2 平邑甜茶延长根和吸收根细胞死亡相关代谢变化 40-41 3.2.2.1 平邑甜茶延长根和吸收根根系活力的变化 40 3.2.2.2 平邑甜茶延长根和吸收根 ATP 含量的变化 40 3.2.2.3 平邑甜茶延长根和吸收根类 caspase3/7 活性变化 40-41 3.2.3 平邑甜茶延长根和吸收根 MhBI-1 表达变化 41 3.2.4 平邑甜茶延长根和吸收根 MhHSP70 表达变化 41-42 3.2.5 平邑甜茶延长根和吸收根 MhBAG 表达变化 42 3.3 2,4-D 对新根细胞死亡及抗凋亡基因表达的调节 42-45 3.3.1 新根细胞死亡率对 2,4-D 的响应 42-43 3.3.2 新根细胞死亡相关代谢对 2,4-D 的响应 43 3.3.2.1 新根根系活力对 2,4-D 的响应 43 3.3.2.2 新根 ATP 含量对 2,4-D 的响应 43 3.3.2.3 新根类 caspase3/7 活性对 2,4-D 的响应 43 3.3.3 新根 MhBI-1 对 2,4-D 的响应 43-44 3.3.4 新根 MhHSP70 对 2,4-D 的响应 44 3.3.5 新根 MhBAG 对 2,4-D 的响应 44-45 3.4 干湿交替作用下新根细胞死亡及抗凋亡基因表达 45-48 3.4.1 干湿交替作用下新根细胞死亡率变化 45 3.4.2 干湿交替作用下新根细胞死亡相关代谢的变化 45-47 3.4.2.1 干湿交替作用下新根根系活力的变化 45-46 3.4.2.2 干湿交替作用下新根 ATP 含量的变化 46 3.4.2.3 干湿交替作用下新根类 caspase3/7 活性变化 46-47 3.4.3 干湿交替作用下新根 MhBI-1 表达变化 47 3.4.4 干湿交替作用下新根 MhHSP70 表达变化 47 3.4.5 干湿交替作用下新根 MhBAG 表达变化 47-48 4 讨论 48-51 4.1 平邑甜茶 MhBI-1 基因的克隆及表达分析 48-49 4.1.1 平邑甜茶 MhBI-1 基因的克隆及生物信息学、原核表达分析 48 4.1.2 苹果 MdBI-1s 表达分析 48-49 4.2 平邑甜茶新根细胞死亡及其基因表达 49-51 4.2.1 平邑甜茶新根在正常管理下的死亡及其基因表达 49-50 4.2.2 2,4-D 及干湿交替作用下平邑甜茶新根死亡及其基因表达 50-51 5 结论 51-52 参考文献 52-61 致谢 61-62 攻读硕士学位期间发表论文情况 62
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中图分类: > 农业科学 > 园艺 > 果树园艺 > 仁果类 > 苹果
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