学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

三种养殖模式水体中细菌多样性及微生态制剂对它的影响

作　者: 李革雷
导　师: 陈昌福
学　校: 华中农业大学
专　业: 水产养殖
关键词: 16S rDNA克隆文库 细菌多样性 系统发育分析 沼泽红假单胞菌 枯草芽孢杆菌
分类号: S917.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 89次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载
 

内容摘要


采用16S rDNA克隆文库技术对位于武汉市少潭河水库养殖基地三种养殖模式水体中的细菌多样性以及微生态制剂(枯草芽孢杆菌和沼泽红假单胞菌)对水体中的细菌多样性的影响做了研究。根据放养鱼所占比例,将养殖模式分为模式1(MSH1)、模式2(MSH2)和模式3(MSH3)。3种模式中草鱼、鲢、异育银鲫是基础类群,而鳙鱼和匙吻鲟在不同模式中所占比例不同。结果表明：1.三种养殖模式水体中细菌16S rDNA克隆文库的序列分布于10个以上菌门,分别是变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、蓝藻细菌门(Cyanobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、梭杆菌门(Fusobacteria)和OP10等。2.多样性分析显示：MSH2的克隆文库多样性指数优于MSH1和MSH3,MSH3又优于MSH1。即水体中细菌的多样性随着鱼类多样性的增加而增加。3.草鱼为主养品种的池塘水体中蕴含丰富的细菌多样性。其中Proteobacteria是第一优势菌群,分别占三种模式总细菌的26%、22%和42%,它的亚群Betaproteobacteria(10%,10%和22%)是优势亚群,Bacteroidetes是第二优势菌群,分别占18%,22%和26%。4.水体中投放了沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)和枯草芽孢杆菌(bacillus subtilis)之后,各样品的克隆文库中包含的菌门较加菌前增加了厚壁菌门(Firmicutes)。5.3个时间点样品的克隆文库序列所分布的优势菌门与7号对照组一样,均为Proteobacteria、Bacteroidetes和Cyanobacteria。这3个优势菌门在8号和9号样品中所占比例随时间的变化呈上升趋势。这表明枯草芽孢杆菌和沼泽红假单胞菌使得水体中菌落结构趋于简单化,优势菌群更加优势。

全文目录


摘要  7-8
Abstract  8-9
第1章 文献综述  9-20
  1 养殖池塘微生物研究概述  9-14
    1.1 细菌生长的限制因素  9-10
    1.2 池塘细菌多样性的研究  10-14
      1.2.1 研究方法概述  10-14
      1.2.2 研究现状  14
  2 微生态制剂研究进展  14-18
    2.1 光合细菌研究进展  15-16
      2.1.1 在自然界的分布  15
      2.1.2 水质改良作用  15
      2.1.3 在物质循环中的作用  15
      2.1.4 在水产养殖上的应用  15-16
    2.2 枯草芽孢杆菌在水产养殖中应用的研究进展  16-18
      2.2.1 枯草芽孢杆菌概况  16
      2.2.2 在水产养殖中的应用  16-18
  3 本研究的目的和意义  18-20
第2章 3种养殖模式的池塘水体中细菌多样性的研究  20-37
  1 材料和方法  21-24
    1.1 试验地点与养殖模式的设定  21
    1.2 水样的采集和处理  21-22
    1.3 水体中菌体DNA的提取  22
    1.4 细菌16S rDNA的扩增和纯化  22-23
    1.5 16S rDNA克隆文库的建立和筛选  23-24
    1.6 序列的分析处理与系统发育树的构建  24
    1.7 水质测定  24
  2 结果  24-34
    2.1 克隆文库的建立  24-26
      2.1.1 16S rDNA的扩增和纯化  24-25
      2.1.2 阳性克隆的筛选结果  25-26
    2.2 16S rDNA文库分类操作单元(operational taxonomic unit,OTU)分析  26-27
    2.3 系统发育分析  27-32
    2.4 三种模式细菌群落结构比较分析  32-33
    2.5 水质结果  33-34
  3 讨论  34-37
    3.1 三种养殖模式水体细菌多样性比较  34-35
    3.2 淡水养殖水体细菌多样性特点  35
    3.3 池塘水质条件和细菌多样性的关系  35-37
第3章 两种微生态制剂对养殖水体细菌结构影响的研究  37-48
  1 材料和方法  37-41
    1.1 养殖模式  37-38
    1.2 水样采集和处理  38
    1.3 方法  38-41
      1.3.1 水体细菌总DNA的提取  38-39
      1.3.2 细菌16S rDNA的扩增和纯化  39
      1.3.3 16S rDNA克隆文库的建立和筛选  39-40
      1.3.4 序列的分析处理  40-41
  2 实验结果  41-46
    2.1 克隆文库的建立  41
      2.1.1 16S rDNA的扩增和纯化  41
      2.1.2 阳性克隆的筛选结果  41
    2.2 16S rDNA文库分类操作单元(operational taxonomic unit,OTU)分析  41-42
    2.3 16S rDNA文库分析不同时间点样品的微生物群落结构  42-44
      2.3.1 枯草芽孢杆菌对菌落结构的影响  42-43
      2.3.2 沼泽红假单胞菌对水体菌落结构的影响  43-44
    2.4 Proteobacteria中各亚门的分布  44-46
  3 讨论  46-48
    3.1 两种微生态制剂对水体细菌多样性的影响  46
    3.2 实验组水体细菌群落结构的变化  46-47
    3.3 草鱼为主的养殖模式水体细菌结构的特点  47-48
参考文献  48-55
附录  55-56
致谢  56

相似论文

  1. 夏季湖光岩玛珥湖浮游细菌和浮游活性菌遗传多样性的比较,Q938
  2. 珊瑚共附生可培养真菌菌群多样性及其生物活性研究,R284
  3. 云南有色金属矿山细菌多样性初步探究,TD926.4
  4. 弯孢属种分子鉴定体系的建立及其在疑难种上的应用,Q949.32
  5. 海藻糖改善枯草芽孢杆菌电转化方法的研究,Q78
  6. 腐生葡萄球菌M36耐有机溶剂脂肪酶基因的克隆与表达,Q78
  7. 产γ-聚谷氨酸菌株的筛选及其生物有机肥的生物效应研究,TQ922.1
  8. 西藏生防芽孢杆菌鉴定及其脂肽化合物分析,S476.1
  9. Bacillus subtilis SQR9的黄瓜促生和枯萎病生防效果及其作用机制研究,S436.421
  10. Bacillus subtilis fmbj对桃软腐病菌Rhizopus stolonifer拮抗机理及应用研究,S476
  11. 转基因大豆玉米小麦信息平台建设及转基因大豆对土壤微生物的影响研究,S565.1
  12. 枯草芽孢杆菌对基质栽培黄瓜盐胁迫伤害的缓解效应,S642.2
  13. 根霉中β-葡萄糖苷酶基因克隆及表达,Q78
  14. γ-PGA酸水解测定法的改进及发酵产γ-PGA过程分子量分布和水解酶基因克隆的研究,TQ920.1
  15. 钻井废弃液中污染物组成及降解微生物群落多样性,X172
  16. 产核黄素枯草芽孢杆菌代谢物组的初步研究,Q936
  17. 枯草杆菌Zj016发酵产氨肽酶的研究,TQ929
  18. 以麦糟为原料生物法制备嗜热β-葡聚糖酶技术的研究,TQ925
  19. 葡萄糖转化异丁醇代谢途径的设计与表达,TQ923
  20. 微生物发酵玉米蛋白粉生产玉米肽的研究,TQ929
  21. 枯草芽孢杆菌制剂对仔猪生长性能的影响,S828.5

中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产基础科学 > 水产生物学 > 水产微生物学
© 2012 www.xueweilunwen.com