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非小细胞肺癌血清蛋白质标记物的检测与鉴定

作　者: 杨洋
导　师: 王建军
学　校: 华中科技大学
专　业: 外科学
关键词: 非小细胞肺癌 蛋白质标记物 SELDI-TOF-MS 支持向量机 HPLC MALDI-TOF-MS nano-LC-ESI-MS/MS 载脂蛋白C-I 触珠蛋白α1链 S100A4 抗体芯片
分类号: R734.2
类　型: 博士论文
年　份: 2010年
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内容摘要


第一部分：非小细胞肺癌血清蛋白质标记物的检测目的检测非小细胞肺癌血清蛋白质组,筛选特异性的蛋白质标记物,构建可用于非小细胞肺癌早期检测和诊断的判别模型。方法应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测112例非小细胞肺癌和123例对照血清样本的蛋白质质谱,并结合支持向量机(SVM)对数据进行分析。结果经检测及生物信息学分析处理,发现P<0.01的差异性m/z峰22个。从差异性显著的蛋白质峰的任意组合中,运用SVM筛选出预测值Youden指数最高的组合模型,获得m/z峰值位于6628、9191和11412的蛋白质标记物3个。与正常健康组相比,m/z峰值位于6628的蛋白质在非小细胞肺癌中明显低表达,而峰值位于9191和11412的蛋白质呈明显高表达,且表达强度与分期也有一定的相关性。盲法测试结果显示,联合3种潜在蛋白质标记物,该判别模型区分非小细胞肺癌和对照组的敏感性为96.56%,特异性为94.79%,阳性预测值为95.0%。结论m/z峰值位于6628、9191和11412的蛋白质可以作为非小细胞肺癌潜在的生物学标记物。SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术为非小细胞肺癌血清蛋白质标记物的检测提供了有效的手段。第二部分：非小细胞肺癌血清蛋白质标记物的鉴定目的结合蛋白组学技术对m/z峰值位于6628、9191、11412的蛋白质标记物进行结构鉴定。方法运用HPLC对3种蛋白质标记物进行分离纯化,随后采用MALDI-TOF-MS质谱技术对分离后的不同时间点的蛋白质纯化液进行检测,以跟踪目标蛋白质所在的样本。最后,对纯化后的蛋白质标记物进行酶解,并应用nano-LC-ESI-MS/MS进行测序。结果m/z峰值位于6628的蛋白质经鉴定为载脂蛋白C-Ⅰ；m/z峰值位于9191、11412的蛋白质分别为触珠蛋白α1链、S100A4蛋白。结论联合运用HPLC、MALDI-TOF-MS和nano-LC-ESI-MS/MS等蛋白组学技术,可有效地对肿瘤蛋白质标记物进行结构鉴定。m/z峰值位于6628、9191和11412的蛋白质分别被鉴定为载脂蛋白C-Ⅰ,触珠蛋白α1链和S100A4蛋白。第三部分：非小细胞肺癌血清蛋白质标记物的验证目的运用抗体芯片技术对鉴定出的载脂蛋白C-Ⅰ、触珠蛋白α1链和S100A4蛋白质进行免疫学检测,以验证鉴定结果的可靠性。方法分别运用螯合有抗人载脂蛋白C-Ⅰ抗体、抗人触珠蛋白α抗体和抗人S100A4抗体的蛋白质芯片对非小细胞肺癌患者和对照血清样本进行检测。结果m/z峰值位于6628的蛋白质可被偶联有抗载脂蛋白C-I抗体的芯片捕获,而m/z峰值位于9191和11412的蛋白质可分别与偶联有抗触珠蛋白α抗体和抗S100A4抗体的芯片相结合。结论3种蛋白质均可被抗体芯片特异性捕获,证明了前期鉴定结果的可靠性。载脂蛋白C-Ⅰ、触珠蛋白α1链和S100A4蛋白在非小细胞肺癌患者和对照组血清中存在显著的差异性表达,三者联合应用对非小细胞肺癌的早期检测和诊断具有良好的应用价值和广阔的发展前景。

全文目录


前言  7-10
  参考文献  9-10
摘要  10-13
Abstract  13-16
正文部分  16-69
  第一部分:非小细胞肺癌血清蛋白质标记物的检测  16-36
    材料与方法  17-21
    结果  21-29
    讨论  29-33
    小结  33-34
    参考文献  34-36
  第二部分:非小细胞肺癌血清蛋白质标记物的鉴定  36-51
    材料与方法  37-40
    结果  40-44
    讨论  44-48
    小结  48-49
    参考文献  49-51
  第三部分:非小细胞肺癌血清蛋白质标记物的验证  51-67
    材料与方法  51-54
    结果  54-56
    讨论  56-64
    小结  64-65
    参考文献  65-67
  全文总结  67-69
综述部分  69-103
  综述一:肿瘤蛋白组学的发展趋势及展望  69-89
  综述二:肺癌肿瘤标记物及其在蛋白组学方面的研究进展  89-103
附录  103-105
  附录1:攻读学位期间发表论文  103-104
  附录2:英文缩略词表  104-105
致谢  105

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中图分类: > 医药、卫生 > 肿瘤学 > 呼吸系肿瘤 > 肺肿瘤
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