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河南汉族人群XRCC1基因多态性与食管癌易感性的关系

作　者: 运玉霞
导　师: 代丽萍
学　校: 郑州大学
专　业: 流行病与卫生统计学
关键词: 食管癌 Meta分析 X射线交叉互补修复基因1 基因多态性单体型分析
分类号: R735.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
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内容摘要

背景与目的X射线交叉互补修复基因1(X-Ray Repair Cross Complementing Gene 1, XRCC1)是DNA碱基切除修复的重要组分,是重要的DNA损伤修复基因,有研究表明,DNA损伤修复基因与肿瘤的易感性有关。目前对XRCC1基因研究较多的两个位点是194位点和399位点,280位点和-77位点也有一些研究,四个多态性位点均位于XRCC1蛋白质主要的结构域内,可能改变XRCC1蛋白质功能而影响DNA修复能力,从而影响个体的肿瘤易感性。目前,国内外已有一些关于.XRCC1基因多态性与食管癌发病风险的报道,但研究结果不尽一致。为了深入探讨XRCC1基因多态性与食管癌的关系,我们分为两个部分进行研究。第一部分：运用Meta分析的方法对194位点和399位点的以往研究结果进行综合定量评价,观察XRCC1基因多态性与食管癌的发病风险的相关性。第二部分：用分子生物学的方法,采用病例对照研究探讨XRCC1基因的194位点、399位点和-77位点三个位点多态性与食管癌易感性的关系。本研究的研究目的是：探讨DNA损伤修复基因.XRCC1三个位点多态性和基因-环境的交互作用与食管癌的关系,为揭示食管癌高风险估计、基因治疗和综合防治提供理论依据。方法对国内外1979～2009年.XRCC1基因194和399位点多态性与食管癌的发病风险的病例对照研究的原始资料进行Meta分析,并按组织学类型和种族进行分层分析,计算合并OR值(95%CI)。河南地区汉族人群,按照成组匹配原则选择381例医院来源的原发性食管癌患者和432例人群来源健康对照作为研究对象。采用PCR-RFLP方法判定研究对象XRCC1基因的194位点、399位点和-77位点的基因型；采用x2检验比较三个位点各基因型在病例组和对照组之间分布的差异,非条件Logistic回归方法计算调整性别、年龄、吸烟、饮酒、家族史后的OR值(95%CI),运用SNPHAP软件对XRCC1基因三个位点进行haplotype单体型预测,采用x2检验比较单体型、联合基因型、突变位点数量趋势和等位基因突变数量趋势分布在病例组和对照组的差异,并分析XRCC1基因三个位点多态性与吸烟或饮酒在食管癌发生中的交互作用。结果1. Meta分析结果XRCC1194位点：与野生基因型Arg/Arg相比,杂合基因型Arg/Trp、纯合突变基因型Trp/Trp和联合突变基因型(Arg/Trp+Trp/Trp)合并的OR值(95%CI)分别为0.91(0.78,1.05)、1.66(1.29,2.15)、1.01(0.88,1.16)。组织学类型分层分析显示,携带Trp/Trp的个体患食管鳞癌的风险是携带野生型Arg/Arg的1.74倍(95%CI：1.33,2.27)；种族分层分析显示,亚洲人群中携带Trp/Trp的个体患食管癌的风险是携带野生型Arg/Arg的1.66倍(95%CI：1.29,2.15)。XRCC1399位点：未发现该位点与食管癌发病风险有统计学相关性的基因型。2.病例对照研究结果2.1 XRCC1基因多态性与食管癌相关性未发现XRCC1基因194和399位点与食管癌易感性有统计学关联的基因型。-77位点：与野生等位基因T相比,突变等位基因C可能是食管癌易感性的保护性因素(OR：0.70,95%CI：0.48,1.00)。2.2单体型分析以野生型等位基因组成的单体型CGT作为对照,其他单体型与食管癌易感性无关。单体型CGC可能是食管癌易感性的保护性因素(OR,0.62,95%CI,0.40,0.96)。2.3联合基因型分析以联合野生基因型CC/GG/TT作为对照,其他16种联合基因型与食管癌易感性无关联。2.4突变数量趋势分析三个位点发生零突变的基因型作为对照,一个位点突变、两个位点突变和三个位点突变的基因型与食管癌易感性无关联(X2趋势=o.38,P>0.05)。三个位点六个等位基因发生零突变的基因型作为对照,等位基因发生一个突变、两个突变和三个突变的基因型与食管癌易感性无关联(x2趋势=0.19,P>0.05)。2.5 XRCC1基因与环境因素的交互作用与不吸烟且基因型为野生型相比,携带突变基因型的吸烟者与食管癌的易感性无关联。以不饮酒且基因型为野生型作为对照,未发现饮酒且基因型为各突变基因型可以增加食管癌易感性。结论1. Meta分析XRCC1 194位点纯合突变基因型Trp/Trp是食管癌和食管鳞癌发病的危险因素,亚洲人群中纯合突变基因型Trp/Trp是食管癌发病的危险因素。未发现XRCCl 399位点多态性与食管癌的发病风险有关。2.病例对照研究XRCCl基因194、和399位点多态性可能和河南汉族人群食管癌的发生无关；XRCC1基因-77位点的突变等位基因C可能是河南汉族人群食管癌发病风险的保护性因素；单体型CGC可能是河南汉族人群食管癌易感性的保护性单体；未发现吸烟和饮酒与XRCC1基因194、399和-77位点多态性在河南汉族人群食管癌的发生中有交互作用。

全文目录

摘要  5-8
Abstract  8-15
图表索引  15-17
英文缩略词表  17-18
1 引言  18-20
2 XRCC1基因与食管癌易感性关系的META分析  20-36
  2.1 材料与方法  20-21
    2.1.1 资料来源  20
    2.1.2 文献入选标准和剔除标准  20-21
    2.1.3 统计学分析  21
  2.2 结果  21-32
    2.2.1 研究资料基本情况  21-23
    2.2.2 XRCC1基因194位点与食管癌易感性关系的Meta分析结果  23-27
    2.2.3 XRCC1基因399位点与食管癌易感性关系的Meta分析结果  27-32
  2.3 讨论  32-35
    2.3.1 Meta分析简介  32-33
    2.3.2 Meta分析结果讨论  33-35
  2.4 结论  35-36
3 河南汉族人群XRCC1基因多态性与食管癌的研究  36-70
  3.1 材料与方法  36-44
    3.1.1 材料  36-38
    3.1.2 常用试剂的配置  38-39
    3.1.3 方法  39-43
    3.1.4 统计学分析  43-44
  3.2 结果  44-62
    3.2.1 研究对象特征比较  44-45
    3.2.2 基因型判定  45-51
    3.2.3 对照遗传平衡性检验  51-52
    3.2.4 XRCC1基因194位点多态性与食管癌易感性的关系  52
    3.2.5 XRCC1基因399位点多态性与食管癌易感性的关系  52-53
    3.2.6 XRCC1基因-77位点多态性与食管癌易感性的关系  53-54
    3.2.7 XRCC1基因194位点、399位点和-77位点之间的交互作用  54-59
    3.2.8 环境因素与XRCC1基因多态性的交互作用  59-62
  3.3 讨论  62-68
    3.3.1 基因多态性检测方法  62-63
    3.3.2 XRCC1基因多态性与食管癌易感性关系  63-65
    3.3.3 XRCC1基因194位点、399位点和-77位点多态性的交互作用  65-66
    3.3.4 XRCC1基因多态性与环境因素的交互作用  66-67
    3.3.5 本研究的优点与局限性  67-68
  3.4 进一步研究  68
  3.5 结论  68-70
参考文献  70-74
综述 XRCC1基因多态性与食管癌易感性关系研究  74-86
  1. 碱基切除修复机制  75-76
  2 碱基切除修复基因XRCC1多态性与食管癌易感性关系研究  76-79
    2.1 XRCC1基因概述  76-77
    2.2 XRCC1基因多态性与食管癌易感性关系研究  77-79
      2.2.1 Arg194Trp位点  77-78
      2.2.2 Arg280His位点  78
      2.2.3 Arg399Gln位点  78-79
      2.2.4 T-77C位点  79
  3 XRCC1基因多态性与食管癌易感性关系研究展望  79-82
  参考文献  82-86
个人简历  86
攻读硕士学位期间发表论文情况  86-88
致谢  88

河南汉族人群XRCC1基因多态性与食管癌易感性的关系

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