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皱纹盘鲍遗传多样性的研究及遗传图谱构建

作　者: 徐艳虹
导　师: 李琪
学　校: 中国海洋大学
专　业: 水产养殖
关键词: 皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai) AFLP标记 微卫星标记 遗传模式 遗传多样性 野生和养殖群体 遗传连锁图谱
分类号: S917.4
类　型: 硕士论文
年　份: 2007年
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内容摘要


本文通过分析皱纹盘鲍AFLP分子标记的遗传模式,利用AFLP技术对皱纹盘鲍养殖与野生群体进行了遗传多样性及遗传分化研究,并对皱纹盘鲍单对交配的亲本及其F1子代进行AFLP和微卫星作图标记筛选,建立了初步的遗传连锁图谱。皱纹盘鲍3个不同家系(♀467×♂447,♀467×♂431,♀570×♂431)的115个F1代个体,由1对AFLP引物扩增共得到45个位点大小的119个片段。F1代的表型分离比率及显性子代频率,经双侧尾二项式检验和二项式95%置信区间检验,结果显示所有位点的分离比率只有一种可能,并且119个位点全部符合1:0、3:1或1:1的分离比率,没有出现偏分离的位点(P≥0.053),有效表明AFLP标记的孟德尔显性遗传模式。皱纹盘鲍群体多样性研究中,选取的6对AFLP引物组合在8个皱纹盘鲍群体内均能扩增出清晰、可重复的扩增产物,扩增带型差异明显。8个群体的多态位点比率分别为:大连养殖群体48.65%、烟台养殖群体50.50%、青岛胶南养殖群体51.17%、青岛崂山养殖群体50.51%、山东长岛野生群体58.90%、山东俚岛野生群体60.07%、日本岩手野生群体68.92%、大连野生群体54.05%;预期杂和度分别为0.2291、0.2438、0.2442、0.2374、0.2626、0.2723、0.3137和0.2802。与野生群体相比,养殖群体的多态位点比率和杂合度都有不同程度的降低。皱纹盘鲍群体间遗传分化指数Fst为0.036,不同群体间及群体内均存在遗传分化。皱纹盘鲍两两群体之间的遗传相似度范围为0.9623-0.9886,而遗传距离介于0.0115-0.0385之间。根据遗传距离绘制UPGMA聚类图,野生群体和养殖群体各自聚成一支。皱纹盘鲍作图家系的亲本和88个子代个体共产生542个多态并且在一个亲本产生分离的标记(58个微卫星位点、484个AFLP标记):267个在母本中分离,275个在父本中分离(包括部分相同的微卫星位点)。经过顺序邦弗朗尼校正之后,雌性标记中有260个,雄性标记中有265个符合孟德尔分离定律(P≥0.05)。除去偏分离标记,利用其它有效标记分别构建了皱纹盘鲍的雌性和雄性连锁图谱。雌性框架图谱有220个标记定位在20个连锁群上,覆盖基因组的长度为2733.8 cM,平均间隔为13.7 cM;雄性框架图谱有248个标记定位于19个连锁群上,覆盖基因组2860.2 cM,平均间隔12.5 cM。皱纹盘鲍雌、雄框架图的覆盖率分别为83.4%和85.8%。此外,雌性和雄性连锁图谱上有10组连锁群通过共有的微卫星位点对应。

全文目录


摘要  4-6
Abstract  6-10
1 文献综述  10-26
  1.1 遗传多样性的研究  10-13
    1.1.1 遗传多样性的概念及研究方法  10-13
    1.1.2 遗传多样性的研究意义  13
  1.2 遗传图谱的构建和应用  13-22
    1.2.1 遗传图谱的作图原理及发展  13-14
    1.2.2 遗传图谱的构建过程  14-20
    1.2.3 遗传图谱的应用  20-21
    1.2.4 水产动物遗传图谱研究进展  21-22
  1.3 鲍的养殖及遗传育种现状  22-24
    1.3.1 鲍的生物学特征及养殖现状  22-23
    1.3.2 鲍的遗传育种研究现状  23-24
  1.4 本研究的总体设计和研究策略  24-26
2 AFLP 和微卫星标记的筛选  26-40
  2.1 创建鲍鱼家系  26-27
    2.1.1 构建家系  26-27
    2.1.2 DNA 提取  27
  2.2 AFLP 标记的筛选  27-35
    2.2.1 材料与方法  27-33
    2.2.2 结果  33-35
  2.3 微卫星标记的筛选  35-40
    2.3.1 材料与方法  35-37
    2.3.2 结果  37-40
3 皱纹盘鲍 AFLP 标记遗传模式的研究  40-49
  3.1 材料与方法  40-41
    3.1.1 实验材料  40-41
    3.1.2 AFLP 检测  41
    3.1.3 数据统计及分析方法  41
  3.2 结果  41-48
    3.2.1 AFLP 扩增结果  41-42
    3.2.2 AFLP 分离模式分析  42-48
  3.3 讨论  48-49
4 皱纹盘鲍野生和养殖群体的 AFLP 分析  49-58
  4.1 材料与方法  50-53
    4.1.1 取样与DNA 提取  50-51
    4.1.2 AFLP 检测  51-52
    4.1.3 数据统计及分析方法  52-53
  4.2 结果  53-56
    4.2.1 AFLP 扩增结果  53
    4.2.2 群体间的遗传变异分析  53-55
    4.2.3 群体的聚类分析  55-56
  4.3 讨论  56-58
5 皱纹盘鲍遗传图谱的构建  58-69
  5.1 材料与方法  59-60
    5.1.1 实验材料  59
    5.1.2 AFLP、微卫星标记分析  59
    5.1.3 数据统计及图谱的构建  59-60
    5.1.4 基因组大小及覆盖率的计算  60
  5.2 结果  60-64
    5.2.1 AFLP 和微卫星标记  60-61
    5.2.2 连锁图谱  61-63
    5.2.3 基因组大小及图谱覆盖率  63-64
  5.3 讨论  64-69
参考文献  69-78
致谢  78

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中图分类: > 农业科学 > 水产、渔业 > 水产基础科学 > 水产生物学 > 水产动物学
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