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IL-6R基因SNP及单体型与2型糖尿病关联研究

作　者: 唐吟宇
导　师: 彭惠民
学　校: 重庆医科大学
专　业: 遗传学
关键词: 白细胞介素6受体基因(IL-6R基因) 2型糖尿病(T2DM) 单核苷酸多态性(SNP)
分类号: R587.1
类　型: 硕士论文
年　份: 2007年
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内容摘要


糖尿病属于复杂性疾病, 2型糖尿病( type 2 diabetes mellitus ,T2DM)是糖尿病的主要类型,为遗传因素和环境因素相互作用的产物。本文拟通过对白细胞介素6受体(interleukin 6 recepor,IL-6R)基因多态性的研究,探讨IL-6R基因与T2DM的关系。人类IL-6R基因定位于1q21.3,编码的白细胞介素6受体蛋白(IL-6R),能特异性地和其配体——白细胞介素6(interleukin 6 ,IL-6)结合,形成IL-6R/IL-6复合物,引起信号转导。IL-6是一种多功能的细胞因子,可由不同种类细胞产生,如淋巴细胞、脂肪细胞、内皮细胞等,在免疫和炎症反应中发挥重要作用。机体IL-6水平失调,可导致许多疾病的产生。研究表明,高浓度的IL-6能破坏胰岛β细胞,诱导胰岛素抵抗(insulin resistance,IR),与糖尿病的发生发展密切相关。而IL-6的作用是由IL-6R介导的,IL-6R作为信号转导的“中介分子”,在IL-6信息传递过程中起关键作用。有文献报道,1q21.3区域与2型糖尿病连锁,但以往的报道有种族遗传异质性。为此,我们拟了解中国汉族人群(Chinese Han nationality population,CHNP)的IL-6R基因是否与T2DM有关。研究目的:本研究通过对中国西南地区汉族人群IL-6R基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及其单体型(haplotype)分布特征的观察,充实更新IL-6R基因在中国汉族人群(CHNP)的数据,并探讨它们与T2DM的关系,为T2DM发病机理研究提供更多新的信息,为T2DM的预防治疗提供新的理论依据。研究方法:(1)通过美国国家生物信息中心(National Center of Biology Information,NCBI)的GenBank获取IL-6R基因序列及其相应位点的SNP信息。利用Primer Premier 5.0引物设计软件设计相应引物,并经NCBI的Blast 2.0软件检验其特异性。(2)应用群体-候选基因分析方法,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR- RFLP)技术,对106例T2DM患者及102例正常对照IL-6R基因的2个SNP位点——第9外显子D358A(rs8192284)和启动子-183(G→A)(rs4845617),进行基因型检测。(3)应用聚类分析方法分析基因多态性特征。研究结果:(1)IL-6R基因第9外显子D358A位点(rs8192284)基因型频率和等位基因频率,在病例组和对照组分别为AA 0.443/0.304、AC 0.415/0.421、CC 0.142/0.275;A 0.651/0.510、C 0.349/0.490。两组人群基因型频率和等位基因频率均有显著差异(χ~2=7.149,P=0.029;χ~2=8.511,P=0.04)。提示IL-6R基因第9外显子D358A是中国西南地区汉族人群T2DM的易感因子。(2)IL-6R基因启动子-183(G→A)位点(rs4845617)基因型频率和等位基因频率,在病例组和对照组分别为GG 0.387/0.451、GA 0.443/0.412、AA 0.170/0.137;G 0.585/0.657、A 0.415/0.343。两组基因型频率和等位基因频率均无显著差异(χ~2=0.992,P=0.634;χ2=2.285,P=0.157)。提示IL-6R基因启动子-183(G→A)的多态性与中国西南地区汉族人群T2DM无关。(3)2个SNP位点按第9外显子D358A位点(rs8192284)、启动子-183(G→A)位点(rs4845617)顺序,可以组成4种单体型,分别定为A1-G、A1-A2、C-G、C-A2。其中,最常见的是A1-G,在病人组及对照组的频率为0.418/0.293(χ~2=1.738,P=0.187480);而差异有统计学意义的仅C-A2 ,在病人组及对照组的频率为0.110/0.273 (χ~2=4.383 ,P=0.036357)。提示单体型C-A2可能与中国西南地区汉族人群T2DM存在关联。结论:(1)本研究首次揭示了中国西南地区汉族人群IL-6R基因SNP及其单体型分布特征以及与T2DM的关系,为进一步探讨IL-6R基因多态性与生理功能和疾病的关系提供了基础信息。(2) IL-6R基因可能与中国西南地区汉族人群T2DM的遗传易感性有关。

全文目录


符号说明  5-6
中文摘要  6-9
英文摘要  9-13
论文正文：IL-6R 基因SNP 及单体型与2 型糖尿病关联研究  13-36
  前言  13-17
    1. 关于2型糖尿病  13
    2. 2型糖尿病的遗传学研究方法  13-14
    3. 2型糖尿病研究中的多态性标志物  14-15
    4.IL-6R 基因与 2 型糖尿病的关系  15-17
  1 材料和方法  17-26
    1.1 材料  17-21
    1.2 研究方法  21-26
  2 结果  26-31
    2.1 判读样本基因型  26-27
    2.2 统计分析  27-31
  3 讨论  31-36
    3.1 IL-6R基因与T2DM的关系  31-33
    3.2 实验结果分析及探讨  33-36
结论  36-37
参考文献  37-40
文献综述：IL-6R 基因多态性与2 型糖尿病的关系  40-47
致谢  47-48
攻读学位期间撰写和发表的论文  48

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中图分类: > 医药、卫生 > 内科学 > 内分泌腺疾病及代谢病 > 胰岛疾病 > 糖尿病
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