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中国株乙型肝炎病毒D基因型全序列分析；HBV基因型分型方法学建立及初步应用

作　者: 阎丽
导　师: 侯金林
学　校: 第一军医大学
专　业: 传染病学
关键词: 乙型肝炎病毒基因型聚合酶链式反应-限制片段长度多态性种系发生树无症状携带者肝硬化
分类号: R373.21
类　型: 硕士论文
年　份: 2001年
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内容摘要

为了解乙型肝炎病毒（HBV）D基因型在中国的存在状况及全基因序列特征，应用在聚合酶链式反应（PCR）扩增HBV前S基因基础之上的限制性片段长度多态性（RFLP）的方法调查了中国部分地区HBV基因型分布。认为D基因型毒株在中国部分地区并非少见。全基因PCR和克隆后测定并分析了一例HBV D基因型毒株的全基因，GeneBank Accession Number为AF280817。GeneBank中全部30株野生型HBV D基因型毒株的种系进化树提示：本文报告的唯一一株中国D型AF280817株与瑞典的四株D型进化距离最近；亚洲呈非HBV D基因型分布的优势地域；认为病毒传入来源、迁移的不同及病毒在具有不同遗传和免疫特质的宿主中的长期选择可能是形成HBV同一基因型病毒株进化距离不同的原因。本文应用DNASIS和CLUSTALW分析软件将已发表的223株HBV全序列进行基因型分型、S基因核苷酸及氨基酸序列对齐比较，分析每一种基因型特有的核苷酸或氨基酸序列后发现了每一种基因型特异性的限制性内切酶，建立了S基因PCR-RFLP的基因型分型方法学，可鉴别A-F基因型。部分不同基因型标本经S基因序列测定证实了此方法的准确性。该方法克服了既往方法学参考序列少，代表性略差，图谱复杂等缺点，更具简明、灵敏和特异性，益于HBV基因型的流行病学调查及基因型在HBV感染疾病进程中潜影响的研究。用此方法初步探讨HBV基因型与HBV疾病谱相关性，对广东地区HBV感染者200例，其中无症状携带者（AsC）组80例和肝硬化（LC）组120例血清标本分型。结果表明广东地区未发现A、E和F基因型，以B和C型为优势基因型，AsC组中以B型为主要基因型（37/80），同一疾病谱中基因型分布均与e抗原状态无显著性差异（P＞0.05）；不同疾病谱的两组基因型分布有显著性差异（P＜0.01）；C型在ASC→LC中呈现增多趋势，而B和D型在ASC→LC中呈现减少趋势，ASC与LC组相比X~2=31.924 P=0.000，可预示：可能感染HBV D基因型病情轻，感染HBV C基因型病情易加重。

全文目录

中文摘要  3-4
英文摘要  4-5
前言  5-8
第一部分我国乙型肝炎病毒（HBV）D基因型分布及序列分析  8-17
第二部分 HBV基因型S基因PCR-RFLP分型方法的建立及初步应用  17-23
小结  23-24
参考文献  24-27
论文发表撰写情况  27-28
鸣谢  28

中国株乙型肝炎病毒D基因型全序列分析；HBV基因型分型方法学建立及初步应用

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