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近交系五指山猪14个微卫星位点的遗传分析

作　者: 李凯
导　师: 郭勇；冯书堂
学　校: 北京农学院
专　业: 临床兽医
关键词: 五指山小型猪 微卫星 杂合度 多态信息含量
分类号: S828
类　型: 硕士论文
年　份: 2009年
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内容摘要


本论文主要研究了近交系五指山猪14个微卫星在6个世代和3个家系中遗传变化规律,目的是从分子遗传学的角度探讨五指山猪近交系的特征,为研究其特有的性状提供理论支持,还将为促进近交系五指山猪在人类医学中的应用提供理论基础。本研究内容主要分为两部分:第一部分是研究14个微卫星在近交系五指山猪6个世代3个家系的群体分析,利用14个微卫星引物,以五指山猪近交系F13-F18为研究对象,通过计算基因频率、平均杂合度（H）、多态信息含量（PIC）及有效等位基因数目（N）,以探索五指山猪近交系的遗传学规律,并为其表性学研究提供有力支持。结果表明:在14个微位星座位中,群体平均等位基因数为2.7个、平均杂合度为0.42、多态信息含量为0.37;三个家系的平均等位基因数分别为2.36、2.29、2.50,平均杂合度分别为0.41、0.45、0.42:F13-F18的平均等位基因数分别为2.21、2.57、2.36、2.57、2.50、1.64,平均杂合度分别为0.31、0.41、0.36、0.41、0.37、0.2;研究发现:SW2409、SW510、SW71在五指山猪近交系三个家系群体、世代中已经达到完全纯合,而SW874、SW205、SW936、SW0036在三家系、六世代中未能纯合。第二部分是研究14个微卫星在近交系五指山猪3个家系间的分子遗传学差异,结果表明:五指山猪近交系Ⅰ系F14-F16的14个微位星座平均每个位点等位基因数为2个、其平均杂合度为0.4、多态信息含量为0.26;Ⅱ系F15-F18的平均等位基因数为1.92,平均杂合度分别为0.32,多态信息含量为0.25;Ⅲ系F14-F17三的平均等位基因数为2.17,平均杂合度0.44为,平均多态信息含量为0.32。随近交代数的推进每个星座上等位基因数越来越少,基因的纯合度越来越高;SW2409、SW510、SW71在近交系三个家系各个世代中已经达到完全纯合;三个家系的近交程度不完全一致,基因的纯合度亦不同,Ⅱ系最高,其次为Ⅰ系和Ⅲ系;每个系别都有少数几个基因座一直都处于杂合状态,其基因纯合度不随着近交世代的增进而提高,初步揭示了14个多态性微卫星位点上等位基因的变化规律,即分子遗传基础特征。

全文目录


摘要  3-4
Abstract  4-7
第一章 引言  7-19
  1.1 研究目的和意义  7
  1.2 国内外小型猪的研究概况  7-10
  1.3 国内外小型猪作为医学动物模型的研究应用现状  10-12
  1.4 五指山猪实验用近交系的研究应用现状  12-13
  1.5 微卫星荧光标记-半自动片段分析的原理与方法  13-19
第二章 近交猪部分微卫星座等位基因的遗传规律研究  19-38
  实验一 近交猪群体部分微卫星座等位基因的遗传规律研究  19-28
    1 材料与方法  20-22
      1.1 材料及试剂  20
      1.2 方法  20-22
    2 结果  22-26
      2.1 等位基因的组成和基因纯合度  22
      2.2 群体基因杂合度  22-23
      2.3 三家系间基因杂合度  23-24
      2.4 F_(13)-F_(18)世代间的基因杂合度和等位基因数  24-26
    3 讨论  26-28
      3.1 五指山猪近交系群体分析  26-27
      3.2 五指山猪近交系三个家系间的遗传分析  27
      3.3 五指山猪近交系六个世代的遗传分析  27-28
  实验二 近交猪家系微卫星座等位基因的遗传规律研究  28-38
    1 材料和方法  29-31
      1.1 试验的时间、地点  29
      1.2 试验材料  29
      1.3 试验方法  29-31
    2 结果与分析  31-36
      2.1 等位基因的组成和基因纯合度  31-32
      2.2 试验型五指山猪Ⅰ系F14-F16的微卫星检测  32-33
      2.3 试验型五指山猪Ⅱ系F15-F18的14个微卫星位点的检测  33-34
      2.4 试验用五指山猪Ⅲ系F14-F17的14个微卫星位点的检测  34-36
      2.5 试验型近交系五指山猪三个家系间的比较  36
    3 讨论  36-38
第三章 结论  38-39
参考文献  39-42
附录  42-50
致谢  50-51
个人简介  51

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中图分类: > 农业科学 > 畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂 > 家畜 > 猪
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