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家族性隐睾外显子组测序分析

作　者: 杨锐林
导　师: 蔡志明；李泽松
学　校: 汕头大学
专　业: 泌尿外科
关键词: 外显子组测序隐睾 FCGR3A基因单基因病
分类号: R697.22
类　型: 硕士论文
年　份: 2011年
下　载: 71次
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内容摘要

目的隐睾是男性生殖系统常见的先天性疾病,不育和癌变是其最严重的并发症,其分子遗传学的研究对该病的防治有着重大意义。外显子组测序是目前寻找疾病致病病因、易感基因的一种快捷、经济、高效的研究手段。本实验对家族性隐睾患者家系进行外显子测序分析,探讨隐睾新的候选基因。方法与结果利用外显子捕获技术和新一代外显子测序技术,对家族性隐睾症三代四人发病中的两名患者与一名正常者进行外显子组信息分析,在3个标本中检测到单核苷酸多态性的数目分别为23,989个,26,171个和24,427个,其中14,597个单核苷酸多态性为3个标本所共有,其中包括了已报道的影响睾丸下降的G蛋白偶联受体GREAT基因3个单核苷酸多态性;通过基因聚族分析在该家系中发现GRID1基因等7个与GREAT基因作用通路功能相似的基因族。利用生物信息学和千人基因组数据库比对分析方法,排除家族成员遗传差异和常见单核苷酸多态性,得到39个与隐睾密切相关的非同义单核苷酸多态性;利用Sanger测序方法对10例隐睾患者进行测序验证,最终把家族性隐睾相关的候选基因确定为FCGR3A基因。结论外显子测序技术让对少数家族性隐睾患者进行测序分析发现候选基因突变成为可能。候选基因FCGR3A的发现,对今后阐明该病发病机制、遗传诊断和为临床实践提供基础具有重要的研究和应用价值。

全文目录

中文摘要  7-8
Abstract  8-9
第一章前言  9-16
  1 隐睾的研究概况  9-10
  2 单核苷酸多态性（SNP）与外显子测序  10-11
  3 外显子测序与疾病研究  11
  4 外显子测序技术原理与特点  11-13
  5 生物信息学分析和SNPs 验证  13-16
第二章实验材料与方法  16-22
  1 材料与方法  16-17
    1.1 主要实验设备和试剂  16
    1.2 病史采集及数据管理  16-17
  2 实验方法  17-22
    2.1 标本的收集、处理及保存  17-18
    2.2 标本DNA提取  18-19
    2.3 外显子组测序方法  19-20
    2.4 外显子组测序的信息分析流程  20-21
    2.5 SNP 验证策略  21-22
第三章结果  22-28
  1 家系图  22
  2 外显子组测序数据  22-23
  3 SNPs 分析结果  23-25
  4 SNPs 验证结果  25-28
第四章讨论与结论  28-30
  1 讨论  28-29
  2 结论  29-30
参考文献  30-33
附录文献综述泌尿生殖系统单基因病研究进展  33-42
  参考文献  39-42
致谢  42-43
个人简历  43
主要学习经历  43
获奖情况  43-44
参加会议  44-45
文章发表情况  45

家族性隐睾外显子组测序分析

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