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我国主要烟区PVY株系分化研究

作　者: 张帅
导　师: 王凤龙
学　校: 中国农业科学院
专　业: 植物病理学
关键词: 马铃薯Y病毒株系 CP基因基因组全长序列
分类号: S435.72
类　型: 硕士论文
年　份: 2010年
下　载: 69次
引　用: 3次
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内容摘要

采集表现典型马铃薯Y病毒(PVY)病症状的烟叶样品,双抗夹心酶联免疫法(Double Antibody Sandwich Enzyme-linked Immunosorbent Assay,DAS-ELISA)检出51个PVY样品,经枯斑寄主枸杞(Lycium barbarum L.)单斑分离,得到51个纯化的PVY病毒,并保存在枯斑三生烟(Nicotiana tabacum SamSun NN)上。克隆测序后,根据51个PVY分离物CP基因的序列差异,选择4个CP基因序列差异最大的PVY分离物YS-11、HC-2、WA-13、Guiding-3进行PVY基因组全长序列扩增并测序,选择15个代表性的PVY分离物接种7寄主植物。根据CP基因差异所做的51个PVY分离物的亲缘性、同源性,可将51个PVY分离物划分为两个亚种群,根据51个PVY分离物和NCBI数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中登录的PVY株系分离物的亲缘性、同源性,参考Shukla和Ward提出的Potyirus划分标准,将PVY分离物划分为PVYO、PVYN、PVYN:O、PVYNTN四个PVY株系。对HC-2、YS-11、Guiding-3、WA-13全序列测定后,将4个PVY分离物的全长序列和NCBI数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中登录的PVY株系的基因组全序列进行比较,做系统进化树,将PVY分离物HC-2、YS-11、Guiding-3、WA-13分别划分为PVYNTN、PVYN、PVYN、PVYO。根据7种寄主症状的差异,将我国PVY划分为两个株系,坏死株系PVYN(necrosis)、普通株系PVYO(ordinary)。本研究就分子层面划分PVY株系的方法、PVY CP地理性差异的原因应用、PVY株系种群遗传结构进行了探讨,并得出以下结论:1.克隆测序得到51个PVY分离物CP基因序列,PVY CP基因包含801个碱基,编码由267个氨基酸组成的CP蛋白。2.对PVY CP基因和PVY CP蛋白序列分析后,将PVY CP基因划分为突变高频区和突变低频区。3.根据CP基因和CP蛋白差异,我国的PVY分离物可以分为两个亚种群,分别命名PVYO/N:O组和PVYN/NTN组。4.获得4个PVY分离物的全长基因组序列,PVY全长基因组序列包括9699个碱基,整条序列仅包含一个由9186个碱基组成的开放读码框(ORF),编码一条包含3061个氨基酸的多聚蛋白。5.我国主要烟区烟草上PVY株系可划分为PVYNTN、PVYN、PVYO,其中PVYN是优势株系。

我国主要烟区PVY株系分化研究

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