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基于核心家系的MDGA1基因多态性与精神分裂症的关联研究

作　者: 王婧蕾
导　师: 袁也丰
学　校: 南昌大学医学院
专　业: 精神病与精神卫生学
关键词: 精神分裂症 单核苷酸多态性 核心家系 MDGA1 关联研究
分类号: R749.3
类　型: 硕士论文
年　份: 2013年
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内容摘要


一项由Lewis等进行的大型精神分裂症患者全基因组连锁扫描的荟萃分析显示6p22.3-21.1为精神分裂症的连锁区域[1]，MDGA1位于6p21.2，病例-对照研究表明MDGA1基因为精神分裂症易感基因之一。为探讨MDGA1基因是否为中国汉族人群精神分裂症的风险基因，本研究以核心家系为研究对象，分析MDGA1基因多态性与中国汉族精神分裂症患者的关联。研究共选择36个江西汉族精神分裂症核心家系为研究对象，共108例。选取目标基因MDGA1上6个单核苷酸多态性位点（single nucleotide polymorphisms,SNPs）：rs6900617、rs11759115、rs7769372、rs9462341、rs12191311及rs804831。利用多重聚合酶链式反应（Multiplex PCR），多重连接酶检测反应（Multiplexligase detection reaction，Multiplex LDR）技术检测个体基因型。运用拟合优度x2检验检测各位点基因型频数是否符合Hardy-Weinberg平衡，使用家系的关联分析软件（Family BasedAssociatin Test，FBAT）2.0.4版本，进行MDGA1基因多态性与精神分裂症的传递不平衡检验（Transmission disequilibrium test，TDT）和单倍型相对风险检测（haplotype relative risk，HRR）。MDGA1基因上6个SNP位点基因型分别在健康父母组及患病组中进行Hardy-Weinberg平衡检验，患病组中位点rs6900617和rs7769372χ~2分别为6.506和3.992，均显示出统计学差异（P<0.05），即不符合Hardy-Weinberg平衡。除此两位点外，其余四位点及健康父母组各位点均符合Hardy-Weinberg平衡检验；各等位基因及基因型频数分布分析结果得出，rs9462341与女性精神分裂症相关联（χ~2=4.125，df=1，P<0.05）；rs12191311、rs11759115、rs804831及rs9462341四位点进行单个位点TDT检验和HRR分析，结果显示在可加模型，隐性模型下，遗传标记位点rs9462341与精神分裂症关联，等位基因T过多传递，为精神分裂症的危险因素， P值分别为0.015777和0.005960，差异有统计学意义；显性模型下，等位基因A与精神分裂症提示关联（P=0.005960），其对应的Z值为-2.750，等位基因A为精神分裂症的保护因素，位点rs9462341在核心家系中显示出传递不平衡性；而rs12191311、rs11759115及rs804831的TDT检验P值均大于0.05，表明此三位点与精神分裂症无关联。rs12191311-rs11759115-rs804831-rs9462341中的C/T/T/A的单倍型与精神分裂症相关，其P值为0.049861，对应的Z值为-1.961，提示C/T/T/A为精神分裂症的保护因素。其余各单倍型与精神分裂症均未显示出关联（P＞0.05）。结论：1. MDGA1基因rs9462341位点与精神分裂症相关联(P<0.05)，等位基因T过多传递，为精神分裂症的危险因素，等位基因A为精神分裂症的保护因素；2. rs12191311-rs11759115-rs804831-rs9462341组成的C/T/T/A的单倍型与精神分裂症关联(P<0.05)；3. MDGA1基因rs9462341位点与女性精神分裂症相关联。4. MDGA1基因位点rs11759115、rs12191311和rs804831与精神分裂症无关联；5. MDGA1基因可能是中国汉族人群精神分裂症患病基因。

全文目录


摘要  3-5
ABSTRACT  5-9
中英文缩略词表  9-10
第1章 引言  10-17
  1.1 精神分裂症概述  10-11
  1.2 精神分裂症的病因学假说  11-12
    1.2.1 神经递质假说  11
    1.2.2 神经系统发育异常  11-12
  1.3 精神分裂症的流行病学研究  12
  1.4 精神分裂症的分子遗传学研究  12-13
  1.5 关联研究  13-15
  1.6 Hardy-Weinberg 平衡检验  15-17
第2章 实验部分  17-26
  2.1 MDGA1 基因作为候选基因的理论依据  17
  2.2 研究对象  17-18
  2.3 实验材料与仪器设备  18-19
  2.4 技术路线  19
  2.5 基因组 DNA 提取  19-20
  2.6 遗传标记选择  20-21
  2.7 引物、探针设计合成及订购  21-23
  2.8 多重 PCR 扩增目的片段  23
  2.9 LDR 及 3730xl 测序  23-24
  2.10 数据库建立  24-26
    2.10.1 统计分析指标  24
    2.10.2 统计分析方法及软件  24-26
第3章 结果  26-36
  3.1 基因型检测结果  26-28
  3.2 各 SNPs 位点基因型分布和等位基因频率的对比结果  28-31
  3.3 Hardy-Weinberg 平衡的吻合度检验  31-32
  3.4 基因 SNP 位点的等位基因 TDT 和 HRR 分析  32-36
    3.4.1 手工计算进行单位点 TDT 分析  32-33
    3.4.2 FBAT 统计分析软件进行 TDT 和 HRR 分析  33-36
第4章 讨论  36-39
第5章 总结与展望  39-41
  5.1 结论  39
  5.2 展望  39
  5.3 存在的问题和进一步的研究思路  39-41
    5.3.1 存在的问题  39-40
    5.3.2 进一步的研究思路  40-41
致谢  41-42
参考文献  42-46
综述  46-53
  参考文献  50-53

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中图分类: > 医药、卫生 > 神经病学与精神病学 > 精神病学 > 精神分裂症
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