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马尾松响应松材线虫侵染的CaM和CaMBP钙信号转导特征
作 者: 徐亮
导 师: 张星耀
学 校: 北京林业大学
专 业: 森林保护学
关键词: 松材线虫病 马尾松 松材线虫 钙信号转导途径 钙离子 钙调素 钙调素结合蛋白
分类号: S763.7
类 型: 博士论文
年 份: 2013年
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内容摘要
松材线虫病 的学位论文">松材线虫病是由松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)侵染引起、松属树种上最具破坏性的病害之一,目前在全球范围内已造成了严重的经济、生态损失。松材线虫病是多元复杂的病害系统,其致病机理一直存在争议,分析松材线虫侵染后,松树的病理学响应分子机制,是松材线虫致病机理和寄主松树抗病研究难关的重要途径。信号转导是病原-寄主互作的早期事件,Ca2+作为胞内重要的第二信使,在植物防御反应信号转导中具有重要作用。本研究,围绕松树响应松材线虫侵染的钙信号转导特征进行了系列工作。结果如下:建立了马尾松--松材线虫互作研究体系:分离、鉴定了松材线虫虫株,测定了松材线虫致病性,筛选获得强致病力松材线虫虫株NXY61,并测定了松材线虫侵染马尾松幼苗过程中的迁移扩散特征及其时间进程,为研究马尾松响应松材线虫侵染的早期钙信号转导特征奠定了基础。采用非损伤微测技术测定了NXY61接种后,在30min-180min时间序列中,马尾松苗根、茎、叶胞外Ca2+流变化特征。研究发现,马尾松幼苗在钙瞬变和钙振荡特征上均表现出响应松材线虫侵染的特异性特征。钙瞬变特征表现为:松材线虫侵染早期,马尾松苗根茎叶均发生瞬时Ca2+内流;呈现明显Ca2+内流的早晚时间依次为茎(7min)=叶(7min)>根(15min);Ca2+内流最大流速分别为根(3700pmolcm-2s-1)>叶(1300pmolcm-2s-1)>茎(250pmolcm-2s-1); Ca2+内流持续时间则分别为茎(大于48min)>叶(43min)>根(20min)。钙振荡特征表现为:松材线虫侵染,Ca2+内流流速呈现显著变化前,马尾松根茎叶钙振荡振幅和频率无显著变化;而Ca2+内流流速降至平稳期后,尽管钙振荡频率变化不显著,但马尾松茎处振幅却极显著减少,叶部显著增大,并且叶部振幅显著大于茎部。因此,本研究证实了松材线虫侵染早期,马尾松苗胞外Ca2+流变化响应松材线虫侵染,根、茎、叶均出现特异响应松材线虫侵染的钙瞬变和钙振荡特征。基于生物信息学方法,利用马尾松响应松材线虫侵染差减文库(SSH)数据,分析了马尾松响应松材线虫侵染早期的分子特征,及其可能的信号转导特征。通过对马尾松响应松材线虫侵染差减文库(SSH)的144个有效克隆序列的深入分析,发现:松材线虫侵染早期(24h、72h),大量钙相关蛋白基因受诱导表达,包括EFh家族蛋白,钙网蛋白,以及预测的钙调素结合蛋白(CaMBPs)。其中发现的6类CaMBPs,包括防卫响应相关的热激蛋白HSP70.HSP101,病程相关蛋白PR-14,Bcl-2家族蛋白BAG6;解毒和氧化还原相关的乙二醛酶Ⅰ,以及信号传导过程相关的NPG1.此外,本研究同时发现:松材线虫侵染早期,编码受体抗病蛋白RPS2,病程相关蛋白PR-3、PR-4、PR-5、PR-14以及类黄酮类合成相关的CHS等大量防卫相关蛋白基因诱导表达;编码木质素合成相关的蛋氨酸合酶2、PCBER、CAD、 CoMT、CCoAOMT以及dirigen-like等基因均上调表达;而参与H202还原过程的GPX、Cyt_b561_FRRSl_like-containing protein以及活性碳催化还原过程的AER等基因也表达上调。因此,松材线虫侵染早期,马尾松表现出对松材线虫侵染的特异性互作特征,同时发现的大量钙相关蛋白基因诱导表达,暗示了松材线虫-马尾松互作早期,可能经由CaMBPs的一条重要的钙信号转导途径存在,参与调控松树早期的互作反应。马尾松钙调素(CaM)作为Ca2+的主要受体蛋白,在传递Ca2+信号转导过程中发挥了重要作用,它可能经由CaMBPs进行Ca2+信号传递。本研究采用分了克隆技术,克隆了CaM和CaMBPs基因,证实了马尾松中该系列基因的存在,暗示了Ca2+信号经由CaM转导的可能性。基于普通PCR和RACE技术,首次从马尾松上克隆获得CaM基因(pmCaM),以及钙结合蛋白基因pmCBP100、pmCBP153, CaMBP基因(CaMBP)其中,pmCBP100、pmCBP153以及pmCaM隶属EFh家族蛋白,具有直接与Ca2+结合的EFh结构域;而pmCaMBP是一类跨膜蛋白,其钙调素结合结构域(CaMBD)位于该蛋白的543-554氨基酸位置处,三个TPR结构域(428-509,573-673,606-707氨基酸位置处),功能涉及在植物细胞信号转导过程中的蛋白间互作。采用qRT-PCR技术,对松材线虫侵染后,马尾松pmCaM, pmCaMBP表达模式进行测定分析。利用NXY61接种半年生马尾松苗,选择在松材线虫侵染初期(接种后30-180min)的30min、45min、60min、90min、180min五个时间点,以及在松材线虫侵染早期(接种后12h-96h)的12h、24h、48h、72h、96h,测定马尾松根、茎、叶的pmCaM, pmCaMBP响应特征。发现马尾松响应松材线虫侵染,CaM, CaMBP表达产生显著变化,不同器官CaM, CaMBP基因上调或者下调表达的时间点,以及随时间的变化趋势、程度均存在差异,揭示了松材线虫侵染早期,马尾松pmCaM, pmCaMBP的特异的时序表达特征和表达器官的特异性。结合松材线虫侵染后,马尾松钙流特征表现的特异性,认为pmCaM\pmCaMBP参与了马尾松响应松材线虫侵染的钙信号转导。因此,马尾松在响应松材线虫侵染早期,应该存在"Ca2+-CaM-CaMBP"信号转导途径,参与了松树响应松材线虫侵染的早期钙信号传递,及对松树早期抗病防卫反应的调控。
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摘要 4-7 ABSTRACT 7-12 1. 引言 12-24 1.1. 国内外研究现状与评述 13-22 1.1.1. 松材线虫病 的学位论文">松材线虫病发生及其危害情况概述 13-16 1.1.2. Ca~(2+)参与诱导植物细胞程序化死亡的发生 16-18 1.1.3. “Ca~(2+)-CaM-CaMBP”信号通路参与植物抗病反应 18-22 1.2. 研究目标和主要研究内容 22-23 1.2.1. 研究目标 22-23 1.2.2. 主要研究内容 23 1.3. 研究技术路线 23-24 2. 马尾松响应松材线虫侵染的Ca~(2+)流特征及基于SSH文库的Ca~(2+)相关差异基因分析 24-50 2.1. 供试材料 24 2.1.1. 供试苗木 24 2.1.2. 供试苗木响应松材线虫侵染的马尾松SSH文库 24 2.2. 试验方法 24-28 2.2.1. 松材线虫侵染后马尾松的Ca~(2+)流特征 24-28 2.2.2. 基于马尾松响应松材线虫侵染SSH文库的Ca~(2+)相关差异基因分析 28 2.3. 结果与分析 28-43 2.3.1. 供试松材线虫的鉴定和致病性测定 28-36 2.3.2. 松材线虫侵染后马尾松Ca~(2+)流特征 36-38 2.3.3. 基于SSH分析马尾松响应松材线虫侵染的早期分子特征 38-43 2.4. 小结 43-50 3. 马尾松钙调素与钙调素结合蛋白基因克隆及序列分析 50-68 3.1. 实验材料 50 3.2. 实验方法 50-56 3.2.1. 引物合成 50 3.2.2. 总RNA的提取 50-51 3.2.3. cDNA第一链的合成 51-52 3.2.4. RACE扩增 52-53 3.2.5. PCR产物电泳检测及凝胶回收 53-54 3.2.6. PCR纯化产物与pGM-T克隆载体连接、转化 54-55 3.2.7. 菌落PCR检测及测序 55 3.2.8. 序列和生物信息学分析 55-56 3.3. 结果与分析 56-66 3.3.1. 总RNA纯度和完整性检测 56 3.3.2. 钙相关基因的克隆获得 56-59 3.3.3. CBP100蛋白基因序列分析 59-60 3.3.4. CBP153蛋白基因序列分析 60 3.3.5. CaM cDNA克隆获得与序列分析 60-63 3.3.6. CaMBP165 cDNA克隆获得与序列分析 63-66 3.4. 小结 66-68 4. 马尾松响应松材线虫侵染的pmCaM与pmCaMBP表达模式研究 68-84 4.1. 试验材料 68 4.1.1. 试验虫株与供试苗木 68 4.1.2. 试剂与耗材 68 4.2. 试验方法 68-72 4.2.1. 松材线虫过滤 68 4.2.2. 接种与取材 68-69 4.2.3. 完整的RNA获得 69-70 4.2.4. cDNA获得 70 4.2.5. 荧光定量PCR 70-72 4.3. 结果与分析 72-80 4.3.1. 病症和松材线虫迁移检测 72-73 4.3.2. 松材线虫侵染马尾松苗不同时间点,不同器官pmCaM、pmCaMBP、18SrRNA检测 73-75 4.3.3. 半年生马尾松苗不同器官响应松材线虫侵染的pmCaM、pmCaMBP表达模式研究 75-80 4.4. 小结 80-84 5. 总结与展望 84-88 5.1. 总结 84-85 5.2. 创新点 85-86 5.3. 展望 86-88 参考文献 88-96 个人简介 96-97 博士在读期间成果清单 97-98 导师简介 98-99 致谢 99
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中图分类: > 农业科学 > 林业 > 森林保护学 > 森林病虫害及其防治 > 各种树的病虫害及其防治
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