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生物系统三节点酶网络相互作用的适应性研究
作 者: 林彬
导 师: 吴然超
学 校: 安徽大学
专 业: 基础数学
关键词: 酶网络适应性 基因调控网络 三节点酶网络 缓冲负反馈网络 不一致前馈网络
分类号: Q811.4
类 型: 硕士论文
年 份: 2014年
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内容摘要
生物体生活在一个不断变化的环境中,如何适应新的环境是生物体保证自身生存的需要。生物系统对各种反应的适应性是生物系统的一个重要特性。但是对生物体的研究是极其复杂的。对于复杂的生物系统的网络研究,可以通过简化网络节点进行研究。较典型情况可以对三个节点的酶网络进行研究。由于生物系统中的网络之间存在大量的相互作用,本文进一步通过研究这种只有三个连接的三节点酶网络之间的相互作用。研究相互作用后酶网络的适应性变化情况,具体分别对二种情况进行适应性研究:两个相同结构的具有适应性的NFBLB酶网络之间的弱促进以及抑制作用,两个不相同结构的具有适应性的NFBLB酶网络与IFFLP酶网络之间的弱促进以及抑制作用。本文得到相应的适应性结论:对于这两种网络的参数,对于原来比较好的网络,当一个网络对另一个网络弱促进作用时,弱促进作用,适应性仍然存在,且网络是鲁棒的。当一个网络对另一个网络抑制作用时,网络的适应性一般变差。
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全文目录
摘要 3-4 Abstract 4-6 一、绪论 6-10 1.1 系统生物学概述 6-7 1.1.1 系统生物学研究内容 6-7 1.1.2 系统生物学研究方法 7 1.2 系统生物学研究有关热点问题 7-9 1.2.1 生物系统的适应性问题 8-9 1.3 本文研究内容 9-10 1.3.1 研究方法 9 1.3.2 内容安排 9-10 二、生物网络建模以及分析(生物网络的基础知识) 10-17 2.1 中心法则 10-11 2.2 酶反应动力学 11-15 2.2.1 质量作用定律 11-12 2.2.2 Michaelis-Menten方程 12-15 2.2.3 同位协同和Hill方程 15 2.3 分叉分析简介 15-17 三、生物调控网络的适应性研究 17-30 3.1 生物调控网络的适应性研究的意义 17 3.2 三节点酶网络相互作用的适应性分析 17-29 3.2.1 相关概念 18-19 3.2.2 三节点网络相互作用的适应性分析 19-29 3.3 结论 29-30 四、总结和展望 30-32 4.1 本文的工作总结和主要创新 30 4.2 研究展望 30-32 参考文献 32-34 致谢 34-35 攻读学位期间发表的学术论文 35
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中图分类: > 生物科学 > 生物工程学(生物技术) > 仿生学 > 生物信息论
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