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水稻第6染色体短臂株高及产量性状QTL的分解

作 者: 占小登
导 师: 庄杰云
学 校: 杭州师范大学
专 业: 遗传学
关键词: 水稻 产量及株高性状 数量性状基因座 剩余杂合体
分类号: S511
类 型: 硕士论文
年 份: 2007年
下 载: 9次
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内容摘要


本研究针对水稻第6染色体短臂上一个对产量性状遗传控制重要作用的区间,从珍汕97B/密阳46重组自交系群体中筛选剩余杂合体材料,利用其衍生群体进一步分解目标区间中控制产量性状和株高的数量性状座位(QTL,quantitative trai locus)。首先,应用第6染色体短臂目标区间的6个多态性SSR标记经行前景选择,同时利用18个多态性SSR标记进行初步的背景筛选,筛选到1个在第6染色体短臂RM587-RM402区间杂合、在其它区间纯合的单株,即剩余杂合体;然后,增加第6染色体短臂上的多态性标记28个、其它区间的多态性标记50个,进一步检测该单株。结果发现,该单株在目标区间RM587-RM19784(约7.3Mb)的27个标记座位上杂合,在第6染色体的其它区间纯合。此外,该单株还在第3染色体短臂约1.4Mb、第5染色体中心粒两侧约8.4Mb和第10染色体中心粒两侧约4.4Mb的区间呈杂合基因型,但同一组合前期研究显示这些区间对珍汕97B/密阳46衍生群体产量性状变异的作用不大。利用该单株衍生了一个由195个株系组成的的F2±3群体。种植于海南和浙江两地,考察每株穗数、每穗实粒数、每穗总粒数、千粒重、结实率、单株产量和株高,建立SSR标记连锁图,应用Windows QTL Cartographer2.5检测QTL,分解水稻第6染色体短臂上控制株高和产量性状的QTL。通过完整群体和分离群体分析,对第6染色体短臂上的产量及株高QTL进行了进一步分解,在第6染色体的目标区间较小的范围内定位了2个以上的产量性状QTL,进一步缩小了控制产量性状QTL的区间,分解了控制产量性状的QTL,为产量性状QTL的进一步定位和克隆打下了基础。比较不同的性状发现,目标区间顶部RM587-RM585之间的区域对除单株穗数以外的性状都具显著作用,且其最高LOD值的区间几乎完全一致;类似地,底部介于标记RM549-RM19715之间的区域对每穗实粒数、每穗总粒数、结实率、千粒重、单株产量和株高也都具显著作用,最高LOD值的位置亦基本一致。

全文目录


摘要  4-6
Abstract  6-10
绪言  10-11
第一章 文献综述  11-28
  1.1 QTL定位常用的几种分子标记  11-15
    1.1.1 限制性片段长度多态性标记  12
    1.1.2 扩增片断长度多态性标记  12-13
    1.1.3 简单序列长度多态性标记  13-14
    1.1.4 序列标记位点和酶切扩增多态性序列标记  14
    1.1.5 单核苷酸多态性和插入缺失标记  14-15
  1.2 植物QTL定位研究的基本思路  15-20
    1.2.1 QTL定位的原理  15-16
    1.2.2 分子标记连锁图谱构建  16
    1.2.3 QTL分析的方法  16-17
    1.2.4 影响QTL作图的主要因素  17
    1.2.5 QTL定位常用群体类型  17-20
  1.3 作物QTL定位的发展  20-21
    1.3.1 QTL初级定位  20
    1.3.2 QTL精细定位  20-21
  1.4 水稻产量相关性状QTL的定位进展  21-26
    1.4.1 水稻产量性状的遗传特点  21-22
    1.4.2 水稻产量相关性状QTL的定位  22-23
    1.4.3 水稻产量相关性状的精细定位与克隆  23-25
    1.4.4 作物产量性状QTL研究与分子育种  25-26
  1.5 本研究的目的和意义  26-28
第二章 水稻第6染色体短臂株高及产量性状QTL的分解  28-42
  2.1 材料和方法  28-33
    2.1.1 RHL群体的构建和性状考察  28-30
    2.1.2 DNA提取  30-31
    2.1.3 分子标记的筛选和基因型鉴定  31-33
    2.1.4 图谱构建、QTL分析和数据处理  33
  2.2 结果与分析  33-42
    2.2.1 RHL衍生群体的构建  33-34
    2.2.2 性状表现  34-36
    2.2.3 连锁图谱的构建  36-37
    2.2.4 利用完整群体进行的QTL定位  37-40
    2.2.5 利用交换群体进行的QTL定位  40-42
第三章 结论与讨论  42-48
  3.1 结论  42
  3.2 讨论  42-46
    3.2.1 RHL衍生群体在QTL精细定位中的应用  42-43
    3.2.2 完整群体和交换群体定位结果的比较  43-44
    3.2.3 QTL的一因多效和基因连锁性  44-45
    3.2.4 株高与产量QTL间的关系  45
    3.2.5 水稻产量性状的QTL的分子标记辅助育种应用  45-46
  3.3 展望  46-48
致谢  48-49
参考文献  49-58
附录1:攻读硕士期间参与发表的论文  58-59
附录2:英文缩略词表  59-60
附录3:溶液配方  60-61

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