学位论文 > 优秀研究生学位论文题录展示

高加索人群银屑病易感位点与中国汉族人寻常型银屑病相关性研究

作　者: 潘倩
导　师: 张安平
学　校: 安徽医科大学
专　业: 皮肤病与性病学
关键词: 银屑病 STAT2基因 TYK2基因 REL基因 YTJC基因
分类号: R758.63
类　型: 硕士论文
年　份: 2013年
下　载: 5次
引　用: 0次
阅　读: 论文下载

内容摘要

研究背景银屑病（psoriasis, OMIM#177900）是一种常见的慢性复发性炎症性皮肤病，影响了全球1%～3%的人口，具有明显的遗传异质性和种族差异性。在汉族人群中银屑病的发病率约为0.123％，且以寻常型最多见（占患者总数的90％以上）。银屑病的发病机制尚未完全明确，目前多认为该病由遗传、环境及自身免疫性因素共同作用致病。近年来，随着全基因组关联研究（GWAS）的开展，人们对银屑病易感基因的探索也不断深入，发现了很多与银屑病发病相关的易感位点，包括MHC区域, IL12B, IL23A, IL23R, TNFAIP3, IL-13/IL-4, TNIP1, LCE基因簇,TRAF3IP2, ERAP1, PTTG1, CSMD1, GJB2, SERP1NB8, ZNF816A, NOS2, FBXL19,NFKBIA, IL28RA, REL, IFIH1和TYK2等。最近欧洲人群的几项GWAS研究发现，STAT2, TYK2, YDJC, REL, ZMIZ1和PRDX5基因与银屑病发病具有相关性，但其与汉族人群银屑病的相关性研究目前国内外尚未见报道。目的1.通过对欧洲人群银屑病易感基因在中国汉族人群中进行基因分型，探寻报道的欧洲人群6个银屑病易感基因：REL, STAT2, TYK2, YTJC, ZMIZ1和PRDX5与中国汉族人群寻常型银屑病易感性的关联结果；2.依据获得的基因分型数据，运用基因型-表型分析法，寻找基因型与银屑病临床亚型之间的关联性。方法选择2208例汉族人银屑病病例和2208例种族、地域、性别、年龄等基本匹配的正常对照，应用Sequenom MassArrayTM质谱阵列技术对欧洲人群报道的银屑病易感SNP进行基因分型，运用PLINK1.07统计软件对每一个SNP在病例和对照中的等位基因及基因型的分型结果进行统计学分析，并针对汉族人银屑病的临床亚型（以发病年龄、有无家族史和是否伴发心血管疾病分类），对其易感的SNP关联结果进行分层分析。结果1.在选择的6个SNP中，有两个SNPs：rs1250544（ZMIZ1）和rs694739（PRDX5）未达到Hardy–Weinberg平衡（P值分别为，P-hwe=4.14×10-17和P-hwe=8.87×10-4）。2.等位基因分析：⑴病例组与对照组相比，SNP rs2066808（P等位基因=2.23×10-4）和SNP rs280519（P等位基因=0.017）等位基因分布频率有统计学差异，而SNPs rs181359（P等位基因=0.075）和rs702873（P等位基因=0.633）等位基因频率二组间差异无统计学意义。⑵以发病年龄分层：Ⅰ型银屑病组和II型银屑病组分别与对照组相比较，rs2066808等位基因分布频率均显示统计学差异（前者P等位基因=4.59×10-3，后者P等位基因=1.39×10-3）；rs280519等位基因分布频率仅在I型银屑病组与对照组间存在统计学差异（P等位基因=6.05×10-3），而II型银屑病组与对照组间无统计学差异（P等位基因=0.605）。⑶以家族史分层：无家族史患者组与对照组相比，rs2066808（P等位基因=5.36×10-4）和rs280519（P等位基因=0.021）等位基因分布频率在两组间均有统计学差异；而有家族史患者组与对照组比较，此二个SNP病例与对照组间均无统计学差异（前者P等位基因=0.06，后者P等位基因=0.26）⑷以伴发疾病分层：无伴发疾病组与对照组相比，rs2066808（P等位基因=6.30×10-5）和rs280519（P等位基因=0.015）等位基因分布频率在两组间均有统计学差异；而伴发心血管疾病组与对照组相比，此二个SNP病例与对照组间均无统计学差异（前者P等位基因=0.728；后者P等位基因=0.636）。3.基因型分析：⑴SNP rs2066808（P3基因型=1.0×10-）和SNP rs280519（P基因型=0.012）基因型分布频率在病例组与对照组之间均有统计学差异。⑵以发病年龄分层：rs2066808基因型分布频率在Ⅰ型银屑病组（P基因型=0.016）和II型银屑病组（P基因型=6.0×10-3）与对照组之间均显示统计学差异；rs280519基因型分布频率仅在I型银屑病组与对照组间存在统计学差异（P基因型=3.0×10-3），而II型银屑病组与对照组间无统计学差异（P基因型=0.834）。⑶以家族史分层：无家族史患者组与对照组相比，rs2066808（P基因型=2.0×10-3）和rs280519（P基因型=0.032）基因型分布频率在两组间均有统计学差异；而有家族史患者组与对照组比较，结果无统计学差异（前者P基因型=0.213，后者P基因型=0.059）。⑷以伴发疾病分层：无伴发疾病组与对照组相比，rs2066808和rs280519基因型分布频率在两组间均有统计学差异（前者P基因型=2.0×10-4；后者P基因型=0.023）；而伴发心血管疾病组与对照组相比，此二个SNP病例与对照组间均无统计学差异（前者P基因型=1.00；后者P基因型=0.659）。结论1. STAT2基因上的SNP rs2066808和TYK2基因上的SNP rs280519与汉族人寻常型银屑病具有相关性，而REL基因上的SNP rs702873和YTJC基因上的SNPrs181359与汉族人寻常型银屑病无显著相关性。2. TYK2与I型银屑病发病相关而与II型银屑病发病无显著相关性，并且STAT2和TYK2与有家族史和伴发心血管疾病患者均无显著相关性。

全文目录

目录  4-6
英文缩写词表  6-7
中文摘要  7-10
Abstract  10-13
1. 引言  13-15
2. 实验材料与方法  15-29
  2.1 研究对象  15
  2.2 实验试剂  15-17
    2.2.1 DNA 提取试剂  15-16
    2.2.2 电泳试剂  16
    2.2.3 DNA 标准化试剂  16
    2.2.4 基因分型试剂  16-17
  2.3 实验仪器  17-19
    2.3.1 DNA 提取器材  17
    2.3.2 电泳仪器  17-18
    2.3.3 DNA 标准化仪器  18
    2.3.4 基因分型仪器  18-19
  2.4 分析软件和电子数据库查询信息  19
  2.5 实验方法和步骤  19-29
    2.5.1 基因组 DNA 的制备  19-20
    2.5.2 引物设计及合成  20-23
    2.5.3 基因分型  23-28
    2.5.4 用 PLINK1.03 软件进行统计分析  28-29
3. 结果  29-38
  3.1 研究对象一般情况  29-30
  3.2 等位基因及等位基因-表型分析结果  30-36
    3.2.1 RS2066808 等位基因及等位基因-表型分析结果  30-31
    3.2.2 RS280519 等位基因及等位基因-表型分析结果  31-36
  3.3 基因型与基因型-表型分析结果  36-38
    3.3.1 RS2066808 基因型与表型分析结果  36-37
    3.3.2 RS280519 基因型与表型分析结果  37-38
4. 讨论  38-40
5. 结论  40
6. 参考文献  40-44
附录  44-45
致谢  45-47
课题综述  47-58
  参考文献  53-58

高加索人群银屑病易感位点与中国汉族人寻常型银屑病相关性研究

内容摘要

全文目录

相似论文