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三个马品种的STR群体遗传分析

作　者: 李智军
导　师: 姚新奎
学　校: 新疆农业大学
专　业: 动物学
关键词: 微卫星柯尔克孜马俄罗斯速步马纯血马等位基因基因型
分类号: S821
类　型: 硕士论文
年　份: 2013年
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内容摘要

本试验选取3个马匹品种（柯尔克孜马、俄罗斯速步马、纯血马），对其11个微卫星DNA座位AHT4、ASB2、HMS3、HMS7、HTG4、LEX3、LEX074、UM002、UM011、UMNE191、VHL20进行多态性分析，利用spass分析软件，对3个马品种进行初步鉴别。以柯尔克孜马、俄罗斯速步马、纯血马为实验对象，分别采集血样10ml，枸橼酸钠抗凝，实验室中对所选取的11个微卫星DNA座位进行非变性丙烯酰胺电泳（PAGE）检测，用Popgene32分析数据。比较品种间有效等位基因数（Ne）、基因杂合度（He）及多态信息含量（PIC）数值差异，辅以各品种的特有的基因型条带对三个马品种进行群体遗传分析。11个微卫星标记中筛选出的部分标记，其有效等位基因数（Ne）、基因杂合度（He）及多态信息含量（PIC）数值在3个马品种间存在显著差异或极显著差异，成为初步鉴别三个马品种的重要依据；对11个微卫星标记进行非变性丙烯酰胺电泳（PAGE）检测，发现ASB2微卫星标记的基因型中，柯尔克孜马所特有基因型为CC、CD、EG、EH基因型，纯血马所特有的基因型为BI、JJ、KK基因型；VHL20微卫星标记的等位基因型中，俄罗斯速步马所特有的基因型为CC、CI基因型；AHT4微卫星标记的等位基因型中，柯尔克孜马所特有的基因型为DF、EF、GG基因型，纯血马所特有的基因型为BC基因型；HMS3微卫星标记的等位基因型中，纯血马所特有的基因型为CC基因型；HMS7微卫星标记的等位基因型中，纯血马所特有的基因型为AA基因型；HTG4微卫星标记的等位基因型中，俄罗斯速步马所特有的基因型为BC、BD基因型；UM002微卫星标记的等位基因型中，纯血马所特有的基因型为AA基因型；UM011微卫星标记的等位基因型中，俄罗斯速步马所特有的基因型为AG基因型；LEX074微卫星标记的等位基因型中，纯血马所特有的基因型为CG基因型。品种间相同微卫星标记的基因型、等位基因频数也存在极显著差异（P＜0.01），成为群体遗传分析的另一重要依据。发现3个马品种的鉴别可以通过筛选出的微卫星位点的有效等位基因数（Ne），以及所选微卫星标记的等位基因、基因型频数分布，辅以各品种特异的基因型电泳条带，从而达到群体遗传分析的目的。

全文目录

摘要  4-5
Abstract  5-7
第1章综述  7-23
  1.1 中国马业现状  7
  1.2 新疆马产业现状  7-8
  1.3 新疆地方马品种简介  8-12
  1.4 如何高效利用地方品种  12-16
  1.5 品种分类及鉴别方法研究  16-17
  1.6 标记辅助选择技术进行遗传资源的保护  17-19
  1.7 中国遗传资源现状概况  19-20
  1.8 马种质资源多样性研究进展  20-22
  1.9 本研究的目的和意义  22-23
第2章材料和方法  23-32
  2.1 试验材料  23-25
  2.2 试验方法  25-30
  2.3 统计分析  30-32
第3章结果与分析  32-48
  3.1 基因组 DNA 提取结果  32
  3.2 PCR 扩增产物检测  32-37
  3.3 遗传参数的计算  37-45
  3.4 微卫星标记遗传参数与品种的差异分析  45-48
第4章讨论  48-52
  4.1 试验样本采集  48
  4.2 微卫星标记的选择  48
  4.3 遗传参数分析  48-50
  4.4 品种鉴别  50-52
第5章结论  52-53
参考文献  53-56
致谢  56-57
作者简介  57

三个马品种的STR群体遗传分析

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