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拟南芥类糖苷水解酶基因AtGHL的功能研究
作 者: 岳智亮
导 师: 潘延云
学 校: 河北农业大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: 拟南芥(Arabidopsis thaliana) 糖苷水解酶(GH) 糖饥饿 雄蕊
分类号: Q943
类 型: 硕士论文
年 份: 2012年
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内容摘要
作为生物体四大有机分子之一,糖的代谢是整个生物代谢的中心。它既是植物的生长发育过程中重要的结构组分,又是一种细胞间用于通讯的信号分子。糖类的代谢主要包括合成、修饰、分解等过程,参与这些过程的酶根据功能不同各司其职。如糖类的合成需要糖基转移酶(glycosyl transferases);糖类的修饰需要糖脂酶(carbohydrate esterases);分解则需要糖苷水解酶和多糖裂解酶(glycoside hydrolases and polysaccharide lyases)等。糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)亦称为糖苷酶,是作用于各种糖苷或寡糖使糖苷键水解的酶类总称。根据氨基酸序列,可以将糖苷水解酶划分为130个家族(GHs),但是至今仍有很多基因没有被分到任何一个家族中。拟南芥基因组中已鉴定出401个糖苷水解酶基因,分别属于35个不同家族。糖苷水解酶作为糖类代谢的关键组分,其生物学功能得到了广泛的研究。本文利用反向遗传学,借助遗传转化和RT-PCR等生化和分子生物学手段,研究了拟南芥中两个新的类糖苷酶基因AtGHL1和AtGHL2的生物学功能。研究发现:1.通过生物信息学分析,AtGHL1和AtGHL2两个基因的核苷酸及氨基酸序列同源性达90%以上,其编码蛋白均有糖苷酶特有的DUF1680复合结构域和类6-发卡糖苷酶,但这两个基因没有被归属到目前分类的任何糖苷酶家族中,为两个新型的类糖苷水解酶。2.通过PCR鉴定及RT-PCR检测,分别获得了AtGHL1和AtGHL2的基因缺失突变体ghl1和ghl2;通过RNAi载体的构建及遗传转化,获得两个基因表达均下调的转基因植株ghli。表型检测发现,各突变体均存在雄蕊缺失的现象,表明AtGHL基因可能参与了雄蕊发育的过程。3.根据拟南芥遗传转化株中报告基因GUS和YFP的表达,发现这两个基因主要在幼苗、莲座叶及花等器官的输导组织中表达。亚细胞定位结果显示,AtGHL定位于细胞壁。4.通过糖饥饿胁迫及RT-PCR检测,发现AtGHL基因转录受糖饥饿的诱导。在不含蔗糖的MS培养基中,突变体ghl1和ghli幼苗生长受到严重影响,存活率仅为20%。
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全文目录
摘要 4-5 Abstract 5-10 1 引言 10-14 1.1 糖苷水解酶的化学性质及分类 10-11 1.2 糖苷水解酶的生理功能 11-13 1.3 本试验的研究目的和意义 13-14 2 材料与方法 14-24 2.1 试验材料 14-15 2.1.1 植物材料 14 2.1.2 仪器设备 14-15 2.1.3 试剂和工具酶 15 2.1.4 培养基配方 15 2.1.5 引物合成 15 2.2 试验方法 15-24 2.2.1 拟南芥两种AtGHL 基因的生物信息学分析 15 2.2.2 拟南芥的种植 15 2.2.3 拟南芥 ghl1 与 ghl2 突变纯合体的鉴定 15-16 2.2.4 RT-PCR 半定量检测 16-17 2.2.5 AtGHL1 与AtGHL2 启动子及cDNA 的扩增与载体构建 17-21 2.2.6 RNAi 载体构建 21 2.2.7 拟南芥的遗传转化 21-22 2.2.8 转基因植株的GUS 染色 22 2.2.9 基因枪转化洋葱表皮 22-23 2.2.10 糖饥饿条件下拟南芥AtGHL 基因的表达分析 23-24 3 结果与分析 24-35 3.1 拟南芥两种AtGHL 基因的生物信息学分析 24-25 3.2 ghl1 和 ghl2 突变纯合体的 PCR 鉴定 25-26 3.3 载体构建及拟南芥的遗传转化 26-30 3.3.1 定位表达载体的构建 26-27 3.3.2 RNAi 表达载体的构建 27-28 3.3.3 拟南芥的遗传转化 28-30 3.4 AtGHL1 和AtGHL2 基因的组织定位及亚细胞定位 30-31 3.4.1 AtGHL1 和AtGHL2 基因的组织定位 30-31 3.4.2 AtGHL1 和AtGHL2 基因的亚细胞定位 31 3.5 各突变体植株雄蕊的表型观察 31-33 3.6 AtGHL1 和AtGHL2 基因受糖饥饿诱导 33-35 3.6.1 糖饥饿条件下转基因植株的GUS 染色 33 3.6.2 糖饥饿条件下AtGHL1 和AtGHL2 基因RT-PCR 半定量检测 33-34 3.6.3 糖饥饿条件下幼苗的表型观察 34-35 4 讨论 35-38 4.1 拟南芥AtGHL 基因功能研究策略 35 4.2 AtGHL 为新型的类糖苷水解酶 35-36 4.3 AtGHL 基因参与雄蕊的发育 36 4.4 AtGHL 为糖饥饿诱导基因 36-38 5 结论 38-39 参考文献 39-45 在读期间发表的学术论文 45-46 作者简历 46-47 致谢 47-48
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中图分类: > 生物科学 > 植物学 > 植物细胞遗传学
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