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小麦黄花叶病毒侵染性cDNA克隆及细胞侵染体系的建立
作 者: 董家红
导 师: 于嘉林
学 校: 中国农业大学
专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: 小麦黄花叶病毒 全长cDNA克隆 体外转录 侵染体系 瞬时表达载体
分类号: S435.12
类 型: 博士论文
年 份: 2004年
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内容摘要
在中国,由小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus, WYMV)引起的小麦黄花叶病已严重的危害了小麦的生产。可是,由于寄主植物小麦遗传背景复杂,寄主范围狭窄,机械接种困难,体外病毒粒子不稳定,病毒RNA容易降解等因素,给小麦黄花叶病毒的研究带来了极大的困难。为了对小麦黄色花叶病毒进行深入地分子生物学研究,从细胞及分子水平上认识植物病毒的侵染和复制机制,本研究试图建立一个适于WYMV侵染的室内活体细胞侵染系统,包括病毒侵染性cDNA克隆的构建、烟草原生质体和小麦细胞体系的培养,以及体外转录物的接种和相关的检测技术。该体系的建立为研究其它植物病毒奠定技术基础。 本研究首先利用5′RACE方法确认了WYMV-HC基因组的5′端的未知序列,其中RNA1的5′末端多出了15nt(5′-AAAATAAAACCACCA-3′),RNA2的5′末端则多出了12nt(5′-AAAATAAAACCA-3′)。利用根据末端序列设计的引物,构建了T7启动子驱动下的病毒基因组的全长cDNA克隆。体外转录结果表明所获得的cDNA克隆可以产生相应的WYMV RNAs。用电击穿孔法将体外转录的WYMV RNAs接种于小麦品种鄂恩1号(Triticum aestivum L EEn. No.1)的愈伤组织和烟草悬浮细胞系BY-2的原生质体内,摸索建立了适用于WYMV病毒颗粒及体外转录RNA侵染植物细胞的侵染体系。对被接种细胞进行的Western blot和Northern blot检测结果表明,体外合成的WYMV RNAs可以在烟草细胞系BY-2和小麦细胞内复制、表达,即本研究所构建的WYMV cDNA克隆具有侵染活性。进一步实验还证明RNA1的5′末端序列(无论是日本分离物5′末端序列还是潢川分离物的末端序列,或者是额外加的一个G对都不影响侵染性)及3′末端poly(A)尾长短(带有26个A和4个A)对WYMV体外转录物的侵染活性也没有明显的影响。在此基础上,进一步完善了该侵染体系。 另外,本研究还利用这一侵染体系对WYMV RNA2编码的P1蛋白的功能进行了初步研究。通过构建在pSKCaasSK上的GFP与P1融合基因(包括N端和C端)的瞬时表达载体,用电穿孔法转入细胞(烟草原生质体或小麦细胞),用荧光显微镜观察发现在烟草原生质体内集中在细胞核内发光,而在小麦愈伤细胞内,荧光集中在细胞质内、细胞膜与细胞壁上。分析可能是因为小麦是病毒的天然寄主,所以在小麦细胞内,由于某些因子的存在,P1表现其在天然寄主内的功能,而在非天然寄主烟草细胞内,可能是因为缺乏某些与P1蛋白互作的因子,P1表现异常的定位功能,说明P1的功能与寄主有关,或者说是有寄主专一性的。相对于农杆菌注射法接种单独的GFP于基因烟草16C能引起转最后基因沉默,注射构建在pBIN35S-nos上的GFP与P1融合基因的瞬时表达载体接种转基因烟草16C却能用长波紫外灯观察到更强的荧光表达,初步分析认为,P1蛋白基因可能干扰了转录后基因沉默。
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全文目录
第一章 文献综述 9-29 1.1 小麦黄花叶病毒的研究进展 9-18 1.1.1 生物学特性 9-10 1.1.2 分子生物学特性 10-16 1.1.3 大麦黄花叶病毒属(Bymovirus)病毒的特性 16-18 1.2 植物RNA病毒的侵染性cDNA克隆 18-21 1.2.1 侵染性cDNA克隆的构建 18 1.2.2 侵染性cDNA克隆的类型 18-19 1.2.3 影响侵染性cDNA克隆生物活性的因素 19-21 1.3 植物细胞系在分子植物病毒学研究中的应用 21-26 1.3.1 植物组织细胞的培养 21 1.3.2 原生质体的分离 21-23 1.3.3 病毒及病毒RNA对植物细胞和原生质体的侵染 23-26 1.4 GFP在植物病毒研究上的应用 26-28 1.4.1 绿色荧光蛋白 26 1.4.2 应用绿色荧光蛋白研究病毒的运动 26-28 1.5 研究的目的和意义 28-29 第二章 小麦黄花叶病毒侵染性cDNA克隆及细胞侵染体系的建立 29-61 2.1 材料 29-31 2.1.1 毒源和血清 29 2.1.2 菌株、载体和质粒 29 2.1.3 酶和化学试剂 29-30 2.1.4 引物 30 2.1.5 细胞 30 2.1.6 培养基和缓冲液的配制 30-31 2.1.7 仪器设备 31 2.2 方法 31-35 2.2.1 大肠杆菌感受态细胞的制备和转化 31-32 2.2.2 重组质粒的快速鉴定(Cracking) 32 2.2.3 质粒DNA的小量提取 32 2.2.4 质粒DNA的大量提取 32 2.2.5 DNA片段的回收纯化 32-33 2.2.6 质粒的酶切和连接方法 33 2.2.7 PCR反应体系 33 2.2.8 反转录反应体系 33-34 2.2.9 体外转录反应体系 34 2.2.10 植物总RNA的提取 34 2.2.11 小麦黄花叶病毒提取及纯化 34-35 2.2.12 病毒RNA提取 35 2.3 侵染性全长cDNA克隆的构建 35-39 2.3.1 5′RACE-PCR(Rapid amplification of cDNA End) 35 2.3.2 T7启动子控制下的全长克隆的构建 35-39 2.4 细胞组织培养技术 39-40 2.4.1 小麦愈伤组织的培养和胚性细胞系的建立 39 2.4.2 烟草细胞的悬浮培养及原生质体的分离 39-40 2.5 转染 40-42 2.5.1 小麦细胞的质壁分离转化 40-41 2.5.2 BY-2烟草原生质体的电击转化 41-42 2.6 体外转录物接种后的表达检测 42-44 2.6.1 SDS-PAGE和WesternBlotting检测 42-43 2.6.2 Northernblot检测 43-44 2.7 结果与分析 44-56 2.7.1 5′RACE结果 44-46 2.7.2 T7启动子控制下的全长cDNA克隆的构建 46-50 2.7.3 体外转录物对BY-2烟草原生质体和小麦细胞的侵染 50-56 2.8 讨论 56-61 2.8.1 侵染性克隆的构建 56-57 2.8.2 侵染体系的建立 57-61 第三章 小麦黄花叶病毒编码的P1蛋白功能的探索性研究 61-76 3.1 材料 61-62 3.1.1 引物 61-62 3.1.2 菌株和植物材料 62 3.1.3 质粒 62 3.1.4 仪器设备 62 3.2 瞬时表达载体的构建 62-68 3.2.1 pSK76-GFP及pBIN76-GFP的构建 62-64 3.2.2 pSKP1-GFP及pBINP1-GFP的构建 64-65 3.2.3 pSKGFP-P1及pBINGFP-P1的构建 65-67 3.2.4 突变体的构建 67-68 3.3 电击转化 68 3.4 农杆菌注射 68 3.4.1 农杆菌感受态细胞的制备 68 3.4.2 植物表达载体向农杆菌感受态细胞的转化 68 3.4.3 Agro-infiltration方法接种本生烟 68 3.5 GFP荧光观察 68-69 3.6 结果与分析 69-74 3.6.1 瞬时表达载体的构建 69-71 3.6.2 荧光观察 71-74 3.6.3 农杆菌注射接种观察结果 74 3.7 讨论 74-76 结论与设想 76-77 参考文献 77-88 致谢 88-89 附录Ⅰ GENE PULSERⅡ使用方法 89-92 附Ⅰ.1 E.coli转化 89-90 附Ⅰ.2 附件为CAPACITANCE EXTENDERⅡ(用来电击细胞) 90-91 附Ⅰ.3 注意事项 91-92 附录Ⅱ Tris-苷氨酸SDS-不连续系统不同浓度凝胶配制用量表 92-93 附录Ⅲ 实验中部分克隆在M13测序引物间的序列 93-94 附录Ⅳ P1蛋白与HC-Pro蛋白氨基酸序列的比较 94-95 附录Ⅴ 缩略词 95-96 作者简历 96
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中图分类: > 农业科学 > 植物保护 > 病虫害及其防治 > 农作物病虫害及其防治 > 禾谷类作物病虫害 > 麦类病虫害
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